导读:本文包含了病毒基因型分析论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:手足口病,柯萨奇病毒A10,VP1区
病毒基因型分析论文文献综述
廖琳虹,杨萍,张彦锋,曹春远,何云[1]（2019）在《2014年龙岩市手足口病患者CVA10病毒基因特征分析》一文中研究指出目的了解2014年龙岩市手足口病病例中分离到的CVA10病毒VP1区基因特征。方法 2014年共收集221份采用实时荧光RT-PCR法判定为其他EV的HFMD患者样本,经RD细胞分离培养后,再次进行特异性核酸检测。通过引物486-489进行肠道病毒A组完整的VP1序列分段扩增,采用ClustalX2、Mega6.0进行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和构建进化树。结果通过测序获得3株CVA10完整的VP1区基因序列,通过分析计算,LY2014116与LY2014163氨基酸相似性为100%,3株分离株与原型株Kowalik(AF081300)的核苷酸(nt)同源性均为76%,氨基酸(aa)同源性为89%-90%。结论 3株分离株均位于进化树D亚型的同一分支上,与国内其他地方分离的D亚型流行株亲缘关系较近,与俄罗斯、法国等地分离的病毒差异较大。(本文来源于《河南预防医学杂志》期刊2019年11期）
许晶,史伟,张蕾,李慎,郑媛[2]（2019）在《2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒基因特征分析》一文中研究指出目的了解陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况。方法选取2017-2018年度分离的6株甲型H1N1流感毒株进行全基因测序,利用生物信息学软件对分离株的HA和NA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/Michigan/45/2015进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建基因进化树,进行系统进化分析。结果陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒阳性占比36.85%,流行高峰为2017年12月和2018年1月。6株甲型H1N1流感病毒测序得到的HA、NA序列与疫苗株比对,分别有12、11个氨基酸位点发生变异,其中HA有7个位点变异发生在抗原决定簇,受体结合位点、潜在糖基化位点比较稳定;NA序列没有发现耐药位点变异。结论 2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒为优势流行株。目前甲型H1N1流感病毒与WHO推荐的新疫苗株高度同源。(本文来源于《现代预防医学》期刊2019年20期）
缪礼锋,沈月兰,苏斌,程晓莉,吴建军[3]（2019）在《安徽省485例抗病毒治疗失败艾滋病患者耐药基因型分析》一文中研究指出目的研究接受高效抗反转录病毒治疗失败的艾滋病患者体内病毒的耐药突变位点,为及时调整药物治疗方案提供依据。方法以安徽省2014年收集的487例病毒载量>1 000 copies/ml的在治患者标本为研究对象,应用巢式反转录PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增HIV-1聚合酶(pol)基因区,经DNA测序后与国际耐药数据库比对,确定HIV-1基因亚型,分析耐药突变位点。结果成功获得pol区序列485条,以B亚型为主,有313例(64.5%),其次是CRF01_AE亚型116例(23.9%);突变率排在前叁位的蛋白酶抑制剂(PIs)耐药基因突变分别是A71T(30.4%)、A71V(24.1%)、L10I(10.7%);突变率排在前叁位的核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)耐药相关基因分别是M184V(31.1%)、T215Y(5.2%)和M41L(4.4%);突变率排在前叁位的非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药相关基因分别是K103N(14.8%)、Y181C(8.9%)和G190A(6.1%)。结论安徽省治疗人群仍以B亚型为主;发生了针对PIs、NRTIs和NNRTIs的不同耐药突变株,了解耐药位点特征对预防和控制耐药株发生有重要意义。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2019年19期）
刘李,徐朝花,谢应国,邓绪东,何吉兰[4]（2019）在《四川省首例输入性D8基因型麻疹病毒基因特征分析》一文中研究指出目的对四川省1例输入性麻疹病例的病毒株进行基因特征分析。方法采用Vero/SLAM细胞分离培养麻疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹病毒N基因羧基末端634个核苷酸片段,并对PCR产物进行序列测定和同源性分析。结果该麻疹病毒分离株与世界卫生组织(WHO)D8基因型参考株在基因亲缘性关系树上同属1个分支,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%和98.0%。结论该病例为四川省首例输入性D8基因型麻疹病例。(本文来源于《中国病毒病杂志》期刊2019年05期）
王猛,陈莉,靳旺杰,孙朋辉,王莎莎[5]（2019）在《Ⅰ型脊髓灰质炎病毒基因密码子使用偏好性分析》一文中研究指出目的分析Ⅰ型脊髓灰质炎病毒(简称脊灰病毒)基因密码子使用偏好性。方法从NCBI基因数据库(GenBank)检索并筛选出40条Ⅰ型脊灰病毒株的基因信息,计算其相对同义密码子使用度(RSCU)值、有效密码子数(ENc)值。将Ⅰ型脊灰病毒基因中碱基C和G位于第叁位的密码子占所有密码子的百分比[(C+G)_3%]与ENc值进行关联性分析,绘制散点图,并与(C+G)_3%标准曲线进行比较。采用主成分分析法对Ⅰ型脊灰病毒基因密码子的RSCU值进行分析,并利用分析获得的主因子绘制散点图,观察不同时间和地域的Ⅰ型脊灰病毒基因密码子使用偏好性。结果Ⅰ型脊灰病毒基因密码子AGA、AGG、CCA、UCA和GUG的RSCU值均≥1.5,密码子GCG、CGA、CGG、CGC、UCG和ACG的RSCU值均≤0.5。Ⅰ型脊灰病毒的ENc平均值为53.633。40株Ⅰ型脊灰病毒毒株均位于(C+G)_3%标准曲线以下。2009年之前分离出来的毒株均位于图的下方,2009年之后分离于不同国家或地区的毒株分别聚集于图的一处。结论Ⅰ型脊灰病毒在AGA、AGG、CCA、UCA、GUG等密码子的使用上偏好性较强,在GCG、CGA、CGG、CGC、UCG、ACG等密码子的使用上偏好性较弱。Ⅰ型脊灰病毒在密码子使用偏好性上处于较弱水平。自然选择在Ⅰ型脊灰病毒基因密码子使用偏好性上起主要作用,不同时间和地域的Ⅰ型脊灰病毒基因密码子使用模式差异较大。(本文来源于《山东医药》期刊2019年24期）
张宁,陈宏[6]（2019）在《904例尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒基因亚型分析》一文中研究指出目的 :尖锐湿疣(Condyloma Acuminatum,CA),又称生殖器抚,是由人乳头瘤病毒(Human Papillomavirus,HPV)感染所致的主要发生在肛门-生殖器部位的疣状良性增生性病变,是临床常见的性传播疾病之一。该病发病时患者通常无自觉症状,部分病人偶有疼痛、瘙痒,主要好发于外生殖器、会阴以及阴道、尿道、肛门、肛周皮肤、宫颈等处。性接触为其主要传播途径,少数人亦可通过非性传播的密切接触而感染,高复发率及强传染性为其主要特点,是医务工作者面临的棘手问题。目前,己发现的HPV有200多型,其中大约40多种亚型可以感染泌尿生殖道。根据HPV病毒致病力的不同,又将其亚型分为低危型和高危型(本文来源于《第十一次全国中西医结合变态反应学术会议、宁夏中西医结合学会变态反应分会成立大会、中西医结合诊疗变态反应性疾病提高班资料汇编》期刊2019-08-23）
姚玮,王久香,霍星星,周秋梅,黄开泉[7]（2019）在《乙型肝炎病毒基因分型与耐药突变基因位点的检测分析》一文中研究指出目的分析乙型肝炎病毒(HBV)基因型及耐药突变基因位点,为指导临床抗病毒治疗合理用药提供依据。方法回顾分析2014年3月～2016年10月安徽中医药大学第一附属医院114例乙型肝炎患者HBV基因分型和拉米夫定(LAM)、替比夫定(LdT)、阿德福韦酯(ADV)和恩替卡韦(ETV)四种核苷类药物(NAs)耐药及耐药突变位点分布情况、HBV核酸(HBVDNA)定量、HBVE抗原(HBeAg)定量、丙氨酸氨基转移酶(ALT)的浓度、血小板(PLT)的含量。结果 114例乙型肝炎患者中检测出HBV基因C型61例,B型45例,D型3例,B+C混合型1例,B+D混合型1例,其他基因型5例。其中C型多于B型(P <0.05)。检出39例NAs耐药,耐药率为34.21%;C型与B型耐药无显着差异。C型患者HBeAg定量高于B型患者(P <0.05),PLT计数低于B型患者(P <0.05)。耐药突变位点最多见于rt204I;C型多位点突变高于B型(P <0.05)。LAM和LdT联合耐药最多见,两种及两种以上多重耐药高于单一耐药(P <0.01)。结论本研究中乙型肝炎患者HBV基因型多为C型,其次为B型。C型患者容易发生肝纤维化,更易发生多位点突变。NAs耐药以LAM和LdT联合耐药为主,多为两种以上联合耐药。检测HBV基因型和耐药突变基因位点对评价乙型肝炎临床治疗效果和指导临床抗病毒治疗合理用药具有十分重要的意义。(本文来源于《临床输血与检验》期刊2019年04期）
陶昕彤,周易,赵珍珍,王念,周娟[8]（2019）在《四川大学华西医院乙型肝炎病毒基因分型和耐药突变分析》一文中研究指出目的探讨四川大学华西医院乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型分布特征和耐药突变情况,为乙型肝炎个体化治疗提供依据。方法选择2016年1月—2018年12月于四川大学华西医院就诊的786例慢性乙型肝炎患者为研究对象,通过Sanger测序法测序并分析基因型和耐药突变,应用χ2检验进行统计分析。结果 786例样本中共检出B、C、D 3种基因型,B基因型489例(62.2%),C基因型291例(37.0%),D基因型6例(0.8%),B、C基因型在不同年龄和民族中的分布差异有统计学意义(P<0.05);627例发生耐药突变,耐药突变率为79.8%,对拉米夫定+替比夫定耐药的病例数最多,有262例(33.3%),102例(13.0%)对拉米夫定+替比夫定+恩替卡韦均耐药,83例(10.6%)对阿德福韦酯耐药,该样本群体中未发现替诺福韦耐药株,B、C基因型中不同药物耐药株之间的数量差异有统计学意义(χ2=14.356,P<0.01);最常见的单点耐药突变是M204I,共179例(22.8%),其次是与阿德福韦酯耐药相关的A181V/T有46例(5.9%);混合耐药突变最常见的是L180M+M204V/I,共83例(10.6%),另检出102例(13.0%)在L180M+M204V/I的基础上出现了M250V、V173L、T184A/G/S/I、S202G/I。结论四川大学华西医院的HBV基因型以B型和C型为主,且耐药形势严峻,突变模式复杂,应及时检测HBV基因型和耐药突变,从而制定更好的临床治疗方案。(本文来源于《华西医学》期刊2019年08期）
戴永刚,郑文,穆家康[9]（2019）在《鲁中地区就诊的269例男性尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒基因分型检测结果分析》一文中研究指出目的:探讨鲁中地区男性尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒(HPV)基因分型组成及分布情况。方法:采用聚合酶链式反应-反向斑点杂交技术(PCR-RDB)对269例男性尖锐湿疣患者生殖器及肛周皮损组织进行23种HPV基因分型检测。结果:269例HPV检测阳性者中感染率前5名的型别依次为HPV11 (19.80)、HPV6 (19.11)、HPV16 (7.51)、HPV52 (5.63)和HPV43(4.44)。其中多重感染占56.67,单一感染占43.33;在发生多重感染的患者中,高、低危HPV混合感染比例最高(47.96)。男性HPV感染者中以21～30岁所占比例最高(47.39)。结论:鲁中地区男性HPV感染主要以11、6、16和52型为主,多发于21～30岁男性,高、低危混合感染较常见,多重HPV混合感染比例高。(本文来源于《临床皮肤科杂志》期刊2019年08期）
陈昆锐,叶蕊,施媛,李鹏飞,李宏伟[10]（2019）在《云南省曲靖市非高危人群丙型肝炎病毒基因型分析》一文中研究指出目的对曲靖市感染丙型肝炎的非高危人群进行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究,寻找本地区流行基因型,为丙型肝炎的科学防治提供依据。方法采集住院病人血液,提取RNA,采用HCV特异性引物进行巢式RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,采用生物信息学软件进行序列分析。结果共采集228例病人血清,排除具有高危因素影响的血清29例,非高危人群丙型肝炎病人血清199例。共检出4个基因型(1、2、3、6),5个基因亚型(1b、2a、3a、3b和6a),有37例不能鉴别的基因亚型。其中1b型78例(39. 2%)、2a型42例(21. 1%)、3a型15例(7. 5%)、3b型23例(11. 6%)、6a型4例(3. 0%)和未能分型37例(18. 6%)。根据文献检索提取云南省HCV基因分型流行情况,对于HIV/HCV共感染的静脉吸毒者(Intraductal Ultrasonography,IDUS)和静脉吸毒HCV感染者,前3位的基因亚型分别为3b、3a、1b;对于标本来源为医院病人,未进行感染途径分类,前3位的基因亚型分别为1b、3b、2a。结论曲靖市丙型肝炎非高危感染人群主要HCV基因亚型1b型和2a型与我国的主要基因亚型基本一致,与云南省主要的HCV基因亚型略有区别,但与同地区的HIV/HCV共感染的静脉吸毒者HCV基因型有着明显区别。(本文来源于《医学动物防制》期刊2019年09期）
病毒基因型分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的了解陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况。方法选取2017-2018年度分离的6株甲型H1N1流感毒株进行全基因测序,利用生物信息学软件对分离株的HA和NA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/Michigan/45/2015进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建基因进化树,进行系统进化分析。结果陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒阳性占比36.85%,流行高峰为2017年12月和2018年1月。6株甲型H1N1流感病毒测序得到的HA、NA序列与疫苗株比对,分别有12、11个氨基酸位点发生变异,其中HA有7个位点变异发生在抗原决定簇,受体结合位点、潜在糖基化位点比较稳定;NA序列没有发现耐药位点变异。结论 2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒为优势流行株。目前甲型H1N1流感病毒与WHO推荐的新疫苗株高度同源。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
病毒基因型分析论文参考文献
[1].廖琳虹,杨萍,张彦锋,曹春远,何云.2014年龙岩市手足口病患者CVA10病毒基因特征分析[J].河南预防医学杂志.2019
[2].许晶,史伟,张蕾,李慎,郑媛.2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒基因特征分析[J].现代预防医学.2019
[3].缪礼锋,沈月兰,苏斌,程晓莉,吴建军.安徽省485例抗病毒治疗失败艾滋病患者耐药基因型分析[J].中国卫生检验杂志.2019
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