导读:本文包含了抗病基因同源序列法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:油菜(Brassica,napus),抗病基因,同源序列,NBS
抗病基因同源序列法论文文献综述
张晓娟,陈志远,赵辉[1]（2019）在《油菜抗病基因同源序列克隆与分析》一文中研究指出为加快油菜抗病基因克隆,促进抗菌核病油菜育种。本研究根据已知NBS类植物抗病基因保守区P-loop和GLPL设计的兼并引物,对具有菌核病抗性的‘中双9号’油菜材料进行扩增,PCR产物克隆测序。采用NCBI中的BLAST进行序列比对,DNAMAN 6.0查找ORF并翻译成氨基酸序列,CDD查找蛋白保守域,通过MEGA 5构建系统发育树。结果显示:20条测序序列中,有1条序列(KB A1)与甘蓝型油菜类抗病基因RGA14相似性较高,该序列编码蛋白包含NBS-LRR类蛋白质的NB-ARC保守结构域。MEGA5进化树分析表明该序列与拟南芥RPM1、RPP8抗病基因编码蛋白聚在一起。推测该序列可能与油菜抗病基因相关,或者是抗病基因的一部分。本研究为进一步对该序列进行表达分析,研究其与油菜抗病性的关系提供理论依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年20期）
杨春雷,卜璐璐,张世杰,李春艳,罗兴会[2]（2018）在《‘冲天桃’NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析》一文中研究指出云南地方桃资源丰富,冲天桃为其中一种,为了寻找云南省地方桃资源中具有高抗病的种质资源,从而为云南省抗病性地方桃品种选育提供理论基础,本研究根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守序列设计简并引物,以冲天桃为试材,对其基因组DNA进行PCR扩增、克隆、测序,共得到5条NBS类抗病基因同源序列(RGAs),大小约为500 bp,经序列分析表明:这5条RGAs与桃亚属植物中推测的一些抗病基因蛋白具有较高的同源性,其中一些RGAs与番茄抗青枯病基因Prf及烟草的抗花叶病毒N基因具有高度的同源性。因此可以确定‘冲天桃’植株中存在较为丰富的NBS-LRR类抗病基因,这为下一步云南省抗病性地方桃品种选育提供了研究依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年20期）
雷珍珍,陈磊,张瑶,乐超银[3]（2019）在《花魔芋NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆和初步分析》一文中研究指出通过同源克隆法从花魔芋抗病植株中得到抗软腐病基因的同源片段,为筛选魔芋抗软腐病基因提供了科学依据。根据已知植物NBS-LRR类抗病基因同源序列(RGA)的保守区域设计简并引物,从抗软腐病花魔芋植株的基因组DNA与cDNA上得到抗病基因同源片段(RGAs),并对其结构进行分析。从抗软腐病花魔芋植株基因组中分离得到了一条500 bp的NBS-LRR类抗病基因同源序列,共获得6条特异序列,分别命名为RGAR1、RGAR2、RGAR3、RGAR4、RGAR5、RGAR6,6条魔芋RGAs在氨基酸水平上的同源性表现出多态性,序列相似性分析结果表明,这些魔芋抗病基因同源序列均包含P-loop、Kinase-2、Kinase-3及疏水结构域HD等保守结构域,与已知的抗病基因在氨基酸水平上的同源性为33%～63%。通过构建系统进化树分析,将这6个序列分为3个亚组,均属于TIR-NBS-LRR类抗病基因。在花魔芋上成功获得了抗病基因同源序列,将为魔芋中抗病基因的克隆、功能分析及定位等提供帮助。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年08期）
丁玉梅,高婷,仲莎,姚春馨,周晓罡[4]（2018）在《黑籽南瓜中NBS类抗病基因同源序列的克隆与表达分析》一文中研究指出黑籽南瓜(Cucurbita ficifolia)是云南特有的对病害有较强抗性的一种瓜类作物。为发掘利用其蕴含的优异抗病基因资源,本研究根据已克隆到的植物核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)类抗病基因的保守氨基酸结构域基因设计简并引物,通过PCR扩增从黑籽南瓜基因组中分离了8条黑籽南瓜抗病基因同源序列(resistance gene analogous,RGAs),聚类分析和相似性比较结果显示,黑籽南瓜抗病基因同源序列2(black seed squash resistance gene analogous 2,HQRGA2(Gen Bank No.:MG946756)单独为一类,且具有核苷酸结合衔接子(nucleotide-binding adaptor shared by APAF-1,R proteins and CED-4;NBARC)结构,其余7条序列均不具有NBS保守结构域。核苷酸相似性分析表明,HQRGA2与部分抗病基因序列的相似性达到87%~99%,其中与南瓜(Cucurbita maschata)NBS类抗病蛋白基因13(squash resistance gene analogous,SQRGA-13)和SQRGA-8的相似性分别达到98.0%和97.0%。对HQRGA2编码的氨基酸保守结构域分析表明,其含有NBS类抗病基因的4个保守模块:P-loop、Kinase-2、Kinase-3a和GLPL区,且属于无Toll蛋白或白介素1受体类似的NBS富亮氨酸重复(non toll/interleukin-1 receptor like of NBS plus leucine-rich region,non-TIR-NBS-LRR)类抗病基因同源序列。HQRGA2编码氨基酸的同源性分析结果表明,其与南瓜抗病蛋白基因SQRGA-13氨基酸同源性较高,达到96.6%,与其余抗病基因同源性在16.6%~43.8%之间,NBS区域氨基酸系统进化树分析结果表明,HQRGA2可能是一个新的抗病基因片段。q RTPCR分析表明,黑籽南瓜HQRGA2片段的表达受尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)的胁迫诱导,表现出先扬后抑的表达模式,说明HQRGA2可能为抗病相关基因片段。黑籽南瓜中NBS类抗病基因同源序列HQRGA2的获得为分离克隆其完整抗病基因提供了新线索。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2018年08期）
李家创,赵继新,刘洋,梁邦平,刁慧珊[5]（2017）在《四个小麦近缘属种NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析》一文中研究指出根据NBS类抗病基因的氨基酸保守区设计简并引物,从小麦的四个近属种,华山新麦草、滨麦、大麦和黑麦的基因组DNA中分离得到了16条同源序列,核苷酸序列长度在250 bp左右,其中华山新麦草5条,滨麦4条,大麦4条,黑麦3条(GenBank登录号为KX774756-774771),与已知物种RGAs序列相似度80%—100%,氨基酸相似度49%—99%。序列分析表明这16条序列都具有典型的P-loop和Kinase-2结构域,且属于non-TIR类抗病蛋白。滨麦种内R基因存在较大遗传差异,BM4可能为未发现的新抗病基因的部分序列。聚类分析表明,华山新麦草和黑麦被聚为一类,滨麦,大麦和小麦被聚为一类,滨麦与小麦亲关系相对较近。16条序列与10个已公布NBS类抗病基因被分为4大类,HS1、DM2、Yr10和Mla6被聚为一个亚组,HS3、DM4、DM3、DM5和I2C-1被聚为一个亚组,BM2、HM1和PRF被聚为一个亚组,其中BM5与Pm3b可能属于同一基因簇。本研究对梳理进化关系,发掘四个物种的抗病基因,开发分子标记辅助育种,和小麦的远杂交亲本选择具有重要意义。(本文来源于《第八届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2017-08-07）
张维[6]（2017）在《萝卜全基因组NBS-LRR抗病基因鉴定与NBS抗病基因同源序列克隆》一文中研究指出萝卜(Raphanus sativus L.,2n=2x=18),十字花科萝卜属一、二年生根菜类蔬菜,是广泛种植于我国的重要经济作物。萝卜在生长过程中易受各种病原菌侵袭而诱发病害,导致萝卜品质差,产量下降,进而造成重大经济损失。因此,选育萝卜抗病新品种成为控制病害发生的有效途径。近年来,随着全基因组测序工作的完善,利用全基因组序列进行抗病基因分离已成为抗性研究热点。研究表明,含有核苷酸结合位点(NBS)结构域的抗病基因为抗病基因家族中数量最多的一类,在抵御病原菌侵染方面起重要作用。然而,萝卜全基因组NBS-LRR类抗病基因的分离鉴定工作尚未见报道,而且萝卜NBS抗病基因同源序列分离工作仍有待进一步深入。本研究鉴定分析了萝卜全基因组中NBS-LRR类抗病候选基因序列,并对部分候选基因进行分离克隆。另外,利用NBS保守结构域设计简并引物,分离萝卜抗病基因同源序列,同时分析了部分克隆基因和同源序列的表达,本文主要研究结果如下:1、萝卜全基因组中共鉴定到188个含NBS结构域的抗病候选基因,根据C端是否含TIR结构,可将188个基因分成128个TIR-NBS-LRR和60个non-TIR-NBS-LRR(CC-NBS-LRR)两大类。其中,74个RsNBS基因(39.36%)定位于萝卜连锁群R1-R9上。RsNBS基因在连锁群中分布相对分散,数量也各有不同。本研究中部分基因以基因簇形式存在,共鉴定到12个基因簇。R7上基因数最多(13个RsNBS基因),R6含有的基因簇最多(3个基因簇),R8所含基因簇中基因数最多(6个RsNBS基因)。2、进化关系研究表明,萝卜NBS-LRR基因与拟南芥NBS类抗病基因具有较近的亲缘关系。基序和基因结构分析表明,188个萝卜抗病候选基因中均包含NBS保守结构域,并且包含保守基序(P-loop、RNBS-A、Kinase-2、RNBS-B和GLPL)和保守结构域(TIR、CC和LRR等)。基因结构分析发现,RsNBS基因含有平均外显子数为4.87。TNL类和CNL类RsNBS基因平均外显子个数分别为5.59和3.33个,而部分CNL类RsNBS基因(28.3%)由单个外显子编码而成。除RsNBS164外,其余TNL类RsNBS基因均由2个以上外显子构成。3、利用简并引物进行PCR扩增,从萝卜中分离到50条具有完整开放阅读框的抗病基因同源序列(RGAs),将其命名为RsRGA01-RSRGA50。聚类进化分析表明,50条同源序列分为TNL和CNL两类,分别含有14条和36条抗病基因同源序列,又可细分为 RsRGAⅠ、RsRGA Ⅱ、RsRGA Ⅲ、RsRGA Ⅳ、RsRGA Ⅴ 和 RsRGA Ⅵ。序列比对和基序分析表明所有序列均含有P-1oop、RNBS-B和kinase-2基序。其中,RsRGA31与拟南芥RPM1的相似性达89.77%,推测其可能与RPM1同源,且具有相似功能。对本研究中部分RsNBS基因进行DNA序列克隆,验证了数据库准确性。qRT-PCR分析结果表明,3个RsRGAs序列(RsRGA08、RsRGA34、RsRGA44)和4个 RsNBS基(RsNBS021、RsNBS044、RsNBS062、RsNBS164)在不同萝卜品种不同处理下呈现出差异表达模式,推测这些序列和基因在萝卜抗病防御信号途径中发挥重要作用。(本文来源于《南京农业大学》期刊2017-06-01）
刘文睿,江彪,彭庆务,何晓明,林毓娥[7]（2016）在《冬瓜抗病基因同源序列的克隆及分析》一文中研究指出以已知植物抗病基因的保守区域为基础设计简并引物,从冬瓜抗病材料B227基因组中分离NBS-LRR类抗病基因同源序列,共获得32条特异序列,其中17条具有完整开放阅读框。这17条序列的核苷酸同源性变化范围为56.4%~99.8%,氨基酸的同源性变化范围为46.2%~100.0%。序列相似性分析结果表明,这些冬瓜抗病基因同源序列均包含P-loop,Kinase-2和GLPL等保守结构域。与已知抗病基因构建系统进化树,将这17个序列分为2个亚组,均属于TIR-NBS-LRR类抗病基因。本研究将为抗病基因全长序列克隆、功能分析及定位等研究提供帮助。(本文来源于《分子植物育种》期刊2016年07期）
张非亚[8]（2016）在《月季抗病基因同源序列的研究及杂交群体的构建》一文中研究指出现代月季有近3万个品种,由于其生态适应范围广、花期长、花色丰富、株型多样,在园林绿化、鲜切花、家居装饰等方面都有广泛的应用。然而,黑斑病是露地栽培月季最常见的病害,严重影响了月季的观赏性和经济价值。因此通过对月季品种/种的抗性筛选,获得黑斑病抗性有差异的亲本；以此为基础,克隆与分离月季抗病基因同源序列(RGA),筛选与黑斑病抗性相关联的候选基因。以不同黑斑病抗性和花色的月季品种或种进行杂交,构建后代分离群体；开发合适的SSR标记,研究后代群体的遗传多样性和性状分离情况；该研究为月季抗病群体的构建和抗病基因的分离克隆提供理论基础,并为培育观赏性状优良、抗病性强的月季新品种提供了丰富的材料。1.通过对抗病性状的田间调查,对现有蔷薇属资源进行了评价,得到高度感病的品种7个,感病品种6个,低抗品种10个,中抗品种/种15个,高抗品种/种13个。在抗病评价的基础上,为了进一步挖掘与抗病相关的基因,进行了月季RGA的分离与鉴定。在转录组测序数据分析的基础上,设计6对简并引物,分别从现代月季品种‘杨基歌’(Rosa.'Yankee Doodle')、疏花蔷薇(R.1axa)、‘白玫瑰’(R. rugosa'White')上克隆了NBS-LRR-RGA;挑取750个克隆进行序列分析,氨基酸序列比对发现所克隆RGA均含有完整的NBS结构域：P-Loop,kinase-2,kinase-3a和GLPL;并构建了系统进化树。从系统发育树可看出,所克隆RGA与已克隆的其他植物的R基因的亲缘关系较近,分为nonTIR-NBS-RGA和TIR-NBS-RGA2个大类,10个进化枝,其中所克隆得到的nonTIR-NBS-RGA的比例远大于TIR-NBS-RGA的比例。筛选出进化树不同家族的6个RGAs,从它们的表达分析可看出,这些RGAs都不同程度、不同时间地参与了抗病反应,推测其中3个RGAs与抗病的相关性比较大。2.为了培育新奇花色、抗黑斑病的新优品种,选用筛选出来的抗黑斑病能力较强的白玉堂、单瓣黄刺玫、报春刺玫、玫瑰作为父本,生长健壮、开花能力较强的9个月季品种作为母本,设计远缘杂交组合20个；杂交结果显示,杂交亲和性较高的组合有：‘雪山娇霞’×报春刺玫、‘雪山娇霞’×单瓣黄刺玫、‘橘红潮’×玫瑰、‘花房’×白玉堂,结实率在10.91-37.5%之间。品种间杂交选用黑斑病抗性、花色有差异的19个月季品种,共设计51个杂交组合,品种间杂交亲和性较好的组合有10个。结合远缘杂交、品种间杂交、花粉生活力测定以及母本自然授粉结实情况的调查,筛选出适合做母本的月季品种有：‘绯扇’、‘电子表’、‘曼哈姆’、‘花房’、‘红帽子’、‘橘红潮’和‘雪山娇霞’；适合做父本的月季品种有‘电子表’、‘红法兰西’和‘绯扇’。3.为开发适合月季的SSR分子标记并进行性状关联分析及遗传多样性评价,从本课题组转录组数据中设计SSR引物80对,筛选出具有目的条带的SSR引物44对,具有多态性的SSR引物28对。用所开发的标记对其中一个杂交群体‘电子表’ב红法兰西’的遗传多样性进行了评价,该群体遗传距离在0.52-0.94之间；后代聚类分析结果与后代的花色分离结果有一定相关性,后代群体聚为两大类,其中一类跟母本‘电子表’(HT-13)聚为一类,花色大多是黄色；另一类跟父本‘红法兰西’(HT-12)聚在一起,花色普遍为红色到粉色之间。(本文来源于《北京林业大学》期刊2016-04-01）
贺尔奇,李向勇,彭仕荣,张正学,付瑜华[9]（2016）在《果蔗NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析》一文中研究指出为发掘果蔗抗病基因,促进果蔗抗病分子机制的研究,并为后续通过基因聚合分子育种提高果蔗品种的广谱抗性奠定基础,本研究根据已克隆的植物抗病基因保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR方法对抗病果蔗品种黔糖5号的RNA进行扩增,共获得7条果蔗富亮氨酸重复的核苷酸结合位点(nucleotide binding site-leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因同源序列。氨基酸序列比对分析结果表明,这7条果蔗NBS-LRR类抗病基因同源序列均具有NBS典型结构域,且彼此间在氨基酸水平上表现出丰富的多态性。与7个已克隆的典型植物抗病基因同源序列构建系统进化树,7条果蔗抗病基因同源序列与基因RPM1和RPS2的亲缘关系较近,需进一步进行基因全长克隆和功能验证来确定含有这些片段的基因功能。(本文来源于《分子植物育种》期刊2016年02期）
刘登全,王园秀,崔朝宇,秦双林,欧阳慧[10]（2016）在《晚熟温州蜜柑NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析》一文中研究指出为加深对柑橘黄龙病抗性机理的了解和为黄龙病抗性基因的克隆提供依据,根据已知植物抗病基因NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以柑橘黄龙病抗性品种"晚熟温州蜜柑"为供试材料,对其基因组DNA进行PCR扩增、克隆和序列测定,结果共获得17条抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),其在NCBI中的登录号为KJ019189~KJ019199,KR815564~KR815569。序列分析表明,这17个RGAs与甜橙、柚等柑橘属中推测的一些抗病蛋白基因或其他相关蛋白基因具有显着高的同源性。其中一些RGAs与拟南芥抗霜霉病RPP13基因、柑橘抗衰退病毒基因Ctv或烟草抗TMV基因N具有51.7%~79.0%的氨基酸序列同源性。依据论文结果,笔者认为,晚熟温州蜜柑中存在较丰富的NBS-LRR类抗病基因,但具体哪些病基因与抗黄龙病相关尚需进一步研究。(本文来源于《江西农业大学学报》期刊2016年01期）
抗病基因同源序列法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
云南地方桃资源丰富,冲天桃为其中一种,为了寻找云南省地方桃资源中具有高抗病的种质资源,从而为云南省抗病性地方桃品种选育提供理论基础,本研究根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守序列设计简并引物,以冲天桃为试材,对其基因组DNA进行PCR扩增、克隆、测序,共得到5条NBS类抗病基因同源序列(RGAs),大小约为500 bp,经序列分析表明:这5条RGAs与桃亚属植物中推测的一些抗病基因蛋白具有较高的同源性,其中一些RGAs与番茄抗青枯病基因Prf及烟草的抗花叶病毒N基因具有高度的同源性。因此可以确定‘冲天桃’植株中存在较为丰富的NBS-LRR类抗病基因,这为下一步云南省抗病性地方桃品种选育提供了研究依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
抗病基因同源序列法论文参考文献
[1].张晓娟,陈志远,赵辉.油菜抗病基因同源序列克隆与分析[J].分子植物育种.2019
[2].杨春雷,卜璐璐,张世杰,李春艳,罗兴会.‘冲天桃’NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析[J].分子植物育种.2018
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[4].丁玉梅,高婷,仲莎,姚春馨,周晓罡.黑籽南瓜中NBS类抗病基因同源序列的克隆与表达分析[J].农业生物技术学报.2018
[5].李家创,赵继新,刘洋,梁邦平,刁慧珊.四个小麦近缘属种NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析[C].第八届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2017
[6].张维.萝卜全基因组NBS-LRR抗病基因鉴定与NBS抗病基因同源序列克隆[D].南京农业大学.2017
[7].刘文睿,江彪,彭庆务,何晓明,林毓娥.冬瓜抗病基因同源序列的克隆及分析[J].分子植物育种.2016
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[9].贺尔奇,李向勇,彭仕荣,张正学,付瑜华.果蔗NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析[J].分子植物育种.2016
[10].刘登全,王园秀,崔朝宇,秦双林,欧阳慧.晚熟温州蜜柑NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及分析[J].江西农业大学学报.2016
标签：油菜(Brassica; napus); 抗病基因; 同源序列; NBS;