导读:本文包含了蛋鸡分离株论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:商品蛋鸡,禽白血病,发病观察,病毒分离
蛋鸡分离株论文文献综述
谢庆华[1]（2017）在《商品蛋鸡感染禽白血病病毒的发病观察及分离株gp85基因遗传进化分析》一文中研究指出禽白血病(Avian leukosis,AL)是一种由反转录病毒科中统称为禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)引起的禽类多病型的肿瘤性疾病,给家禽业造成了巨大的经济损失。本研究通过对来源于同一个父母代种鸡场同时入雏的4群商品代蛋鸡进行持续的跟踪调查和检测,以研究鸡群感染ALV的情况、鸡群的发病特征和主要生产性能、病毒的分离鉴定及分离株gp85基因的遗传变异情况,为今后对广西蛋鸡中AL的认识、诊断及防控提供依据。在A、B、C、D四群鸡中,A、C两鸡群从10周龄开始出现明显的临床症状。通过对发病初期的疑似病例进行剖检发现,病鸡呈现明显的内脏器官肿瘤,且在A鸡群病鸡的胸骨内发现有骨髓瘤。临床病鸡样品的PCR检测结果显示,A鸡群为ALV、马立克氏病毒(Marek's Disease virus,MDV)阳性及禽网状内皮组织增殖病毒(Reticuloendotheliosis virus,REV)阴性,C鸡群为MDV、REV阳性及ALV阴性;在发病后期的26周龄时,对临床病鸡样品进行病毒分离鉴定的结果显示,A鸡群为MDV、REV阴性及ALV阳性,C鸡群MDV、REV和ALV均为阴性;在58周龄时,随机采集4群鸡的蛋清和血浆分别进行ALV-p27抗原检测和ALV分离培养,结果表明:A、B、C和D四群鸡蛋清样品的p27抗原阳性率分别为14.29%(15/105)、10.92%(13/119)、0%(0/104)和 0%(0/104);A、B、C 和 D 四群鸡的ALV 分离阳性率分别为 9.78%(9/92)、5.43%(5/92)、0%(0/92)和1 0.09%(1/92)。在产蛋性能方面,A、B、C和D四群鸡19-72周龄入舍母鸡产蛋率分别为76.05%、84.94%、78.29%和79.23%。粉壳鸡中A鸡群的产蛋率明显低于B鸡群,而两群褐壳鸡(C、D鸡群)的产蛋率差异不明显。在死淘方面,4群鸡在开产前(0-18周龄)的死淘率分别为37.51%、3.12%、31.78%和1.18%,在产蛋期(19-72周龄)的死淘率分别为18.06%、4.69%、9.58%和9.55%,A鸡群的死淘率明显高于其他鸡群,而C鸡群的高死淘率主要在发病阶段。对临床病例进行解剖,采集病料接种于DF-1细胞进行病毒分离培养。对细胞培养物分别进行ELISA和PCR检测后确定分离到一株ALV-J毒株,命名为GX201507。对病毒分离株的囊膜糖蛋白基因gp85进行扩增、测序和遗传进化分析发现,分离株GX201507的gp85基因全长924个核苷酸,编码308个氨基酸。在分离株的gp85氨基酸全长序列中,共发现有12个突变位点,其中S182G、A268V、L289H叁个位点突变为GX201507株所特有。进化树分析表明,,GX201507与国内A、B、E亚群参考株SDAU09C3、SDAU09E3、SD0501的亲缘关系较远,分别位于不同的分支上,而与广西地方品种鸡的ALV-J参考株GX14ZS14、GX14FF01和国内蛋鸡ALV-J参考株FJ201308、GL09DP01及J亚群原型株HPRS103的亲缘关系较近,处于同一个分支上。gp85基因的相似性分析结果显示,GX201507与国内A、B、E亚群参考株SDAU09C3、SDAU09E3、SD0501的gp85氨基酸相似性较低,分别为43.7%、44.3%和43.5%;与J亚群参考株的gp85氨基酸相似性为87.8%～98.4%,其中与J亚群原型株HPRS103的相似性为95.5%,与4株广西地方品种鸡ALV-J参考株的相似性为87.8%～98.4%,与5株国内蛋鸡ALV-J参考株的相似性为88.7%～98.1%,与5株国内白羽肉鸡ALV-J参考株的相似性为89.6%～92.2%,与之相似性最高的是广西分离株GX14FF01,为 98.4%。本课题研究表明,来源于同一个父母代种鸡场同时入雏的4群蛋鸡中,有3群存在ALV感染,但其中仅有一群发生明显的临床疾病,病鸡主要表现为内脏器官肿瘤和胸骨骨髓瘤,且在发病早期存在ALV和MDV混合感染。发生AL的鸡群的产蛋性能明显低于其他同品种的正常鸡群,且在整个饲养期内表现出较高的死淘率。从临床发病鸡群中获得一株ALV-J毒株,该分离株gp85基因与源自国内蛋鸡和广西地方品种鸡分离株的氨基酸相似性高于白羽肉鸡分离株的。(本文来源于《广西大学》期刊2017-12-01）
蔡丝丝,崔智豪,刘玲,陈亮,陈瑞爱[2]（2015）在《基因Ⅶ型新城疫病毒蛋鸡分离株的生物学特性及全基因组序列分析》一文中研究指出对广东某蛋鸡场新城疫病毒分离株(命名GD0526)进行生物学特性研究及全基因组序列分析,结果显示该分离株具血凝活性,能被特异性新城疫病毒标准阳性血清所抑制,动物回归试验出现新城疫典型症状。该毒株MDT为43.38h、ICPI为1.73、IVPI为2.37,F基因裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株特征。抗体增长规律和免疫交叉保护试验说明该毒株免疫原性较好,能产生较高水平的抗体,对试验鸡提供很好的保护。全基因组克隆和测序分析表明该毒株全基因组长15192bp,属基因Ⅶd型,与Shangdong-02-2010株核苷酸序列具有很高的同源性,而与LaSota株的相似性较低。(本文来源于《中国家禽》期刊2015年09期）
赵钦,孙亚妮,刘宝元,谢莎,耿亚男[3]（2014）在《禽戊型肝炎病毒中国分离株对蛋鸡致病性研究》一文中研究指出引言禽戊型肝炎病毒(HEV)导致的鸡大肝大脾病(BLS)是危害全球蛋鸡和种鸡养殖业健康发展的重要疫病之一。此外,低剂量禽HEV感染也会使鸡群处于亚健康状态,当气候和饲料等外界环境改变或与其它病原混合感染时,极易导致鸡群暴发BLS。在我国蛋鸡或种鸡场时有BLS的报道,血清学调查发现该病毒感染在我国鸡群中已广泛存在(抗体阳性率40%左右)~([1])。但是,由于缺乏合适高效的体外(本文来源于《中国畜牧兽医学会2014年学术年会论文集》期刊2014-11-08）
王琦,王永强,康忠惠,高玉龙,潘伟[4]（2011）在《蛋鸡J亚群禽白血病病毒分离株SD1009株感染性克隆的构建与病毒拯救》一文中研究指出为探究蛋鸡J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的致病机理,从山东省某鸡场送检的蛋鸡病料中分离鉴定出1株ALV-J,命名为SD1009株,采用PCR方法分3段扩增出SD1009株的前病毒cDNA,PCR产物经克隆酶切后顺次连接,获得1个含有完整ALV-J前病毒cDNA的重组质粒,命名为pBW-SD1009。全长测序及序列比对分析发现,近年来分离的ALV-J都存在缺失部分rTM和DR区的序列,缺失长度为205bp。通过外源基因嵌合的方式,将205bp嵌合进入,又获得了1个前病毒cDNA的重组质粒,命名为pBW-SD1009A205,将pBW-SD1009和pBW-SD1009A205分别转染DF1细胞,通过间接免疫荧光试验,禽白血病抗原试剂盒检测,反转录酶试剂盒检验,表明拯救出了2株病毒,分别命名为rSD1009和rSD1009A205。本研究成功构建了蛋鸡ALV-J的感染性克隆,并在序列分析的基础上,又构建了第2株补全缺失序列的感染性克隆,结果表明缺失部分rTM和DR区的序列,对病毒的拯救以及病毒的复制动力学无显着影响。(本文来源于《中国兽医科学》期刊2011年11期）
王琦,王永强,康忠惠,高玉龙,潘伟[5]（2011）在《蛋鸡J亚群禽白血病病毒SD1009分离株的分离鉴定及全基因组序列分析》一文中研究指出为分析我国J亚群禽白血病病毒(ALV-J)蛋鸡分离株的进化关系,本研究将山东省某鸡场采集的蛋鸡病料样品接种DF-1细胞系,利用ELISA群特异性抗原检测以及亚群特异性间接免疫荧光方法,分离鉴定得到一株ALV-J,命名为SD1009,并对其进行全基因组测序,将该序列与其他ALV-J代表性病毒株序列进行比较。结果表明:SD1009分离株的gag和pol基因相对保守,与各参考病毒株的同源性为95%～99%,env基因的同源性为91%～95%;在其5'UTR中出现了连续19 bp的插入突变,与TW-3577、SDAU09C3、JS09GY6、JS09GY3蛋鸡分离株的5'UTR基本一致,提示19 bp的插入现象可能是近年来蛋鸡ALV-J的进化趋势;此外,其3'UTR的rTM和DR区出现部分缺失现象,该缺失部分也可能与ALV-J进化相关。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2011年08期）
潘伟,高玉龙,刘超男,秦立廷,王永强[6]（2011）在《我国部分地区蛋鸡ALV-J分离株gp85基因遗传进化分析》一文中研究指出为了解我国蛋鸡J亚型白血病病毒(ALV-J)株来源及其遗传进化关系,本研究对2009年从我国6个省区蛋鸡场分离到的19株ALV-J的gp85基因进行克隆和测序,并与11个ALV-J参考株gp85基因作了比较分析。结果表明:19个ALV-J分离株的gp85基因长度为894bp～924bp不等,分别编码298～308个氨基酸;各病毒株间gp85推导氨基酸的同源性为71.3%～100%。遗传进化分析表明,目前我国蛋鸡ALV-J分离株来源复杂,其中13个分离株与英国原型株HPRS-103、国内麻黄肉鸡株SCAU-0901亲缘关系较近;3个分离株与美国株ADOL-7501及国内白羽肉鸡株HN0001处在同一大的分支;而另外3个分离株则各自形成独立的分支,表明其gp85基因发生了较大变异。本研究表明,19个分离株与国内早期肉鸡分离株亲缘关系较远,提示我国当前蛋鸡ALV-J株可能并非源自国内早期肉鸡ALV-J株,其来源有待进一步研究。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2011年05期）
吴晓平[7]（2010）在《商品蛋鸡源J亚群禽白血病病毒分离株生物学特性研究》一文中研究指出J亚群禽白血病病毒(avian leukosis virus subgroup J, ALV-J)首次分离于上个世纪80年代,系外源性ALV与宿主内源性序列EAV-HP的重组体。近年来,该病在我国养鸡业中呈流行趋势。由于诱发肿瘤、患鸡胴体废弃和引起免疫抑制,ALV-J给养禽业带来巨大经济损失和严重威胁。ALV-J在中国的一个重要的发病特点是致瘤宿主谱系的扩展,以往研究证实不易发生肿瘤的商品蛋鸡受到ALV-J感染后也能诱导较高的肿瘤发生率,同时研究证实中国的地方鸡种也可感染致瘤,表现出不同于国际上ALV-J感染的特殊性和复杂性。研究ALV-J的生物学特性及致瘤宿主谱扩展的机理有助于该病的控制与根除。本研究对ALV-J引起的商品蛋鸡血管瘤、髓细胞瘤的组织病理学变化进行了观察,对表现血管瘤、髓细胞瘤病的商品蛋鸡分离的ALV-J毒株进行了分离和鉴定,对不同鸡群的ALV-J前病毒基因组序列的变异规律进行了分析,对商品蛋鸡ALV-J受体进行了分离鉴定,为探索ALV-J致病机理提供了新材料。为弄清商品蛋鸡群中血管瘤的病毒感染和致瘤原因,本研究对送检的ALV-J疑似病例进行了剖检、病理学观察、免疫组化检测及ALV-J特异性RT-PCR检测,发现商品蛋鸡血管瘤型ALV-J病例在海兰褐送检样品中的比率为54.5%(6/11),在罗曼蛋鸡送检样品中比率为100%(2/2),白羽蛋鸡群中未发现感染病例。而感染的商品蛋鸡所表现出的主要肿瘤类型是单纯血管瘤以及血管瘤与髓样细胞瘤(ML)并存,各占44.4%(4/9)大体病变：体表及肝脏、脾脏、肾脏、肌胃等器官表面及切面可见大小不等的血管瘤,内含血液,部分病例内脏可见黄白色结节；组织学病变：脾脏、肝脏等器官可见典型的海绵状血管瘤,有或无清晰壁层,处于不同的发育阶段,部分病例的体表血管瘤壁层可见髓细胞浸润,部分病例在心脏、肝脏、脾脏或肾脏内出现数量不等的髓样细胞增生,表现为实体瘤或髓样细胞浸润。1个病例的肾脏中存在胞浆中含有嗜碱性颗粒的成髓细胞瘤。在血管瘤与ML并存的病例中,两种肿瘤的发育阶段存在差异,可能是相继发生。免疫组织化学检测发现：在肝脏、脾脏及其它组织内的髓细胞内、肝脏实质细胞、血管瘤壁层上皮细胞、脾脏网状细胞内可见阳性信号。因此,在褐色商品蛋鸡中发现血管瘤、髓细胞瘤型伴发多种肿瘤表型的J亚群禽白血病,在国内外尚属首次报道,显示出ALV-J在我国商品蛋鸡群中感染状况的特殊性和严重性。将病理学检测及ALV-J特异性RT-PCR初步诊断为商品蛋鸡血管瘤、髓细胞瘤型ALV-J感染的脾脏样品悬液分别接种单层DF1细胞以分离病毒,并以ALV-J特异性单抗JE9进行间接免疫荧光检测(IFA)对分离毒进行鉴定,结果证实从商品蛋鸡血管瘤、髓细胞瘤型J亚群禽白血病病例中分离到7株ALV-J,在初诊为ALV-J感染的病例中分离率为77.8%(7/9)为追溯病毒来源,对于所检测的6个血管瘤发病鸡场的共同父母代蛋鸡场进行ALV-J的ELISA检测,结果发现在此父母代蛋鸡场高日龄的鸡群中存在14%(36周龄)和31%(60周龄)ALV-J特异性抗体,证实在此临床表现正常的父母代蛋鸡场中存在ALV-J感染。父母代蛋鸡及商品蛋鸡感染ALV-J的临床表现不同,可能是由于遗传背景对于ALV-J感染应答的影响或者是垂直传播及水平传播的共同作用在蛋鸡繁殖育雏过程中放大了ALV-J的感染。本研究设计3对ALV-J特异性引物,以分离株感染的DF1细胞基因组作为模板,进行ALV-J前病毒DNA全基因序列进行分段PCR扩增,分析比较了2007-2009年的商品蛋鸡分离株NHH、JS09GY3、JS09GY6的全序列,JS09GY2、JS09GY5、HA08和HN的致瘤关键性序列,同时也对白羽肉鸡分离株SD9901、YZ9901、YZ9902、NM2002-1和JS-nt的全序列进行比较和遗传分析。结果表明：商品蛋鸡群分离毒株与肉鸡群分离毒株的全序列差异明显,在遗传进化树上分属两个大的分支；对LTR的分析可见,R区最保守,U3区最易变异,商品蛋鸡血管瘤型分离株NHH和JS09GY5的U3区域发生了不同的连续序列缺失。分析发现在商品蛋鸡血管瘤相关病例分离毒(NHH、JS09GY2、JS09GY3、JS09G5及JS09GY6)的U3区内含有几个独特的调控元件,包括CEBP、c-Ets-1、TCF11,而其它一部分在肉鸡分离毒中较为保守的作用元件如GKLF和Lmo2在商品蛋鸡分离株中缺失,提示这些独特的调控元件的存在或者缺失可能与病毒的致肿瘤特性相关。序列分析还发现：PBS-Leader序列在所测的ALV-J毒株中高度保守,然而商品蛋鸡血管瘤型分离株JS09GY3与JS09GY6的PBS-Leader序列中有一段极为罕见的连续19bp的插入突变,这段序列只在RAV-1、RAV-2及RSV-SRB毒株中可见,说明这两株病毒可能是ALV-J与其它反转录病毒发生重组而产生,这种重组模式尚属首次报道；E元件在所有的中国肉鸡分离株及蛋鸡单纯ML病例分离株HA08均发生了几乎相同的大部分序列缺失,仅蛋鸡分离株HA08与肉鸡分离毒相同,说明蛋鸡中ALV-J可能部分来源于肉鸡,而商品蛋鸡分离毒NHH、JS09GY2、JS09GY5、JS09GY6和SD07LK1则完整保留E元件,值得注意的是商品蛋鸡分离毒JS09GY3的E元件中含有11bp的连续插入序列,这种E元件中的连续序列插入突变在ALV-J中尚属首次发现；不同年代分离株的序列分析还发现：non-functional TM序列逐渐缺失,说明这种变异可能与病毒进化相关；DR1的同源性与宿主类型表现出一定的相关性,蛋用型或肉用型宿主中分离株的DR1序列中往往发生各自相同的点突变。对ALV-J毒株的编码区的序列进行分析比对发现：pol基因保守性极强,而gag基因所编码的P10、P19和P15蛋白序列中各有一个较为明显的突变集中区,而且在某些位点上的突变与宿主类型有关。中国白羽肉鸡分离毒的gp85蛋白相互之间同源性很高,遗传距离较近；商品蛋鸡分离毒gp85之间却显示出进化的不平衡性：小部分毒株与白羽肉鸡分离毒遗传距离较近；部分毒株(特别是分离自临床单纯血管瘤肿瘤表型病例的毒株,如NHH)与黄羽肉鸡分离毒同源性较高,变异性较强；同时发现大部分的商品蛋鸡混合肿瘤表型病例分离毒株高度变异,与肉鸡分离毒的同源性较低,在遗传进化树中属于独立的分支。gp37保守性较高,对gp37胞浆区的调控区域预测发现env蛋白的转化潜力与分离宿主之间没有明显的相关性。为了检测商品蛋鸡细胞表面的ALV-J受体与DF1细胞表面ALV-J受体chNHE1是否存在差异,以及商品蛋鸡ALV-J亲嗜性组织细胞-心脏细胞与ALV-J抗性细胞-淋巴细胞表面的ALV-J受体的存在与否,本研究以PCR方法扩增来源于商品蛋鸡的分离毒JS09GY3的SU基因序列,包涵其信号肽序列,同时以RT-PCR方法从兔血细胞RNA中扩增IgG Fc片段的重链,并将两段序列以BamHI酶切位点进行连接,克隆入pcDNA3.1中,构建真核表达载体pcDNA3.1-SUJ-IgGFc;以磷酸钙转染法转染293细胞；以RT-PCR、免疫荧光、Western Blot、SDS-PAGE等方法检测和鉴定融合蛋白。结果表明,在293细胞内和培养上清中均得到融合蛋白SUJ-IgGFc的暂态表达,用竞争ELISA方法检测表达浓度,结果表明,在细胞表达上清中的融合蛋白浓度达到约155ng/ml。本研究从商品蛋鸡的脾脏和外周血中提取淋巴细胞,并取心脏心室部分组织,以膜蛋白提取试剂盒提取膜蛋白,以293细胞作为对照。以融合蛋白SUJ-IgGFc-Beads结合物为工具,以免疫共沉淀的方法从膜蛋白中捕获与ALV-JSU蛋白特异性结合的蛋白质,经过SDS-PAGE检测,结果发现在商品蛋鸡淋巴细胞膜蛋白和心脏细胞膜蛋白中捕获到的蛋白不同,其中在淋巴细胞膜蛋白获得约58KD和65KD的两个蛋白条带,而在心脏细胞膜蛋白中获得了与chNHE1分子量相符的蛋白和其它3个蛋白条带。这一有意义的发现初步揭示了不同细胞表面可与SUJ特异结合的蛋白可能存在不同,尚需要进一步的鉴定。1.本研究首次报道商品蛋鸡血管瘤、髓细胞瘤型ALV-J感染并进行了病毒分离鉴定。2.对分离自不同类型鸡群的ALV-J毒株的病毒cDNA全基因序列进行分段PCR扩增及序列测定,发现商品蛋鸡分离株与肉鸡分离株的全序列在遗传进化树上属于两大分支。3.ALV-J序列中与宿主类型相关的非编码区序列主要有U3、DR1和E元件：商品蛋鸡血管瘤型分离株的U3区中有独特的调控元件即C／EBP、c-Ets-1和TCF11,而缺失多数肉鸡分离毒所具有的GKLF和Lmo2结合位点；血管瘤、ML型ALV-J的PBS-Leader序列中有19bp的连续序列插入,是ALV-J与其它逆转录病毒的重组毒；DR1序列中发现有固定的几个位点发生与宿主类型相关的点突变；商品蛋鸡血管瘤型分离株的E元件较为保守,在血管瘤、ML型分离株JS09GY3中,发现了罕见的11bp的连续序列插入突变,在国内外尚属首次报道,而肉鸡分离毒的E元件则发生了大部分序列的缺失。4.gag序列中的P10、P15和P19蛋白序列中某些位点的氨基酸突变与宿主类型有相关关系；中国肉鸡分离毒的gp85归于同一个分支中,表现出高度的同源性；而商品蛋鸡血管瘤、ML型分离株的gp85蛋白在进化树中位于一个较为独立的分支。5.构建pcDNA3.1-SUJ-IgGFc真核表达载体并在293细胞中得到SUJ-IgGFc的表达,对融合蛋白进行了定量和定性分析。以SUJ-IgGFc作为配体,以免疫共沉淀的方法捕获商品蛋鸡淋巴细胞及心脏细胞膜蛋白中能与SUJ相结合的蛋白,结果通过SDS-PAGE检测发现：在同样的免疫共沉淀条件下,在淋巴细胞膜蛋白中获得约58KD和65KD的两个蛋白条带,而在心脏细胞膜蛋白中获得了与chNHE1分子量相符的蛋白和其它3个蛋白条带。这一有意义的发现初步揭示了不同细胞表面可与SUJ特异结合的蛋白可能存在不同,尚需要进一步的鉴定。(本文来源于《扬州大学》期刊2010-04-01）
郭桂杰,孙淑红,崔治中[8]（2010）在《J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析》一文中研究指出【目的】分析我国ALV-J蛋鸡分离株的来源和进一步演变趋势。【方法】以J亚群禽白血病病毒(ALV-J)蛋鸡分离株SD07LK1感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组DNA作为其前病毒基因组模板,根据已发表序列设计合成9对引物,经PCR扩增出9段连续的、相互部分重迭的DNA片段和闭合环形前病毒两末端LTR的连接区段,并分别连入T载体进行克隆、测序。【结果】用DNAstar软件对测序结果进行剪辑和拼接,首次完成了ALV-J蛋鸡分离株SD07LK1的前病毒全基因组核苷酸序列。【结论】将该序列与另外已完成的全基因组序列的比较表明,ALV-J的整个基因组gag和pol基因相对保守,各毒株间对应基因的同源性分别在95.0%以上,env基因的同源性仅为88.6%～94.0%。(本文来源于《中国畜牧兽医学会禽病学分会鸡淋巴白血病防控技术研讨会论文集》期刊2010-03-01）
郭桂杰[9]（2009）在《J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析》一文中研究指出J亚群禽白血病病毒(Subgroup J of Avian Leukosis Virus,ALV-J)是90年代最初从商品代肉鸡中分离鉴定出来的禽白血病病毒(Avian Leukosis Virus, ALV)新的亚群,根据病毒中和试验、交叉干扰试验和基因组序列,确定它与经典的A,B,C,D,E亚型ALV不同。ALV-J主要引起肉鸡的骨髓瘤白血病(Myloid Leucosis,ML)。我国于1999年首先在肉用型鸡群分离鉴定出ALV-J的中国株。本研究以J亚群禽白血病病毒(ALV-J)蛋鸡分离株SD07LK1感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组DNA作为其前病毒基因组模板,根据已发表序列设计合成9对引物,经PCR扩增出9段连续的、相互部分重迭的DNA片段和闭合环形前病毒两末端LTR的连接区段,并分别连入T载体进行克隆、测序。然后利用DNAstar软件对测序结果进行剪辑和拼接,首次完成了ALV-J蛋鸡分离株SD07LK1的前病毒全基因组核苷酸序列。将该序列与另外已完成的全基因组序列的比较表明,ALV-J的整个基因组gag和pol基因相对保守,各毒株间对应基因的同源性分别在95.0%以上,env基因的同源性仅为88.6-94.0%。结果表明,该毒株的cDNA基因组有7734个碱基。ALV-J的主要基因和基因组功能片段是5’LTR、gag基因、pol基因、env基因、3’LTR,上述各个基因产物及基因组功能片段又包括若干个亚片段。本研究将J亚群禽白血病病毒中国蛋鸡分离株株SD07LK1与英国病毒株HPRS-103、美国病毒株ADOL-7501及中国肉鸡分离株NX0101的各基因片段做了比较(SD07LK1与HPRS-103、ADOL-7501及NX0101,以下比较均按此顺序): 5’LTR的核甘酸序列同源性为95.4%、92.6%、94.2%。5’LTR区由U3、R、U5构成,对这叁个基因片段进行比较,其同源性分别为95.5%、91.1%、93.8%;100%、100%、100%;93.6%、94.9%、93.6%。5’UTR的核甘酸序列同源性为95.5%、95.0%、96.3%。gag基因的氨基酸序列同源性为98.0%、96.6%、96.6%。gag基因负责编码病毒内部结构核衣壳蛋白,主要有:p19、p2、p10、p27、p12、p15。对gag基因的不同编码产物与HPRS-103、ADOL-7501及NX0101的相应基因序列作比较,其同源性分别为96.8%、94.8%、98.1%;100%、100%、100%;98.4%、100.0%、98.4%;100.0%、97.1%、94.1%;95.5%、96.6%、94.4%;96.8%、95.2%、99.2%。pol基因编码一种反转录酶,其氨基酸序列同源性为98.9%、99.1%、98.1%。pol基因的编码产物是RT p68和IN p32。对pol基因的不同编码产物做了比较,其同源性为99.0%、99.7%、97.9%;99.3%、97.9%、98.3%。囊膜蛋白env基因的同源性为91.6%、87.3%、91.7%。env基因由gp85基因和gp37基因组成,对其氨基酸序列作比较,同源性为89.0%、81.8%、89.3%;93.9%、93.4%、93.9%。3’UTR基因的核甘酸序列同源性为86.0%、87.9%、67.2%。3’LTR的核甘酸序列同源性为95.4%、92.0%、93.5%。3’LTR区由U3、R、U5构成,对这叁个基因片段进行比较,其同源性分别为95.6%、91.2%、92.5%;100%、100%、100%;93.6%、92.3%、94.9%。(本文来源于《山东农业大学》期刊2009-06-16）
郭桂杰,孙淑红,崔治中[10]（2009）在《J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析》一文中研究指出【目的】分析我国ALV-J蛋鸡分离株的来源和进一步演变趋势。【方法】以J亚群禽白血病病毒(ALV-J)蛋鸡分离株SD07LK1感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组DNA作为其前病毒基因组模板,根据已发表序列设计合成9对引物,经PCR扩增出9段连续的、相互部分重迭的DNA片段和闭合环形前病毒两末端LTR的连接区段,并分别连入T载体进行克隆、测序。【结果】用DNAstar软件对测序结果进行剪辑和拼接,首次完成了ALV-J蛋鸡分离株SD07LK1的前病毒全基因组核苷酸序列。【结论】将该序列与另外已完成的全基因组序列的比较表明,ALV-J的整个基因组gag和pol基因相对保守,各毒株间对应基因的同源性分别在95.0%以上,env基因的同源性仅为88.6%～94.0%。(本文来源于《微生物学报》期刊2009年03期）
蛋鸡分离株论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
对广东某蛋鸡场新城疫病毒分离株(命名GD0526)进行生物学特性研究及全基因组序列分析,结果显示该分离株具血凝活性,能被特异性新城疫病毒标准阳性血清所抑制,动物回归试验出现新城疫典型症状。该毒株MDT为43.38h、ICPI为1.73、IVPI为2.37,F基因裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株特征。抗体增长规律和免疫交叉保护试验说明该毒株免疫原性较好,能产生较高水平的抗体,对试验鸡提供很好的保护。全基因组克隆和测序分析表明该毒株全基因组长15192bp,属基因Ⅶd型,与Shangdong-02-2010株核苷酸序列具有很高的同源性,而与LaSota株的相似性较低。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
蛋鸡分离株论文参考文献
[1].谢庆华.商品蛋鸡感染禽白血病病毒的发病观察及分离株gp85基因遗传进化分析[D].广西大学.2017
[2].蔡丝丝,崔智豪,刘玲,陈亮,陈瑞爱.基因Ⅶ型新城疫病毒蛋鸡分离株的生物学特性及全基因组序列分析[J].中国家禽.2015
[3].赵钦,孙亚妮,刘宝元,谢莎,耿亚男.禽戊型肝炎病毒中国分离株对蛋鸡致病性研究[C].中国畜牧兽医学会2014年学术年会论文集.2014
[4].王琦,王永强,康忠惠,高玉龙,潘伟.蛋鸡J亚群禽白血病病毒分离株SD1009株感染性克隆的构建与病毒拯救[J].中国兽医科学.2011
[5].王琦,王永强,康忠惠,高玉龙,潘伟.蛋鸡J亚群禽白血病病毒SD1009分离株的分离鉴定及全基因组序列分析[J].中国预防兽医学报.2011
[6].潘伟,高玉龙,刘超男,秦立廷,王永强.我国部分地区蛋鸡ALV-J分离株gp85基因遗传进化分析[J].中国预防兽医学报.2011
[7].吴晓平.商品蛋鸡源J亚群禽白血病病毒分离株生物学特性研究[D].扬州大学.2010
[8].郭桂杰,孙淑红,崔治中.J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析[C].中国畜牧兽医学会禽病学分会鸡淋巴白血病防控技术研讨会论文集.2010
[9].郭桂杰.J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析[D].山东农业大学.2009
[10].郭桂杰,孙淑红,崔治中.J亚群禽白血病病毒蛋鸡分离株SD07LK1全基因组核苷酸序列的比较分析[J].微生物学报.2009