本文主要研究内容
作者郝俊霞,高梓森,高皓,毕开顺,王健,李佐静（2019）在《基于网络药理学的雷公藤肾毒性机制探讨》一文中研究指出：目的:通过建立雷公藤活性成分-作用靶点、蛋白相互作用、靶点相应的生物功能和通路网络,以及利用分子对接技术探讨雷公藤肾毒性的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和毒性与基因比较数据库(CTD)筛选出雷公藤有毒候选化合物。用有机小分子生物活性数据Pub Chem数据库,将所有的候选化合物都转化为标准的Canonical SMILES格式,将SMILES格式文件导入Swiss Target Prediction平台,进行靶点预测,将TCMSP中相应化合物的靶点作为补充,用uniprot将蛋白转换为对应的基因名称,与从人类基因组注释数据库(Gene Cards)中寻找到的肾脏相关基因蛋白进行比对,筛选出重合的蛋白作为雷公藤潜在的肾脏毒性靶点。采用Cytoscape软件构建雷公藤毒性候选成分-作用靶点网络。通过String数据库结合Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,用DAVID生物信息资源对靶点生物功能及涉及的通路进行分析,最后用Glide软件对关键蛋白与雷公藤毒性候选成分的结合进行验证。结果:雷公藤中筛选得到30种有毒候选成分,涉及209个肾脏毒性作用靶点,网络分析结果表明雷公藤可通过氨基酸代谢、磷脂代谢、儿茶酚胺类物质代谢,抑制肾脏有机阴离子转运体Oatl,Oat2,Oat3的功能,以及诱导凋亡,并参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路,JAK/STAT信号通路,血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,Toll样受体信号通路,ERBB信号通路,FcεRI信号通路,过氧化物酶体增殖剂激活受体(PPAR)信号通路等对肾脏产生毒性。结论:利用中药多成分-多靶点-多通路的特点,探究了雷公藤肾脏毒性作用机制,为进一步开展雷公藤肾脏毒性作用机制研究提供了新思路和新方法。
Abstract
mu de :tong guo jian li lei gong teng huo xing cheng fen -zuo yong ba dian 、dan bai xiang hu zuo yong 、ba dian xiang ying de sheng wu gong neng he tong lu wang lao ,yi ji li yong fen zi dui jie ji shu tan tao lei gong teng shen du xing de zuo yong ji zhi 。fang fa :tong guo zhong yao ji tong yao li xue shu ju ku yu fen xi ping tai (TCMSP)he du xing yu ji yin bi jiao shu ju ku (CTD)shai shua chu lei gong teng you du hou shua hua ge wu 。yong you ji xiao fen zi sheng wu huo xing shu ju Pub Chemshu ju ku ,jiang suo you de hou shua hua ge wu dou zhuai hua wei biao zhun de Canonical SMILESge shi ,jiang SMILESge shi wen jian dao ru Swiss Target Predictionping tai ,jin hang ba dian yu ce ,jiang TCMSPzhong xiang ying hua ge wu de ba dian zuo wei bu chong ,yong uniprotjiang dan bai zhuai huan wei dui ying de ji yin ming chen ,yu cong ren lei ji yin zu zhu shi shu ju ku (Gene Cards)zhong xun zhao dao de shen zang xiang guan ji yin dan bai jin hang bi dui ,shai shua chu chong ge de dan bai zuo wei lei gong teng qian zai de shen zang du xing ba dian 。cai yong Cytoscaperuan jian gou jian lei gong teng du xing hou shua cheng fen -zuo yong ba dian wang lao 。tong guo Stringshu ju ku jie ge Cytoscaperuan jian hui zhi dan bai xiang hu zuo yong wang lao ,yong DAVIDsheng wu xin xi zi yuan dui ba dian sheng wu gong neng ji she ji de tong lu jin hang fen xi ,zui hou yong Glideruan jian dui guan jian dan bai yu lei gong teng du xing hou shua cheng fen de jie ge jin hang yan zheng 。jie guo :lei gong teng zhong shai shua de dao 30chong you du hou shua cheng fen ,she ji 209ge shen zang du xing zuo yong ba dian ,wang lao fen xi jie guo biao ming lei gong teng ke tong guo an ji suan dai xie 、lin zhi dai xie 、er cha fen an lei wu zhi dai xie ,yi zhi shen zang you ji yin li zi zhuai yun ti Oatl,Oat2,Oat3de gong neng ,yi ji you dao diao wang ,bing can yu si lie yuan huo hua dan bai ji mei (MAPK)xin hao tong lu ,JAK/STATxin hao tong lu ,xie guan nei pi sheng chang yin zi (VEGF)xin hao tong lu ,Tollyang shou ti xin hao tong lu ,ERBBxin hao tong lu ,FcεRIxin hao tong lu ,guo yang hua wu mei ti zeng shi ji ji huo shou ti (PPAR)xin hao tong lu deng dui shen zang chan sheng du xing 。jie lun :li yong zhong yao duo cheng fen -duo ba dian -duo tong lu de te dian ,tan jiu le lei gong teng shen zang du xing zuo yong ji zhi ,wei jin yi bu kai zhan lei gong teng shen zang du xing zuo yong ji zhi yan jiu di gong le xin sai lu he xin fang fa 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国实验方剂学杂志的郝俊霞,高梓森,高皓,毕开顺,王健,李佐静，发表于刊物中国实验方剂学杂志2019年16期论文，是一篇关于网络药理学论文,雷公藤论文,肾脏毒性论文,通路分析论文,分子对接论文,中国实验方剂学杂志2019年16期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国实验方剂学杂志2019年16期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：网络药理学论文; 雷公藤论文; 肾脏毒性论文; 通路分析论文; 分子对接论文; 中国实验方剂学杂志2019年16期论文;