导读:本文包含了位置关联权重矩阵论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:位置关联权重矩阵,多样性增量,支持向量机,剪接位点
位置关联权重矩阵论文文献综述
李琴,张瑾,骈聪,陈园园,李强[1]（2014）在《基于位置关联权重矩阵及序列组分的多样性增量识别剪接位点》一文中研究指出前体mRNA的剪接是真核基因表达的关键阶段,识别剪接位点对基因表达也起着至关重要的作用。作者用紧邻与非紧邻的位置关联权重矩阵及组成分的多样性增量得到的五维特征向量来表示序列,应用支持向量机对供体位点和受体位点进行识别。采用5-fold交叉检验,得到供体和受体位点的马修斯相关系数分别为0.924和0.947,ROC曲线下面积分别为99.08%和99.54%。与一些传统方法相比,这一方法考虑了位点之间的相关性和序列的生物信息,表现出特征少、精度高等优点。(本文来源于《生物物理学报》期刊2014年05期）
张鹏飞,李前忠,左永春,李涛[2]（2010）在《基于位置关联权重矩阵及DNA结构信息预测人类剪接位点》一文中研究指出人类剪接位点的识别是当前研究的一个重要课题.根据人类剪接位点附近区域的保守性,以位置关联权重矩阵及DNA结构信息作为特征输入参数,应用支持向量机(SVM)对人类基因组中的供体端和受体端剪接位点做了预测.对于供体端,5-fold交叉检验总体预测精度为92.55%,3-way data split检验总体预测精度为92.25%;受体端5-fold交叉检验总体预测精度为90.70%,3-way data split检验总体预测精度为89.87%.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2010年04期）
杨科利,许强[3]（2008）在《基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点》一文中研究指出基于已知的酵母转录因子结合位点数据资料,构建转录因子结合位点碱基关联二联体位置权重矩阵,整合碱基关联二联体位置权重矩阵和碱基保守性参量M2i,提出一种新的预测转录因子结合位点的方法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validation两种方法对此算法进行检验,均获得了较高的预测成功率,结果表明9种转录因子结合位点的总体预测成功率超过81%,明显高于单碱基位置权重矩阵,同时与已有预测转录因子结合位点的软件进行比较,核苷酸水平上的关联系数和结合位点水平上的关联系数分别达到0.42和0.52,优于现有预测方法.(本文来源于《生命科学研究》期刊2008年02期）
林昊,李前忠[4]（2007）在《基于位置关联权重矩阵的大肠杆菌启动子预测》一文中研究指出对实验证实的683条大肠杆菌sigma70启动子的序列进行保守性计算分析,获得四个保守的区域-10区域是启动子最保守的功能元件,-35区域、转录起始位点附近及启动子上游UP单元.从保守区中选取M6(l)值较大的10个保守位点的六联体频数作为参数、引入伪计数构建位置权重矩阵,利用位置关联打分函数对683条sigma70启动子进行预测.负集分别从编码区和非编码区选取700条序列进行算法检验,获得很好的结果,敏感性分别为91%和90%.进而利用位置关联打分函数对大肠杆菌整条序列进行搜索,获得1567条预测序列.这些序列可能是实验未测定的启动子序列.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2007年02期）
位置关联权重矩阵论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
人类剪接位点的识别是当前研究的一个重要课题.根据人类剪接位点附近区域的保守性,以位置关联权重矩阵及DNA结构信息作为特征输入参数,应用支持向量机(SVM)对人类基因组中的供体端和受体端剪接位点做了预测.对于供体端,5-fold交叉检验总体预测精度为92.55%,3-way data split检验总体预测精度为92.25%;受体端5-fold交叉检验总体预测精度为90.70%,3-way data split检验总体预测精度为89.87%.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
位置关联权重矩阵论文参考文献
[1].李琴,张瑾,骈聪,陈园园,李强.基于位置关联权重矩阵及序列组分的多样性增量识别剪接位点[J].生物物理学报.2014
[2].张鹏飞,李前忠,左永春,李涛.基于位置关联权重矩阵及DNA结构信息预测人类剪接位点[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2010
[3].杨科利,许强.基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点[J].生命科学研究.2008
[4].林昊,李前忠.基于位置关联权重矩阵的大肠杆菌启动子预测[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2007