刘源:加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制论文

刘源:加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制论文

本文主要研究内容

作者刘源,隋正红,刘昊昕(2019)在《加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制》一文中研究指出:链状亚历山大藻(Alexandrium pacificum)作为典型的产毒赤潮甲藻,分布广泛,而对其爆发性生长的研究将有助于探究由其引发的赤潮的分子机制。本研究通过模拟赤潮爆发的条件对链状亚历山大藻进行表达谱测序,利用表达谱测序后得到的基因表达量数据,采用加权基因共表达网络(WGCNA)构建方法探究链状亚历山大藻的爆发性生长的分子机制。通过计算基因间表达量的相关性得到了35个基因共表达模块,将基因共表达模块与链状亚历山大藻爆发性生长性状相关联,在爆发性生长阶段,有6个显著性相关的模块,基于KEGG及GO功能富集分析,这些模块涉及蛋白质的加工合成、核糖体的合成,电子传递,碳水化合物代谢等过程,表明了细胞代谢能力的提升,为细胞增殖提供了物质基础。此外有大量的未知功能的枢纽基因被发现,基因模块可以用于推测这些基因的功能,从而为以后挖掘新基因,探究潜在的调控机制提供了基础。

Abstract

lian zhuang ya li shan da zao (Alexandrium pacificum)zuo wei dian xing de chan du chi chao jia zao ,fen bu an fan ,er dui ji bao fa xing sheng chang de yan jiu jiang you zhu yu tan jiu you ji yin fa de chi chao de fen zi ji zhi 。ben yan jiu tong guo mo ni chi chao bao fa de tiao jian dui lian zhuang ya li shan da zao jin hang biao da pu ce xu ,li yong biao da pu ce xu hou de dao de ji yin biao da liang shu ju ,cai yong jia quan ji yin gong biao da wang lao (WGCNA)gou jian fang fa tan jiu lian zhuang ya li shan da zao de bao fa xing sheng chang de fen zi ji zhi 。tong guo ji suan ji yin jian biao da liang de xiang guan xing de dao le 35ge ji yin gong biao da mo kuai ,jiang ji yin gong biao da mo kuai yu lian zhuang ya li shan da zao bao fa xing sheng chang xing zhuang xiang guan lian ,zai bao fa xing sheng chang jie duan ,you 6ge xian zhe xing xiang guan de mo kuai ,ji yu KEGGji GOgong neng fu ji fen xi ,zhe xie mo kuai she ji dan bai zhi de jia gong ge cheng 、he tang ti de ge cheng ,dian zi chuan di ,tan shui hua ge wu dai xie deng guo cheng ,biao ming le xi bao dai xie neng li de di sheng ,wei xi bao zeng shi di gong le wu zhi ji chu 。ci wai you da liang de wei zhi gong neng de shu niu ji yin bei fa xian ,ji yin mo kuai ke yi yong yu tui ce zhe xie ji yin de gong neng ,cong er wei yi hou wa jue xin ji yin ,tan jiu qian zai de diao kong ji zhi di gong le ji chu 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国海洋大学学报(自然科学版)的刘源,隋正红,刘昊昕,发表于刊物中国海洋大学学报(自然科学版)2019年09期论文,是一篇关于链状亚历山大藻论文,赤潮论文,基因共表达模块论文,枢纽基因论文,中国海洋大学学报(自然科学版)2019年09期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国海洋大学学报(自然科学版)2019年09期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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