质谱数据库论文-林伟杰,梁祈,詹若挺,汪瑾彦

质谱数据库论文-林伟杰,梁祈,詹若挺,汪瑾彦

导读:本文包含了质谱数据库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:质谱数据库,中成药,保健品,壮阳类

质谱数据库论文文献综述

林伟杰,梁祈,詹若挺,汪瑾彦[1](2018)在《质谱数据库法快速筛查壮阳类中成药和保健品中12种非法添加化学成分》一文中研究指出采用叁重四极杆质谱和四极杆飞行时间质谱两台仪器建立了具有一定通用性的壮阳类中成药和保健品中12种非法添加化学成分的质谱数据库,并建立了壮阳类中成药和保健品的快速筛查方法。依托质谱数据库中结构类似物的特征碎片离子,能把检测的范围覆盖到经结构修饰改造的类似物。在无对照品的情况下利用质谱数据库的数据资源依然可以对大量的样品进行初步筛查。(本文来源于《理化检验(化学分册)》期刊2018年08期)

王建高,张永艳[2](2018)在《青岛发布商用化生物组学微生物质谱数据库》一文中研究指出科技日报青岛7月18日电 (王建高 通讯员张永艳)7月18日,青岛市科技局发布,由青岛市工研院在孵企业融智生物科技(青岛)有限公司建设完成了基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用化生物组学微生物质谱数据库。拥有先进科学(本文来源于《科技日报》期刊2018-07-19)

操秀英[3](2018)在《全球首个商用生物组学微生物质谱数据库建成》一文中研究指出科技日报讯 (操秀英)融智生物科技(青岛)有限公司(以下简称“融智生物”)近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。据介绍,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已广泛应(本文来源于《科技日报》期刊2018-07-03)

魏来[4](2017)在《肽段质谱响应曲线数据库的建立和应用》一文中研究指出准确的蛋白定量是精确描述生物体物质调控过程的基础。作为最具潜力的蛋白定量工具,质谱具备高敏感度和高通量的特性,在大数据时代有着广阔的应用前景。质谱定量的常用模式包括基于一级质谱(MS1)肽段离子的离子流色谱峰(XIC)模式和基于二级质谱(MS2)碎片离子的多反应监测(MRM)模式。两种模式中,通常都利用肽段/碎片的谱峰面积代表蛋白的实际量,因此定量肽段/碎片应具备良好的质谱响应线性,以及足够高的质谱响应强度。研究表明,不同肽段的信号强度可以相差100倍,它们随上样量变化生成的质谱响应曲线也各不相同。因此,需要对定量肽段进行筛选。选择好的定量肽段有两种方式,一是根据模型预测,二是根据实验选择。现有工具及数据库通常是基于预测模型,对肽段离子的质谱响应线性不够重视,因此选用肽段的定量值会与蛋白实际量有较大差距。为了填补肽段离子质谱响应曲线数据库工具的缺乏,文中针对哺乳动物蛋白质组开发了一个高覆盖率的实验质谱响应曲线数据库,并建立起肽段质谱响应曲线评价机制。该数据库涵盖121,318条肽段离子的实验质谱响应曲线和2,647,773条碎片离子的实验质谱响应曲线,总计覆盖11,040个基因产物。为了高效、全面地覆盖蛋白、肽段及碎片,实验选取了具有代表性的He La细胞进行全蛋白酶解制备样品。又因核蛋白占比小、相对丰度低,难以检测和覆盖到,又对其单独进行了富集后酶解并制备样品。这两个样品不断做倍比稀释并送入质谱检测,最后得到了He La细胞全蛋白的肽段/碎片质谱响应曲线数据集和He La细胞核蛋白的肽段/碎片质谱响应曲线数据集。得到数据集后,我们根据肽段质谱响应曲线的线性、斜率、高线性区间和低丰度检测阈值设计打分函数描述肽段/碎片的定量能力。对于每一个蛋白检测到的所有肽段,打分函数都给出打分并进行排序,如此在定量中就可以使用分数最高的一个或几个肽段(最佳响应肽段,Best Responder,BR)来定量。相同样品叁次重复定量实验结果显示:1)BR叁次定量值的变异系数中位数更小,说明使用BR定量的稳定性要好于i BAQ方法(金标准)。2)BR叁次实验间的相关系数更高,从另一方面证明BR定量的可重复性优于i BAQ。3)分数越高的肽段,叁次定量值的变异系数的中位数越小,说明分数越高稳定性越好。在相同基质背景下,相同样品不同浓度的相对定量结果显示:BR相对定量的比值较i BAQ更为收敛。因此,不论是相同浓度还是不同浓度,简单样品环境还是复杂样品环境,BR的定量结果都更为稳定。UPS2是蛋白质组学动态范围标准集合,包含6个丰度量级的共48个蛋白。UPS2定量实验结果显示:BR定量值与已知蛋白量的相关系数(R2=0.907)高于Max Quant i BAQ定量值与已知蛋白量的相关系数(R2=0.886);低丰度蛋白的BR定量值与已知蛋白量的相关系数(R=0.883)更是明显高于i BAQ定量值与已知蛋白量的相关系数(R=0.689),体现出BR在低丰度蛋白定量方面的明显优势。为了方便最佳响应肽段/碎片的选取,我们以前述两个数据集为基础建立了网站(http://www.firmiana.org/responders)。为了测试BR对于有标绝对定量的适用性,我们通过所建立的网站挑选了叁羧酸循环、脂代谢以及葡萄糖代谢等重要通路上的32个代谢蛋白的最佳响应肽段设计合成了一个Qcon CAT蛋白。Qcon CAT蛋白的酶解实验结果表明:所有Qcon CAT酶解肽段的信号强度均分布在一个数量级之内;而实验室常见的天然重组蛋白Zscan21的酶解肽段中,肽段信号强度最大可相差10,000倍。因此可以认为来自不同蛋白的BR之间信号强度相近,对不同生理/病理条件下蛋白的绝对定量较普通肽段更为完整和准确,更适于构建Qcon CAT。Qcon CAT有标绝对定量心肝肺胃实验结果显示:1)高度保守的叁羧酸循环中,有5个蛋白在心、肝、肺和胃之间有显着差异;2)叁羧酸循环中,底物与细胞质交换积极的蛋白丰度更高。得到的代谢通路化学计量图定量揭示了每个器官对不同主要代谢通路的选择性强化。综上,我们通过稀释实验质谱检测得到了蛋白质组级别的质谱响应曲线数据集,在此基础上给出了肽段/碎片的打分函数。之后验证了最佳响应肽段在不同高效液相环境和不同样品环境下的通用性和一致性,以及使用最佳响应肽段定量的准确性和可重复性。最后根据最佳响应肽段的特性,尝试了其在有标绝对定量中的应用,通过挑选最佳响应肽段,合成Qcon CAT蛋白,验证了最佳响应肽段信号强度的同质性,使用Qcon CAT绝对定量得到的化学计量图直观描述了四个器官对重要代谢通路的选择性强化。证明了本方法广泛的实用性。(本文来源于《中国人民解放军军事医学科学院》期刊2017-05-29)

王志斌[5](2017)在《农药高分辨质谱数据库的建立及应用研究》一文中研究指出通过对大量采集数据进行有效分析,从而实现对有害化学物质的筛查与识别,一直是食品安全与检测领域所面临的挑战。本论文利用高效液相色谱-高分辨四级杆飞行时间质谱(HPLC-QTOF-MS)建立了多种农药的精确质量数数据库和全扫描碰撞能量诱导裂解(CID)碎片离子高分辨参考质谱图数据库,并以此为基础建立了果蔬样品中农药化合物快速识别和多信息点予以确证的多残留快速筛查技术。通过选用两种高分辨飞行时间质谱及数据库管理软件,利用农药标准品参考物分别建立了包括427种农药化学品的ESI+模式MS~1精确质量数数据库和全扫描CIDMS~2碎片离子高分辨谱图库,同时对影响数据库应用的精确质量数准确度、色谱保留时间和碰撞能量等因素进行了分析,为非靶向农药残留物筛查奠定了方法基础,并利用不同质谱工作模式,建立了两种不以农药标准品为参考,而基于精确质量数数据库和全扫描碎片离子参考谱图库的果蔬样品中多农残快速筛查方法。方法一利用HPLC-QTOF-MS建立了基于MS~1识别和MS~2确证相结合的快速筛查方法。该方法中,每个样品需进行两次数据采集:首先利用HPLC-QTOF-MS的全质量数扫描模式,对样品中可能存在的农药残留进行一级精确质荷比扫描,并将采集数据与建立的MS~1精确质量数数据库进行比较,找出疑似阳性结果;然后利用HPLCQTOF-MS的目标二级扫描模式对疑似阳性结果进行CID碎片离子高分辨质谱扫描,与已建立的碎片离子高分辨参考谱图库进行比对,实现对结果的准确确证。本方法结合传统的SPE样品制备技术,以黄瓜和橙子两种实际样品为代表,通过优化检索参数,对其中317种农药进行了筛查方法验证,结果表明,其中266种农药(占83.9%)的筛查限SDLs≤10μg/kg,且在50μg/kg的添加水平下,假阴性率仅为4.7%,同时各农药的确证识别限(LOIs)≤10μg/kg的占77.6%,LOI s≤50μg/kg的占83.9%,满足日常农药残留检测的要求。方法二利用UHPLC-TripleTOFTM-MS基于人工智能碎片离子扫描方式,建立了仅需一次进样即可实现多种农药残留化合物的精确质荷比识别和高分辨碎片离子确证的快速筛查方法。方法采用信息关联采集(information dependent acquisition,IDA)模式,通过一次进样分析,实现全质荷比范围(100-1 000)内一级高分辨质谱采集和全扫描高分辨碎片离子质谱数据采集,通过与创建的包括1 700多张高分辨CID质谱图的数据库比对,实现可不依赖农药标准品参考物的快速筛查,并探讨了全扫描一级精确质荷比数据在目标化合物定量中的适用性。定性筛查方法验证结果表明,所有测试样品,对于数据库包括的427种农药,有93.2%(97.4%)的农药SDLs≤10μg/kg(50μg/kg),且其中84.8%的碎片离子可以通过与创建的参考谱图数据库进行比对而得以确证。定量方法验证结果表明,对于经常检出的106种农药,大部分农药线性范围为5-500μg/kg,在苹果,柑橘,番茄和菠菜四种基质中,10和100μg/kg两种添加水平下,回收率在80%-110%范围内的农药分别占88.7%和86.8%,全部添加样品回收率的相对标准偏差(RSD,n=12)小于20%的农药分别占94.3%(10μg/kg)和98.1%(100μg/kg),表明定量性能良好。经实际样品验证后,本论文利用已建立的两种筛查方法,对市售2 583个水果蔬菜样品进行了高通量多农药残留的筛查,在其中1 869个样品中检出农药残留结果5607个,并对筛查结果进行了分析。结果表明,本论文提出的筛查方法成本低廉,省时高效,是一种可用于日常大范围多类型农药残留监测的有力手段。(本文来源于《燕山大学》期刊2017-05-01)

尹吉澧,孟佳明,樊盛博,迟浩,刘超[6](2015)在《pLink:基于交联质谱的数据库搜索方法的研究》一文中研究指出交联质谱技术将质谱技术与交联技术相结合,为研究蛋白质的叁维结构与蛋白质间的相互作用提供了新的技术手段。本课题组在已有工作的基础上研发了应用于化学交联技术的二肽交联鉴定软件系统p Link[1],并于2012年发表在Nature Methods期刊上。p Link软件针对高精度数据,深入挖掘交联质谱谱图离子特征,设计实现了整套高效的算法,包括开放式搜索策略、多种打分设计、E-value的计算、假发现率控制,是目前交联鉴定搜索引擎中的佼佼者。在应用范围上,根据交联试剂的不同,交联质谱鉴定可以适用于不同的研究方向,比如对生物体内真实环境的二硫键交联蛋白质的研究。截至2015年7月30日,p Link[1]共有注册下载用户448名,其中国内143,国外305。用户利用pL ink软件在Nature等期刊上发表了一系列重要文章[2-6]。经过两年的发展,本课题组利用一种高效的索引技术和基于半监督学习的多特征重打分方法,改进了原交联蛋白鉴定软件p Link,成功地加速了交联二肽的鉴定过程,并提升了鉴定的精度。新版p Link在交联质谱技术的各个环节上进行了优化,克服了过去的交联鉴定软件存在的一些缺点。一方面,针对大数据库在交联情况下组合爆炸的问题,采用多种索引结构,逐层鉴定两条肽段,大大缩小了候选肽的规模,在保证精度的同时极大地提高了鉴定速度,多个数据集测试后都有至少10倍以上的加速。另一方面,设计了基于线性支持向量机的多特征机器学习打分系统,并采用分开过滤策略,提高了交联谱图鉴定率。(本文来源于《中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集》期刊2015-10-16)

董新凤,左书梅,刘中林,孙汉文[7](2015)在《农药/鼠药色谱-质谱数据库的构建》一文中研究指出据统计,我国使用的农药中有机磷类大约占70%,其中剧毒、高毒又占70%。由于有机磷农药的高效性和持久性,其不规范使用造成了很大的安全隐患,特别是蔬菜和果品更为严重,中毒事件时有发生。急性有机磷农药中毒是我国最常见的急性中毒之一,居农药中毒首位,中毒后病势凶险,病人可在短期内迅速死亡。2006年河北省共发生1 622例农药中毒事件,死亡64例[1];2007年-2011年济南市共发生3(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2015年09期)

权勤波,王金凤,李娜,李俊卿,陈金泉[8](2015)在《用替代对照品法和质谱数据库快速筛查保健品或中成药中添加镇静安神类药品》一文中研究指出目的:建立中成药及保健品中添加镇静安神类化学药品的HPLC-DAD及HPLC-MS/MS分析方法,建立HPLC-DAD数据库及二级质谱库,并应用分析。方法:HPLC-DAD法采用Agilent ZORBAX Eclipse Plus C8(4.6 mm×150 mm,5μm)色谱柱,0.02 mmol·L-1磷酸二氢钾-甲醇(95∶5)为流动相,流速1.0 m L·min-1;HPLC-MS/MS法采用Shim-Pack VP-ODS(150 mm×2.0 mm,5μm)色谱柱,0.1%甲酸-乙腈为流动相,梯度洗脱,流速0.3 m L·min-1,质谱检测器以正离子和MRM方式进行检测。样品以甲醇为溶剂,超声提取。结果:HPLC-DAD法采用有效相对保留时间和紫外光谱相似度双指标进行定性准确可靠,相对校正因子法回收率98%~105%。优化HPLC-MS/MS条件,确定了定性离子及建立质谱库的最佳质谱条件。结论:该法快速准确,适用于中成药及保健品中非法添加镇静安神类化学药的质量监控,为替代对照品法及二级质谱库在此类研究中提供依据。(本文来源于《药物分析杂志》期刊2015年01期)

李楠,刘文森,刘林娜,郝镯,李树民[9](2014)在《MALDI-TOF质谱技术及Biotyper数据库在养殖场空气微生物鉴定中的应用》一文中研究指出以16SrRNA测序法为标准方法,利用MALDI-TOF质谱技术及Biotyper数据库对某猪场210株空气分离株进行鉴定及准确率分析。结果显示91.0%的菌株被准确鉴定到种水平,95.7%被准确鉴定到属水平。研究表明MALDI-TOF质谱技术可以快速准确检测空气微生物,为养殖场环境质量监测提供了新的技术支持。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2014年12期)

金雁,刘瑜,李晓东,赵颖,蒋施[10](2014)在《液相色谱-串联质谱负离子模式数据库的构建及对水产品中多种兽药的筛查检测》一文中研究指出建立水产品中兽药的液相色谱-串联质谱复合线性离子阱系统EPI扫描方式的数据库及筛查分析方法。7种兽药的最低检出限(LOD,S/N≥3)5μg/kg,最低定量限(LOQ,S/N≥10)10μg/kg。每种兽药添加10μg/kg、50μg/kg、100μg/kg 3个水平到空白基质中(n=6),回收率为83.2%~105.8%,相对标准偏差(RSD)为4.9%~10.2%。方法除两对离子对、保留时间外,利用子离子比对进行化合物的真伪鉴定,可以有效的排除假阳性。数据库建立过程简单快捷,借助离子阱的富集功能,实现对水产品样本中多种兽药残留的定性定量分析,且具有灵敏、准确的特点。(本文来源于《沈阳师范大学学报(自然科学版)》期刊2014年04期)

质谱数据库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

科技日报青岛7月18日电 (王建高 通讯员张永艳)7月18日,青岛市科技局发布,由青岛市工研院在孵企业融智生物科技(青岛)有限公司建设完成了基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用化生物组学微生物质谱数据库。拥有先进科学

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

质谱数据库论文参考文献

[1].林伟杰,梁祈,詹若挺,汪瑾彦.质谱数据库法快速筛查壮阳类中成药和保健品中12种非法添加化学成分[J].理化检验(化学分册).2018

[2].王建高,张永艳.青岛发布商用化生物组学微生物质谱数据库[N].科技日报.2018

[3].操秀英.全球首个商用生物组学微生物质谱数据库建成[N].科技日报.2018

[4].魏来.肽段质谱响应曲线数据库的建立和应用[D].中国人民解放军军事医学科学院.2017

[5].王志斌.农药高分辨质谱数据库的建立及应用研究[D].燕山大学.2017

[6].尹吉澧,孟佳明,樊盛博,迟浩,刘超.pLink:基于交联质谱的数据库搜索方法的研究[C].中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集.2015

[7].董新凤,左书梅,刘中林,孙汉文.农药/鼠药色谱-质谱数据库的构建[J].中国卫生检验杂志.2015

[8].权勤波,王金凤,李娜,李俊卿,陈金泉.用替代对照品法和质谱数据库快速筛查保健品或中成药中添加镇静安神类药品[J].药物分析杂志.2015

[9].李楠,刘文森,刘林娜,郝镯,李树民.MALDI-TOF质谱技术及Biotyper数据库在养殖场空气微生物鉴定中的应用[J].中国兽医学报.2014

[10].金雁,刘瑜,李晓东,赵颖,蒋施.液相色谱-串联质谱负离子模式数据库的构建及对水产品中多种兽药的筛查检测[J].沈阳师范大学学报(自然科学版).2014

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