导读:本文包含了链交换反应论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:DNA甲基化,5-甲基胞嘧啶,DNA链交换反应,检测
链交换反应论文文献综述
许琛[1]（2016）在《基于链交换反应的DNA甲基化检测方法研究》一文中研究指出5-甲基胞嘧啶是生物体内最为常见的修饰碱基,也是表观遗传学的重要组成部分。胞嘧啶的甲基化修饰可通过抑制转录因子与基因序列的结合和吸引蛋白来调控基因的表达并可引发基因沉默。基因启动子区域的CpG岛的异常超甲基化现象在正常细胞中相对少见,但却广泛存在于许多种类的肿瘤细胞中,是一种十分有潜力的癌症早期诊断标志。现有的甲基胞嘧啶检测手段多以亚硫酸氢钠转化、限制性内切酶切割和蛋白结合DNA这叁种方法为基础。亚硫酸氢钠法的处理转化对象是正常的胞嘧啶,若是反应不完全则会对检测结果带来较大误差,且这种方法会给DNA链造成较严重的损伤。限制性内切酶的剪切对象也是非修饰的碱基,这种相对高效、低廉的方法却受制于有限的剪切位点与酶的活性,且无法做到单碱基检测。而有蛋白参与的免疫沉淀法也同样摆脱不了对抗体特异性的高度依赖,虽能检测甲基胞嘧啶含量却无法确定甲基化修饰的位点。对甲基胞嘧啶的特异选择性、对目标样品的广泛适用性和操作的简便性是未来甲基化检测新方法的研究方向。本论文设计并证明了一种利用链交换反应检测5-甲基胞嘧啶的新方法。本方法利用甲基化修饰对胞嘧啶所在的DNA双链的局部结构的扰乱作用,设计对应序列的探针进攻这一结构改变的区域,从而根据不同的链交换结果将甲基化胞嘧啶与普通胞嘧啶区分开来。在这种5-甲基胞嘧啶引发的链交换反应中,荧光探针单链能够根据碱基序列的互补性准确识别目标检测位点。对于非甲基化胞嘧啶,其附近的双链结构稳定,探针难以取代其同源序列完成链交换。而对于甲基化胞嘧啶,甲基的存在使得其附近的双螺旋结构被扰乱、检测位点更易打开,因而探针能够成功进攻并与互补序列结合生成带有荧光的新双链结构产物。本论文研究了多种实验因素对链交换反应的影响,并根据实验结果选取最适宜的反应条件建立了一个高效的5-甲基胞嘧啶特异选择性链交换反应模型。在此基础上,本论文还研究了链交换反应对不同甲基化程度/模式的DNA序列的检测能力,并成功进行了对同一体系内多个甲基化位点的同时检测。本论文研究的以链交换反应为基础的5-甲基胞嘧啶的检测方法具有简便、低耗、高效、准确的优点。这种检测方法对5-甲基胞嘧啶具有极高的选择性,且无需对被测DNA进行任何前处理,并适用于各种不同序列。反应条件十分温和,接近生理条件。所用实验器材与试剂常见且价格低廉。(本文来源于《武汉大学》期刊2016-10-01）
冯烁[2]（2016）在《DNA纳米机器在生物检测中的应用及G-四链体Toehold结构对DNA链交换反应的影响》一文中研究指出随着DNA纳米技术的不断发展和进步,越来越多的方法出现并应用于生物检测,临床诊断,药物治疗,计算化学等领域。现代生物传感器需要高灵敏度,极大的信号增强和显着的选择性来达到检测和诊断的目的。传统的分子信标无法进行信号放大,这极大的限制了它的适用范围。利用酶,DNA酶和纳米粒子的信号放大的过程通常是相当复杂的,并限于特定的应用范围。在本文中,我们设计了自动的DNA扩增系统来构建基于传统分子信标结构的崭新的和简便的生物传感器。通过这种纳米机器的杂交扩增,这种经过改进的可扩增分子信标可以大大提高探测信号和检出限,并能应用于核酸检测,区分单碱基错配。通过引入适配体序列,这种可扩增分子信标也可以检测蛋白质和小分子,比如对β-肌动蛋白基因和凝血酶的检测。我们同时进一步证实了可扩增分子信标具有较高的灵敏度和稳定性,其扩增能力为在活细胞中检测miRNA提供了可能。可扩增分子信标的简单性和灵活性使它具有更广泛的应用前景。Toehold结构,作为链交换反应的核心,具有举足轻重的作用。研究人员针对toehold的长度,与链交换区域的距离,位置等要素做了许多工作。不过,在大多数情况下,toehold结构始终被默认为双链结构。在本论文中,我们改变了它的基本构型和链交换机理,设计了一个仅仅以DNA G-四链体为toehold结构诱导的DNA链交换反应。当反应环境中加入PEG时,这种分子拥挤试剂使得反应可以容易的发生,我们可以通过调节PEG的浓度和聚合度来控制反应,同时也可以通过改变G-四链体的结构来进行调节。同时我们还在迁移链中引入了错配的碱基,使链交换反应在水溶液中也可以顺利进行。紧接着我们还设计了基于这种特殊链交换的DNA链式扩增反应,通过G-四链体这一结构的特征实现无需荧光标记的检测体系,这种方法具有成本低,无需标记,灵敏度高和选择性强的特性,具有在DNA的纳米机器,生物传感和疾病诊断方面的应用潜力。(本文来源于《武汉大学》期刊2016-05-01）
链交换反应论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
随着DNA纳米技术的不断发展和进步,越来越多的方法出现并应用于生物检测,临床诊断,药物治疗,计算化学等领域。现代生物传感器需要高灵敏度,极大的信号增强和显着的选择性来达到检测和诊断的目的。传统的分子信标无法进行信号放大,这极大的限制了它的适用范围。利用酶,DNA酶和纳米粒子的信号放大的过程通常是相当复杂的,并限于特定的应用范围。在本文中,我们设计了自动的DNA扩增系统来构建基于传统分子信标结构的崭新的和简便的生物传感器。通过这种纳米机器的杂交扩增,这种经过改进的可扩增分子信标可以大大提高探测信号和检出限,并能应用于核酸检测,区分单碱基错配。通过引入适配体序列,这种可扩增分子信标也可以检测蛋白质和小分子,比如对β-肌动蛋白基因和凝血酶的检测。我们同时进一步证实了可扩增分子信标具有较高的灵敏度和稳定性,其扩增能力为在活细胞中检测miRNA提供了可能。可扩增分子信标的简单性和灵活性使它具有更广泛的应用前景。Toehold结构,作为链交换反应的核心,具有举足轻重的作用。研究人员针对toehold的长度,与链交换区域的距离,位置等要素做了许多工作。不过,在大多数情况下,toehold结构始终被默认为双链结构。在本论文中,我们改变了它的基本构型和链交换机理,设计了一个仅仅以DNA G-四链体为toehold结构诱导的DNA链交换反应。当反应环境中加入PEG时,这种分子拥挤试剂使得反应可以容易的发生,我们可以通过调节PEG的浓度和聚合度来控制反应,同时也可以通过改变G-四链体的结构来进行调节。同时我们还在迁移链中引入了错配的碱基,使链交换反应在水溶液中也可以顺利进行。紧接着我们还设计了基于这种特殊链交换的DNA链式扩增反应,通过G-四链体这一结构的特征实现无需荧光标记的检测体系,这种方法具有成本低,无需标记,灵敏度高和选择性强的特性,具有在DNA的纳米机器,生物传感和疾病诊断方面的应用潜力。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
链交换反应论文参考文献
[1].许琛.基于链交换反应的DNA甲基化检测方法研究[D].武汉大学.2016
[2].冯烁.DNA纳米机器在生物检测中的应用及G-四链体Toehold结构对DNA链交换反应的影响[D].武汉大学.2016