赵宇:布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测与功能富集性分析论文

赵宇:布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测与功能富集性分析论文

本文主要研究内容

作者赵宇,罗艺晨,顾国靖,李博文,李文杰,周志雄,帅学宏,伍莉,陈吉轩,黄庆洲,焦寒伟(2019)在《布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测与功能富集性分析》一文中研究指出:为进行布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测,本试验利用布鲁氏菌(Brucella)感染RAW264.7细胞后,分别运用miRanda和TargetScan软件进行差异表达的mmu-miR-671-5p靶基因的预测,预测的靶基因分别有11 953和9 252个,将预测结果取交集进行韦恩(Venn)分析,重叠部分的靶基因有3 681个;利用GO与KEGG进行功能富集性分析,再利用PicTar软件进一步对mmu-miR-671-5p的靶基因进行预测,将预测结果与Venn分析结果进一步取交集,结果显示,mmu-miR-671-5p的预测靶基因有7个;实时荧光定量PCR分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip1基因相对表达量极显著降低(P<0.01);在RAW264.7细胞中转染mmu-miR-671-5p inhibitors,分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip1基因的相对表达量极显著升高(P<0.01);对mmu-miR-671-5p与Tnfrsf1b和Tnip1的3′非翻译区(3′UTR)结合靶位点分别进行预测,结果初步表明,mmu-miR-671-5p的靶基因为Tnfrsf1b与Tnip1,其预测结合靶位点均只有1个,分别位于Tnfrsf1b和Tnip1 3′UTR全长位置的91和305 bp。本研究结果为进一步揭示mmu-miR-671-5p在布鲁氏菌感染RAW264.7细胞过程中的功能提供科学依据。

Abstract

wei jin hang bu lu shi jun jie dao de mmu-miR-671-5pde ba ji yin yu ce ,ben shi yan li yong bu lu shi jun (Brucella)gan ran RAW264.7xi bao hou ,fen bie yun yong miRandahe TargetScanruan jian jin hang cha yi biao da de mmu-miR-671-5pba ji yin de yu ce ,yu ce de ba ji yin fen bie you 11 953he 9 252ge ,jiang yu ce jie guo qu jiao ji jin hang wei en (Venn)fen xi ,chong die bu fen de ba ji yin you 3 681ge ;li yong GOyu KEGGjin hang gong neng fu ji xing fen xi ,zai li yong PicTarruan jian jin yi bu dui mmu-miR-671-5pde ba ji yin jin hang yu ce ,jiang yu ce jie guo yu Vennfen xi jie guo jin yi bu qu jiao ji ,jie guo xian shi ,mmu-miR-671-5pde yu ce ba ji yin you 7ge ;shi shi ying guang ding liang PCRfen bie yan zheng 7ge yu ce ba ji yin de xiang dui biao da liang fa xian ,Tnfrsf1byu Tnip1ji yin xiang dui biao da liang ji xian zhe jiang di (P<0.01);zai RAW264.7xi bao zhong zhuai ran mmu-miR-671-5p inhibitors,fen bie yan zheng 7ge yu ce ba ji yin de xiang dui biao da liang fa xian ,Tnfrsf1byu Tnip1ji yin de xiang dui biao da liang ji xian zhe sheng gao (P<0.01);dui mmu-miR-671-5pyu Tnfrsf1bhe Tnip1de 3′fei fan yi ou (3′UTR)jie ge ba wei dian fen bie jin hang yu ce ,jie guo chu bu biao ming ,mmu-miR-671-5pde ba ji yin wei Tnfrsf1byu Tnip1,ji yu ce jie ge ba wei dian jun zhi you 1ge ,fen bie wei yu Tnfrsf1bhe Tnip1 3′UTRquan chang wei zhi de 91he 305 bp。ben yan jiu jie guo wei jin yi bu jie shi mmu-miR-671-5pzai bu lu shi jun gan ran RAW264.7xi bao guo cheng zhong de gong neng di gong ke xue yi ju 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国畜牧兽医的赵宇,罗艺晨,顾国靖,李博文,李文杰,周志雄,帅学宏,伍莉,陈吉轩,黄庆洲,焦寒伟,发表于刊物中国畜牧兽医2019年10期论文,是一篇关于布鲁氏菌论文,细胞论文,靶基因预测论文,功能富集性分析论文,中国畜牧兽医2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国畜牧兽医2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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