郝庆玲:基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因论文

郝庆玲:基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因论文

本文主要研究内容

作者郝庆玲,景炅婕,朱芷葳,吕丽华,李鹏飞(2019)在《基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因》一文中研究指出:运用超声波监测技术,采集母牛发情期出现偏差前的第一大卵泡PDF1和出现偏差后的第二大卵泡ODF2,分别分离卵泡颗粒细胞(GCs),构建RNA文库,用Illumina2000测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGG pathway分析,经Genecards功能查询,筛选牛卵泡发育相关基因。结果表明:数据库搜索共获得35 325个基因,其中有意义的表达基因15 645个,从中筛选获得差异表达基因608个;GO分析表明,608个差异表达基因中参与生物过程的基因占60.46%,细胞组分的基因占20.08%,分子功能的基因占11.46%;KEGG pathway分析表明,608个差异表达基因通过9条信号通路参与牛卵泡发育调控(P<0.05),经Genecards功能筛选,共获得11个与牛卵泡发育密切相关的调控基因——SESN3、COL3A1、CCNE1、CAV1、CACNA1H、ITPR1、PIK3R3、MYC、PTGFR、CDK6、GAPDH,它们直接参与细胞增殖分化及信号通路调节。

Abstract

yun yong chao sheng bo jian ce ji shu ,cai ji mu niu fa qing ji chu xian pian cha qian de di yi da luan pao PDF1he chu xian pian cha hou de di er da luan pao ODF2,fen bie fen li luan pao ke li xi bao (GCs),gou jian RNAwen ku ,yong Illumina2000ce xu ;ce xu jie guo jing shu ju ku sou suo he cha yi biao da shai shua ,cai yong DAVIDruan jian GOhe KEGG pathwayfen xi ,jing Genecardsgong neng cha xun ,shai shua niu luan pao fa yo xiang guan ji yin 。jie guo biao ming :shu ju ku sou suo gong huo de 35 325ge ji yin ,ji zhong you yi yi de biao da ji yin 15 645ge ,cong zhong shai shua huo de cha yi biao da ji yin 608ge ;GOfen xi biao ming ,608ge cha yi biao da ji yin zhong can yu sheng wu guo cheng de ji yin zhan 60.46%,xi bao zu fen de ji yin zhan 20.08%,fen zi gong neng de ji yin zhan 11.46%;KEGG pathwayfen xi biao ming ,608ge cha yi biao da ji yin tong guo 9tiao xin hao tong lu can yu niu luan pao fa yo diao kong (P<0.05),jing Genecardsgong neng shai shua ,gong huo de 11ge yu niu luan pao fa yo mi qie xiang guan de diao kong ji yin ——SESN3、COL3A1、CCNE1、CAV1、CACNA1H、ITPR1、PIK3R3、MYC、PTGFR、CDK6、GAPDH,ta men zhi jie can yu xi bao zeng shi fen hua ji xin hao tong lu diao jie 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自湖南农业大学学报(自然科学版)的郝庆玲,景炅婕,朱芷葳,吕丽华,李鹏飞,发表于刊物湖南农业大学学报(自然科学版)2019年01期论文,是一篇关于卵泡论文,颗粒细胞论文,转录组论文,调控基因论文,湖南农业大学学报(自然科学版)2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自湖南农业大学学报(自然科学版)2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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