导读:本文包含了中国部分地方水牛论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:中国地方水牛,mtDNAD-loop,遗传多样性,起源
中国部分地方水牛论文文献综述
齐国强,昝林森,张桂香,王志刚,王均辉[1](2008)在《中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究》一文中研究指出对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 0±0.005 6,平均核苷酸差异(Average number of nucleotide differences,k)为18.445 0,表明我国水牛的遗传多态性丰富。构建的NJ进化树显示这10个品种的水牛主要有两个母系起源。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2008年01期)
齐国强[2](2007)在《中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究》一文中研究指出本研究采用单链构象多态性(SSCP)方法并结合测序技术对10个中国地方水牛品种(贵州青水牛、涪陵水牛、江汉水牛、恩施山地水牛、西林水牛、陕南水牛、海子水牛、温州水牛、东流水牛、峡江水牛)150头个体线粒体DNA D-loop序列基因(约930bp)的多态性进行研究,结果表明:我国地方水牛品种在线粒体DNA D-loop区第一高变区(HV1)的变异率较高。通过SSCP方法显示出6种单倍型,据此确定了110个测序个体。测序结果共发现了50种单倍型,107个多态位点(简约多态位点73个,单一多态位点34个),约占核苷酸序列的11.50%,其单倍型多样度(haplotype diversity, Hd)为0.8952±0.0240,核苷酸多样度(nucleotide diversity,π)为0.0200±0.0056,平均核苷酸差异(average number of nucleotide differences, k)为18.4450,在不同品种之间,差异极显着,其中江苏海子水牛的单倍型多样度、核苷酸多样度和平均核苷酸差异是最高的,其次为贵州青水牛,温州水牛和江汉水牛,其他品种则较低。在这50种单倍型中,43种为各品种特有的单倍型,7种为品种间共享的单倍型。最大的共享单倍型H1包含除江苏海子水牛之外9个品种的33个个体,单倍型H26、H41和H43均包含5个以上个体,单倍型H2、H6、H22、H24、H27、H34、H48均包含2个或2个以上个体,其余单倍型均只有一个个体。中国地方水牛的单倍型数目在每个品种中分布不同,最小为5,最大为9;其单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.8332-1.0000和0.0096-0.0327,这些都表明中国水牛具有丰富的遗传多样性。以GenBanK上公布的江河型印度摩拉水牛D-loop序列(AF197215)为外群,用MEGA3.1和Network 4.2.0.1软件对中国地方水牛50种mtDNA单倍型进行亲缘关系和系统进化分析,构建的NJ系统树表明中国水牛都属于沼泽型水牛,并且包含了2个母系起源,分别命名为A支系和B支系,以此确定了区分两个支系的基本变异位点。其中A支系包含了所有研究品种中的36个单倍型的78个个体,分别占到了总数的72%和70.9%,居主导地位。B支系虽然在分布上不如A支系广泛,但是在单倍型和核苷酸的多样度上要比A支系丰富。除峡江水牛只有A支系外,其他9个中国地方水牛品种在A支系和B支系中均有分布,表明了mtDNA的起源与各品种之间的地理分布没有必然联系。对所选的10个品种从整体上进行核苷酸mismatch分布发现:这些品种没有经过群体扩张;但是对分别处于支系A和支系B聚类分支的个体进行mismatch分布发现:支系A的母系来源经过群体扩张,支系B没有经过群体扩张。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2007-05-01)
中国部分地方水牛论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本研究采用单链构象多态性(SSCP)方法并结合测序技术对10个中国地方水牛品种(贵州青水牛、涪陵水牛、江汉水牛、恩施山地水牛、西林水牛、陕南水牛、海子水牛、温州水牛、东流水牛、峡江水牛)150头个体线粒体DNA D-loop序列基因(约930bp)的多态性进行研究,结果表明:我国地方水牛品种在线粒体DNA D-loop区第一高变区(HV1)的变异率较高。通过SSCP方法显示出6种单倍型,据此确定了110个测序个体。测序结果共发现了50种单倍型,107个多态位点(简约多态位点73个,单一多态位点34个),约占核苷酸序列的11.50%,其单倍型多样度(haplotype diversity, Hd)为0.8952±0.0240,核苷酸多样度(nucleotide diversity,π)为0.0200±0.0056,平均核苷酸差异(average number of nucleotide differences, k)为18.4450,在不同品种之间,差异极显着,其中江苏海子水牛的单倍型多样度、核苷酸多样度和平均核苷酸差异是最高的,其次为贵州青水牛,温州水牛和江汉水牛,其他品种则较低。在这50种单倍型中,43种为各品种特有的单倍型,7种为品种间共享的单倍型。最大的共享单倍型H1包含除江苏海子水牛之外9个品种的33个个体,单倍型H26、H41和H43均包含5个以上个体,单倍型H2、H6、H22、H24、H27、H34、H48均包含2个或2个以上个体,其余单倍型均只有一个个体。中国地方水牛的单倍型数目在每个品种中分布不同,最小为5,最大为9;其单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.8332-1.0000和0.0096-0.0327,这些都表明中国水牛具有丰富的遗传多样性。以GenBanK上公布的江河型印度摩拉水牛D-loop序列(AF197215)为外群,用MEGA3.1和Network 4.2.0.1软件对中国地方水牛50种mtDNA单倍型进行亲缘关系和系统进化分析,构建的NJ系统树表明中国水牛都属于沼泽型水牛,并且包含了2个母系起源,分别命名为A支系和B支系,以此确定了区分两个支系的基本变异位点。其中A支系包含了所有研究品种中的36个单倍型的78个个体,分别占到了总数的72%和70.9%,居主导地位。B支系虽然在分布上不如A支系广泛,但是在单倍型和核苷酸的多样度上要比A支系丰富。除峡江水牛只有A支系外,其他9个中国地方水牛品种在A支系和B支系中均有分布,表明了mtDNA的起源与各品种之间的地理分布没有必然联系。对所选的10个品种从整体上进行核苷酸mismatch分布发现:这些品种没有经过群体扩张;但是对分别处于支系A和支系B聚类分支的个体进行mismatch分布发现:支系A的母系来源经过群体扩张,支系B没有经过群体扩张。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
中国部分地方水牛论文参考文献
[1].齐国强,昝林森,张桂香,王志刚,王均辉.中国部分地方水牛品种mtDNAD-loop区遗传多样性与起源研究[J].畜牧兽医学报.2008
[2].齐国强.中国部分地方水牛品种mtDNAD-loop区遗传多样性与起源研究[D].西北农林科技大学.2007
标签:中国地方水牛; mtDNAD-loop; 遗传多样性; 起源;