过氧化物酶家族论文-柳健虎,张康,藏金萍,曹宏哲,张靖

过氧化物酶家族论文-柳健虎,张康,藏金萍,曹宏哲,张靖

导读:本文包含了过氧化物酶家族论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:禾谷镰孢菌,过氧化物酶家族基因,系统进化,基因表达

过氧化物酶家族论文文献综述

柳健虎,张康,藏金萍,曹宏哲,张靖[1](2019)在《禾谷镰孢菌过氧化物酶家族基因的表达规律分析》一文中研究指出过氧化物酶作为病原真菌抗氧化防御系统的主要组分,能够清除来源于植物体产生的活性氧(reactive oxygen species, ROS),促使病原菌成功侵染宿主植物细胞,禾谷镰孢菌(Fusarium graminearum)过氧化物酶(peroxidase,POX)的相关研究尚未见报道。本研究利用生物信息学手段搜索真菌过氧化物酶基因的数据库,获得了31个禾谷镰孢菌过氧化物酶基因,系统进化分析和保守结构域分析均将其分为18个亚家族。对过氧化物酶家族基因的表达模式进行分析,发现FgPOX (禾谷镰孢菌过氧化物酶, Fusarium graminearum peroxidase)-13、FgPOX-17、FgPOX-16、FgPOX-19等基因在菌丝和分生孢子中均具有较高表达水平,FgPOX-24、FgPOX-29在菌丝中表达水平较高,FgPOX-11、FgPOX-10、FgPOX-4、FgPOX-23在分生孢子中表达水平较高。对过氧化物酶家族基因在侵染过程中的表达规律进行分析,发现FgPOX-13在病菌侵染过程中表达水平明显升高并保持较高水平,FgPOX-17、FgPOX-28、FgPOX-30等基因在病菌侵染的早期表达水平较高,FgPOX-12、FgPOX-10、FgPOX-23等基因在病菌侵染的后期表达水平较高。进一步利用qRT-PCR技术对禾谷镰孢菌过氧化物酶家族基因在H2O2胁迫条件下表达规律进行分析,发现FgPOX-1、FgPOX-4、FgPOX-6、FgPOX-9、FgPOX-10、FgPOX-22、FgPOX-30的表达水平是正常条件下的20倍以上,FgPOX-9、FgPOX-13等随着H2O2胁迫时间的延长,表达水平明显增高,而FgPOX-1、FgPOX-21等随着H2O2胁迫时间的延长,表达水平明显降低。本研究明确了禾谷镰孢菌过氧化物酶家族基因数量、系统进化关系、保守结构域,以及在病菌不同组织、侵染过程和响应H2O2胁迫中的表达规律,为阐明禾谷镰孢菌过氧化物酶家族基因的功能提供了基础资料。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年06期)

郁征宇,葛晨辉,王小丽,徐晨曦,王全华[2](2018)在《菠菜抗坏血酸过氧化物酶基因家族的鉴定及表达分析》一文中研究指出利用生物信息学分析方法,在菠菜全基因组中鉴定出了菠菜(Spinacia oleracea)抗坏血酸过氧化物酶(APX)家族成员,并对其理化性质、亚细胞定位、基因结构、保守基序、同源关系及基因表达进行了分析,发现菠菜中存在7个SoAPXs(SoAPX1~7)基因,并通过进化树分析将菠菜APX家族分为4类.基因结构分析发现该家族基因由5~9个外显子构成.亚细胞定位预测表明大部分菠菜APX蛋白定位在细胞质.实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)结果表明:SoAPXs在各个组织器官中呈组成型表达,其中SoAPX1和SoAPX3的组织表达模式相似,SoAPX4和SoAPX5相似,SoAPX2在新叶中表达最高,SoAPX7在雄花中表达最高.对经胁迫处理后的样品进行表达分析发现,低温胁迫与氧化胁迫对SoAPXs的表达均有诱导作用,盐胁迫与干旱胁迫也刺激了大部分SoAPXs的表达.这些结果表明:SoAPXs可能在菠菜的抗盐、耐寒、抗旱以及抗氧化过程中起作用,为后续深入鉴定APX家族成员的功能提供参考.(本文来源于《上海师范大学学报(自然科学版)》期刊2018年06期)

尹华春,张莉娟,陈斌[3](2018)在《中华按蚊血红素过氧化物酶家族基因的全基因组鉴定、特征和进化》一文中研究指出【目的】在全基因组上鉴定中华按蚊Anopheles sinensis血红素过氧化物酶(heme peroxidase,HPX)家族基因,并预测其基本特征,探究双翅目中5种代表性昆虫HPX基因的系统发育关系和进化。【方法】以NCBI数据库中黑腹果蝇Drosophila melanogaster和家蚕Bombyx mori等昆虫HPX基因编码的氨基酸序列为询问序列,通过本地Blast搜索鉴定中华按蚊基因组上HPX家族基因,并鉴定了冈比亚按蚊Anopheles gambiae、致倦库蚊Aedes aegypti和埃及伊蚊Culex quinquefasciatus基因组上的HPX基因;基于冈比亚按蚊HPX基因的命名系统,对中华按蚊HPX基因进行命名;运用生物信息学方法预测了中华按蚊HPX基因的特征,包括基因的结构及在scaffold的定位,氨基酸的替换率和保守结构域,蛋白质3D结构等,通过与冈比亚按蚊共线性分析定位了中华按蚊HPX基因在染色体上的位置;基于HPX核苷酸序列,采用PAUP4.0和MEGA6.0软件利用最大相似法构建了5个双翅目代表性种HPX基因的系统发生树。【结果】中华按蚊基因组共有20个HPX基因,冈比亚按蚊、埃及伊蚊和致倦库蚊基因组分别有18,14和12个HPX基因。这4种蚊虫的HPX蛋白都被分类进入Peroxinectin,Peroxidasin,DBLPX和DUOX 4个亚家族,其氨基酸的分子量介于61.6~186.6 k D之间(除As HPX8为29.6 k D)。中华按蚊20个HPX基因共具有98个外显子,75个内含子,其外显子与内含子分布模式在基因间差异较大。中华按蚊HPX基因被定位到10个scaffold上,对应到冈比亚按蚊的2R,3R,2L,3L和X染色体。这些中华按蚊HPX基因编码的氨基酸序列(除DUOX)都具有1个血红素结合位点和5个Ca~(2+)结合位点,在N端和C端各具有2个半胍氨酸位点并界定了两个二硫键。中华按蚊与冈比亚按蚊同源基因对的ω值都小于1,说明HPX基因在进化过程中没有受到明显的环境选择压力。系统发育关系研究表明,5种双翅目昆虫的HPX基因可以分为16个组,其中11个组在进化上呈明显的单系,具有至少83%的bootstrap支持。【结论】本研究提供了中华按蚊的HPX基因的基础信息。不同蚊虫种具有相似分子量的HPX蛋白,这与HPX家族蛋白结构的高度保守性有关。蚊虫的DUOX随着主要功能位点的缺失逐渐失去其功能,这与其特殊环境适应相关。DBLPX亚家族的peroxidase结构域在HPX家族所有亚家族中是最保守的。(本文来源于《昆虫学报》期刊2018年01期)

朱海生,刘建汀,王彬,陈敏氡,张前荣[4](2017)在《普通丝瓜过氧化物酶(POD)基因家族的克隆及分析》一文中研究指出了解丝瓜[Luffa cylindrica(L.)Roem.]褐变机理并控制褐变的发生已成为丝瓜育种和采后的研究热点。POD广泛参与了植物的各个生理过程,如木质素和木栓的形成、逆境胁迫响应、组织褐变等。研究表明,在H_2O_2存在的情况下,POD能催化多种酚类物质氧化并形成褐色产物,是果蔬采后褐变产生的关键酶之一,对果蔬褐变特性起着至关重要的作用。目前关于丝瓜POD基因及其在褐变中的作用尚未见报道。克隆丝瓜POD基因,分析POD基因表达、POD活性与丝瓜褐变的相关性,为进一步阐明丝瓜褐变机理奠定基础。以丝瓜为材料,参考百泰克试剂盒说明书提取丝瓜果肉总RNA,通过转录组测序和RT-PCR方法获得丝瓜POD基因家族的eDNA序列,采用生物信息学方法分析氨基酸序列,利用荧光定量PCR技术研究POD基因家族在不同组织及褐变条件下的表达情况。采用愈创木酚比色法测定POD酶活,采用福林—酚比色测定总酚。获得了6个丝瓜POD基因家族cDNA序列,依次命名为LcPOD1(GenBank.KM506755)、LcPOD2(GenBank.KX092431)、LcPOD3(GenBank:KX092432)、LcPOD4(GenBank:KX092433)、LcPOD5(GenBank:KX092434)和LcPOD6(GenBank:KX092435)。LcPOD1基因全长1117 bp,包含1个993 bp的开放读码框(open read frame,ORF),编码331个氨基酸;LcPOD2基因全长1 315 bp,包含1个954 bp的ORF,编码318个氨基酸;LcPOD3基因全长1160 bp,包含1个987bp的ORF,编码329个氨基酸;LcPOD4基因全长1 233 bp,包含1个999 bp的ORF,编码333个氨基酸;LcPOD5基因全长1 433 bp,包含1个996 bp的ORF,编码332个氨基酸;LcPOD6基因全长1 200 bp,包含1个972 bp的ORF,编码324个氨基酸;6个基因编码的蛋白与甜瓜、南瓜、黄瓜同源蛋白的相似性均在80%以上。LcPOD基因家族在丝瓜在根、茎、叶、花和果实中均有表达。在普通丝瓜中表达量较高,在有棱丝瓜中表达较低。在鲜切及采后储藏条件下,LcPOD基因家族表达、POD活性、总酚与丝瓜褐变存在较高相关性。LcPOD基因家族可能参与普通丝瓜果肉褐变并在果肉褐变调控中起一定作用。研究结果为进一步揭示丝瓜褐变的发生机理提供了科学依据,为丝瓜品种遗传改良奠定实践基础。(本文来源于《中国园艺学会2017年论文摘要集》期刊2017-10-19)

李娜,陆海[5](2011)在《植物抗坏血酸过氧化物酶基因家族研究进展》一文中研究指出抗坏血酸过氧化物酶(APX,EC1.11.1.11)是植物体内尤其是叶绿体中清除H2O2的关键酶.就抗坏血酸过氧化物酶的酶学特性、基因家族成员组成与细胞内分布、基因诱导表达特性与其在基因工程中的应用做了介绍,并讨论了其进一步的研究方向.(本文来源于《成都大学学报(自然科学版)》期刊2011年02期)

刘新,李建远[6](2011)在《附睾抗氧化系统中的谷胱甘肽过氧化物酶家族蛋白》一文中研究指出精子成熟是在附睾中完成的[1]。精子与附睾管微环境中物质相互作用,获得运动,识别卵子并使卵子受精的能力。附睾微环境中适量活性氧可以调节精子功能,但过多活性氧会导(本文来源于《检验医学与临床》期刊2011年04期)

曾跃平,刘洁,王宝玺[7](2010)在《过氧化物酶Peroxiredoxin家族与肿瘤关系研究进展》一文中研究指出研究表明,活性氧参与很多细胞代谢通路与信号转导途径,并被证实在许多疾病特别是肿瘤的发生中起重要作用。Peroxiredoxins(Prdxs)家族是一类具有过氧化氢酶活性的抗氧化蛋白,广泛存在于原核生物和真核生物中。越来越多的证据显示Prdxs家族与肿瘤有关。本文将重点综述Prdxs蛋白(本文来源于《癌症进展》期刊2010年02期)

田晓明,谭晓风,罗茜,郭静宜,谷振军[8](2009)在《油茶过氧化物酶基因家族的cDNA克隆与原核表达》一文中研究指出过氧化物酶(Peroxidase,POD)是植物保护酶系的重要保护酶之一。以油茶(Camellia oleifera)近成熟种子cDNA文库和EST文库为材料,根据已有序列信息设计基因特异性引物,通过5′RACE和3′RACE,获得了5个油茶POD基因的全长cDNA序列。核苷酸序列分析结果表明,扩增得到的5个POD基因在编码区高度保守,而在5′UTR和3′UTR则存在显着差异。氨基酸序列分析结果显示,除POD2编码333个氨基酸外,其余四个均编码337个氨基酸。根据二级结构预测结果推测,油茶POD属于第Ⅲ类植物过氧化物酶超家族。以克隆到的POD5全长cDNA为模板,用含有特异酶切位点的P1、P2为引物,通过PCR方法将它构建到表达载体pET32a上并转化到大肠杆菌菌株BL21(DE3)中,获得相应的重组工程菌。经过37℃条件下的IPTG诱导,POD重组蛋白在BL21(DE3)菌株中得到表达。(本文来源于《第二届中国林业学术大会——S9 木本粮油产业化论文集》期刊2009-11-07)

朱洁华,贾伟平[9](2005)在《过氧化物酶增殖活化受体家族与非酒精性脂肪肝》一文中研究指出非酒精性脂肪肝病(nonalcoholic fatty liverdisease,NAFLD)是遗传-环境-代谢应激相关因素所致的以肝细胞脂肪变性为主的临床病理综合征。根据其病理学改变及临床表现,可将其分为单纯性脂肪肝(NAFL)、脂肪性肝炎(NASH)(本文来源于《上海医学》期刊2005年06期)

刘稳[10](2002)在《植物过氧化物酶超家族的分子结构》一文中研究指出过氧化物酶广泛存在于生物中。基于序列相似性比较,可将真菌、细菌和植物来源的过氧化物酶归为一个超家族-植物过氧化物酶超家族。作者对近几年来植物过氧化物酶超家族的分子结构与功能研究进展,从过氧化物酶的辅基(血红素)微循环结构、过氧化物酶超家族的序列结构域,以及酶分子中底物结合位点和 Ca2+结合位点的结构等方面作了简要评述。(本文来源于《生命科学》期刊2002年04期)

过氧化物酶家族论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

利用生物信息学分析方法,在菠菜全基因组中鉴定出了菠菜(Spinacia oleracea)抗坏血酸过氧化物酶(APX)家族成员,并对其理化性质、亚细胞定位、基因结构、保守基序、同源关系及基因表达进行了分析,发现菠菜中存在7个SoAPXs(SoAPX1~7)基因,并通过进化树分析将菠菜APX家族分为4类.基因结构分析发现该家族基因由5~9个外显子构成.亚细胞定位预测表明大部分菠菜APX蛋白定位在细胞质.实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)结果表明:SoAPXs在各个组织器官中呈组成型表达,其中SoAPX1和SoAPX3的组织表达模式相似,SoAPX4和SoAPX5相似,SoAPX2在新叶中表达最高,SoAPX7在雄花中表达最高.对经胁迫处理后的样品进行表达分析发现,低温胁迫与氧化胁迫对SoAPXs的表达均有诱导作用,盐胁迫与干旱胁迫也刺激了大部分SoAPXs的表达.这些结果表明:SoAPXs可能在菠菜的抗盐、耐寒、抗旱以及抗氧化过程中起作用,为后续深入鉴定APX家族成员的功能提供参考.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

过氧化物酶家族论文参考文献

[1].柳健虎,张康,藏金萍,曹宏哲,张靖.禾谷镰孢菌过氧化物酶家族基因的表达规律分析[J].农业生物技术学报.2019

[2].郁征宇,葛晨辉,王小丽,徐晨曦,王全华.菠菜抗坏血酸过氧化物酶基因家族的鉴定及表达分析[J].上海师范大学学报(自然科学版).2018

[3].尹华春,张莉娟,陈斌.中华按蚊血红素过氧化物酶家族基因的全基因组鉴定、特征和进化[J].昆虫学报.2018

[4].朱海生,刘建汀,王彬,陈敏氡,张前荣.普通丝瓜过氧化物酶(POD)基因家族的克隆及分析[C].中国园艺学会2017年论文摘要集.2017

[5].李娜,陆海.植物抗坏血酸过氧化物酶基因家族研究进展[J].成都大学学报(自然科学版).2011

[6].刘新,李建远.附睾抗氧化系统中的谷胱甘肽过氧化物酶家族蛋白[J].检验医学与临床.2011

[7].曾跃平,刘洁,王宝玺.过氧化物酶Peroxiredoxin家族与肿瘤关系研究进展[J].癌症进展.2010

[8].田晓明,谭晓风,罗茜,郭静宜,谷振军.油茶过氧化物酶基因家族的cDNA克隆与原核表达[C].第二届中国林业学术大会——S9木本粮油产业化论文集.2009

[9].朱洁华,贾伟平.过氧化物酶增殖活化受体家族与非酒精性脂肪肝[J].上海医学.2005

[10].刘稳.植物过氧化物酶超家族的分子结构[J].生命科学.2002

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