导读:本文包含了序列标记位点论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:向日葵,序列标签位点,多态性
序列标记位点论文文献综述
刘胜利,段维,王鹏,柳延涛,王沛政[1]（2017）在《新疆向日葵自交系序列标签位点SSR多态标记库的构建研究》一文中研究指出随机合成了500对向日葵SSR引物,利用这些标记对16份新疆食葵和油葵自交系进行了多态筛选。结果表明62对标记在16份向日葵基因组中扩增呈现稳定多态,扩增产物条带清晰、稳定和易读,占所合成引物数量的12.4%。这些标记可以作为新疆向日葵自交系和品种等真伪鉴定、杂种优势群划分分析等优先选用引物。(本文来源于《畜禽业》期刊2017年12期）
王希,陈丽,赵春雷[2]（2016）在《利用MISA工具对不同类型序列进行SSR标记位点挖掘的探讨》一文中研究指出为扩大MISA工具(MIcro SAtellite identification tool)的适用范围,本研究尝试用MISA对其他类型的序列进行分析,探讨关键参数对分析结果的影响。研究收集了5种类型的甜菜序列数据,探讨了不同类型序列适用的相关分析参数,以及不同参数对分析结果的影响。利用MISA工具分析了5种类型的甜菜序列,其中4种来自公共数据库,1种来自课题组前期工作。结果表明在适当的参数下,配合适当的序列库格式化处理,MISA可以应用于不同的甜菜序列类型。可分析的序列库长度上限取决于去冗余工具的要求,并影响去冗余处理的时间和结果,重复单元长度的限定参数影响位点挖掘数量和引物设计成功率,序列长度的分布范围不影响分析。应用参数调整后的脚本,从5种甜菜序列库中共挖掘出了SSR标记位点约8000个。可知MISA的应用范围可以扩展,需要调整的关键参数包括2项:序列库的长度上限与重复单元长度。建议序列长度在程序与硬件允许的情况下尽量长,重复单元长度根据研究目标调整。(本文来源于《中国农学通报》期刊2016年10期）
雍建朋,李玉红,孟永娇,钟艳花,程智慧[3]（2013）在《黄瓜矮生基因(cp)连锁的简单重复序列(SSRs)和序列标签位点(STS)标记》一文中研究指出矮化株型是黄瓜(Cucumis sativus L.)重要的农艺性状,对于实现黄瓜的密植高效栽培和机械采收具有潜在的应用价值。矮生基因(compact gene,cp)控制着黄瓜的矮生性状,初始精细定位已经将cp基因定位在220 kb的区间,且与细胞分裂素氧化酶基因(CKX)共分离。为了进一步缩短cp基因的定位区间,本研究在原有研究基础上,以黄瓜蔓生材料WI7200(长节间)与矮生材料WI7201(短节间)为亲本,即与cp初始精细定位的F2群体(1 273株)的相同亲本,新构建了一个较大的F2群体,利用cp初始精细定位的两侧翼微卫星标记UW084680和UW084870筛选以相同亲本新构建的F2群体中的1 348个单株,共筛选出57株重组交换单株;在cp基因初始精细定位的220 kb区间内,利用黄瓜基因组测序结果及生物信息学分析,在标记区域内新开发了68对微卫星标记和1对序列标签位点(STS)标记,2对简单重复序列(SSR)标记和1对STS标记被成功用于交换单株的分析,并结合cp基因初始精细定位所用F2群体的1 273株单株的数据,最终利用2 621 F2单株将cp基因定位在178 kb的区间内,其共分离标记是SSR标记UW057998和STS标记cp-STS-6。最近的两侧翼标记CKX-indel和UW058058与cp基因分别相距0.04和0.23 cM,此结果排除了CKX作为cp候选基因的可能性,因此矮生基因的候选基因定位在标记CKX-indel和UW058058的178 kb区间,本研究结果不仅为进一步筛选和确认cp基因提供了基础数据,也为黄瓜矮生性状的分子标记辅助育种提供了科学依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2013年10期）
崔光红,黄璐琦,唐晓晶,何希荣,李欣[4]（2007）在《获取人参、西洋参特定序列位点(STS)标记的新方法》一文中研究指出目的:寻找人参、西洋参的分子鉴定新方法。方法:在人参、西洋参已知rDNA序列上设计单引物进行PCR扩增,对多态性条带克隆测序,根据序列比对情况设计人参、西洋参特异引物,通过对PCR条件的优化得到人参、西洋参的STS标记。结果:引物Pg-q36F能得到人参、西洋参的多态性条带,特异引物Pg-6F,Pg-479R仅对人参扩增474bp条带,特异引物Pq-442F,Pq-658R仅对西洋参扩增217 bp条带,能成功鉴定人参和西洋参。结论:建立了一种获取人参、西洋参STS标记的新方法。本方法大大加快STS标记的建立过程。可为其他中药材分子标记的获得提供指导。(本文来源于《中国中药杂志》期刊2007年11期）
孟海军,曹庆芹,程运江,邓秀新[5]（2004）在《EMBL数据库中柑橘属(Citrus)及其近源属枳壳(Poncirus)的序列中SSR位点出现频率的研究及多态性标记的开发》一文中研究指出SSR标记有两种开发方法。一是利用计算机程序从数据库中已知的序列中查找SSR位点,设计引物来获得有用的标记。这种方法方便快捷,但是只适用于那些在数据库中有足够序列信息的物种。二是利用由重复序列构成的寡核苷酸做探针,筛选基因组文库。这种方法适用范围广。要提高这种方法的效率,探针的选择很重要。本文研究了EMBL数据库中柑橘属及其近源属枳壳序列中SSR位点的出现频率,为探针的选择提供一些参考。同时也开发了一些多态性的SSR引物。(本文来源于《湖北省遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要集》期刊2004-05-01）
[6]（1997）在《微切的微克隆确定人染色体11q13.4-q25的50个新序列标记位点(STSs)》一文中研究指出［英」／SoejimaH…／／CytO－genetCellGenet．－1995，70．－108～111序列标记位点（STSs）是一种物理定位人染色体组的“通用语言”。STSS是可用PCR特异检测的DNA序列短支链，通常由确定和定位克隆的基因组片段产生。(本文来源于《国外医学.遗传学分册》期刊1997年01期）
高惠东[7]（1995）在《利用序列示踪位点标记物》一文中研究指出随机扩增多态DNA引物多聚酶链反应，使立枯丝核菌AG4或AG8分离菌产生多态性。AG4和AG8的专化性产物经选择，克隆，序列分析，然后与已经发表的AG8的基因序列结合，得到四条序列示踪位点标记物。这些标记物中加入正对照引物，它们与AG4和AG8分离物作用(本文来源于《邯郸农业高等专科学校学报》期刊1995年Z2期）
序列标记位点论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为扩大MISA工具(MIcro SAtellite identification tool)的适用范围,本研究尝试用MISA对其他类型的序列进行分析,探讨关键参数对分析结果的影响。研究收集了5种类型的甜菜序列数据,探讨了不同类型序列适用的相关分析参数,以及不同参数对分析结果的影响。利用MISA工具分析了5种类型的甜菜序列,其中4种来自公共数据库,1种来自课题组前期工作。结果表明在适当的参数下,配合适当的序列库格式化处理,MISA可以应用于不同的甜菜序列类型。可分析的序列库长度上限取决于去冗余工具的要求,并影响去冗余处理的时间和结果,重复单元长度的限定参数影响位点挖掘数量和引物设计成功率,序列长度的分布范围不影响分析。应用参数调整后的脚本,从5种甜菜序列库中共挖掘出了SSR标记位点约8000个。可知MISA的应用范围可以扩展,需要调整的关键参数包括2项:序列库的长度上限与重复单元长度。建议序列长度在程序与硬件允许的情况下尽量长,重复单元长度根据研究目标调整。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
序列标记位点论文参考文献
[1].刘胜利,段维,王鹏,柳延涛,王沛政.新疆向日葵自交系序列标签位点SSR多态标记库的构建研究[J].畜禽业.2017
[2].王希,陈丽,赵春雷.利用MISA工具对不同类型序列进行SSR标记位点挖掘的探讨[J].中国农学通报.2016
[3].雍建朋,李玉红,孟永娇,钟艳花,程智慧.黄瓜矮生基因(cp)连锁的简单重复序列(SSRs)和序列标签位点(STS)标记[J].农业生物技术学报.2013
[4].崔光红,黄璐琦,唐晓晶,何希荣,李欣.获取人参、西洋参特定序列位点(STS)标记的新方法[J].中国中药杂志.2007
[5].孟海军,曹庆芹,程运江,邓秀新.EMBL数据库中柑橘属(Citrus)及其近源属枳壳(Poncirus)的序列中SSR位点出现频率的研究及多态性标记的开发[C].湖北省遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要集.2004
[6]..微切的微克隆确定人染色体11q13.4-q25的50个新序列标记位点(STSs)[J].国外医学.遗传学分册.1997
[7].高惠东.利用序列示踪位点标记物[J].邯郸农业高等专科学校学报.1995