王杏茹:蕹菜耐受长时间高温后的miRNA分析论文

王杏茹:蕹菜耐受长时间高温后的miRNA分析论文

本文主要研究内容

作者王杏茹,李文静,陈冰星,刘涛,尚维,赖钟雄,郭容芳(2019)在《蕹菜耐受长时间高温后的miRNA分析》一文中研究指出:miRNA是广泛存在于真核生物体内的一类长度为20~24 nt的小分子非编码RNA,在植物生长发育和逆境适应过程中发挥重要作用。蕹菜(Ipomoea aquatica)可以耐受长时间高温,而其miRNA还未被鉴定,其在耐受长时间高温后的作用还未知。以蕹菜耐热性强的品种‘泰国三叉’和耐热性差的品种‘柳叶’为材料,经42℃高温处理15d后分别构建两个高质量sRNA库,经检测两个库中碱基质量值大于或等于30的序列数量均超过17.3Mb,且‘泰国三叉’中24nt的序列数量远远高于‘柳叶’。与蕹菜转录组比对分析后,分别得到1 363 258和1 629 209条序列,两个库共有的序列仅有1 047 133条(11.36%),说明耐热性不同的蕹菜中s RNA有很大差别。共鉴定出蕹菜中存在71个miRNA,其中差异表达的有22个,通过TargetFinder预测其靶基因,共得到233个靶基因。进一步以耐热性强的品种‘本地三叉’和耐热性弱的品种‘竹叶’为材料研究其在长时间高温后miR160、miR166、miR172、miR393和miR3627前体的差异表达量,结果表明,高温后两品种中pre-miR160-2的表达都显著上调,但是不耐热的‘竹叶’中上调的倍数更多;mi R166在耐热性强的‘本地三叉’中表达量下降,在耐热性较差的‘竹叶’中表达量显著上升;miR172可以被长时间高温诱导,但在耐热性不同的两个品种蕹菜中并没有差异;miR3627的表达量在耐热蕹菜‘本地三叉’中下降,在不耐热蕹菜‘竹叶’中没有明显变化。miRNA前体表达模式的差异说明其在蕹菜耐受长时间高温过程中的作用机制不同。

Abstract

miRNAshi an fan cun zai yu zhen he sheng wu ti nei de yi lei chang du wei 20~24 ntde xiao fen zi fei bian ma RNA,zai zhi wu sheng chang fa yo he ni jing kuo ying guo cheng zhong fa hui chong yao zuo yong 。weng cai (Ipomoea aquatica)ke yi nai shou chang shi jian gao wen ,er ji miRNAhai wei bei jian ding ,ji zai nai shou chang shi jian gao wen hou de zuo yong hai wei zhi 。yi weng cai nai re xing jiang de pin chong ‘tai guo san cha ’he nai re xing cha de pin chong ‘liu xie ’wei cai liao ,jing 42℃gao wen chu li 15dhou fen bie gou jian liang ge gao zhi liang sRNAku ,jing jian ce liang ge ku zhong jian ji zhi liang zhi da yu huo deng yu 30de xu lie shu liang jun chao guo 17.3Mb,ju ‘tai guo san cha ’zhong 24ntde xu lie shu liang yuan yuan gao yu ‘liu xie ’。yu weng cai zhuai lu zu bi dui fen xi hou ,fen bie de dao 1 363 258he 1 629 209tiao xu lie ,liang ge ku gong you de xu lie jin you 1 047 133tiao (11.36%),shui ming nai re xing bu tong de weng cai zhong s RNAyou hen da cha bie 。gong jian ding chu weng cai zhong cun zai 71ge miRNA,ji zhong cha yi biao da de you 22ge ,tong guo TargetFinderyu ce ji ba ji yin ,gong de dao 233ge ba ji yin 。jin yi bu yi nai re xing jiang de pin chong ‘ben de san cha ’he nai re xing ruo de pin chong ‘zhu xie ’wei cai liao yan jiu ji zai chang shi jian gao wen hou miR160、miR166、miR172、miR393he miR3627qian ti de cha yi biao da liang ,jie guo biao ming ,gao wen hou liang pin chong zhong pre-miR160-2de biao da dou xian zhe shang diao ,dan shi bu nai re de ‘zhu xie ’zhong shang diao de bei shu geng duo ;mi R166zai nai re xing jiang de ‘ben de san cha ’zhong biao da liang xia jiang ,zai nai re xing jiao cha de ‘zhu xie ’zhong biao da liang xian zhe shang sheng ;miR172ke yi bei chang shi jian gao wen you dao ,dan zai nai re xing bu tong de liang ge pin chong weng cai zhong bing mei you cha yi ;miR3627de biao da liang zai nai re weng cai ‘ben de san cha ’zhong xia jiang ,zai bu nai re weng cai ‘zhu xie ’zhong mei you ming xian bian hua 。miRNAqian ti biao da mo shi de cha yi shui ming ji zai weng cai nai shou chang shi jian gao wen guo cheng zhong de zuo yong ji zhi bu tong 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自园艺学报的王杏茹,李文静,陈冰星,刘涛,尚维,赖钟雄,郭容芳,发表于刊物园艺学报2019年03期论文,是一篇关于蕹菜论文,长时间高温论文,园艺学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自园艺学报2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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