本文主要研究内容
作者王婷,唐锐敏,王瑞晋,贺立恒,刘霞宇,刘世芳,李润植,贾小云（2019）在《三裂叶薯SPL基因家族鉴定、表达及miR156的调控分析》一文中研究指出：SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)是一类广泛存在于植物中的转录因子,均含有一个高度保守的SBP结构域(SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN)。本研究通过SBP结构域的隐马尔可夫模型、Blastp、CDD和SMART等程序从栽培甘薯的二倍体近缘野生种三裂叶薯(Ipomoea triloba L.)全基因组中鉴定出26个SPL基因家族成员。它们不均匀分布于三裂叶薯的12条染色体上。利用系统进化分析将新鉴定的26个三裂叶薯ItbSPL基因和来源于苔藓植物、单子叶植物、双子叶植物的116个SPL基因构建进化树,并根据拟南芥AtSPL基因家族的分类标准将26个ItbSPL基因家族分为7组。GSDS 2.0基因结构和MEME 4.12.0保守基序分析表明,不同进化分支中的ItbSPL基因的外显子/内含子数目及其蛋白基序组成差异明显。利用拟南芥中已知功能的SPL对ItbSPL基因的功能进行预测,发现三裂叶薯ItbSPL家族基因成员可能与植物开花、逆境胁迫、次生代谢产物等生物学过程相关。通过预测microRNA156(miR156)的作用位点发现,在26个ItbSPL基因中14个含有miR156的作用位点,其中13个ItbSPL基因具有PCR扩增产物。利用qRT-PCR检测13个候选靶基因及miR156在三裂叶薯叶、茎、根中的表达量,发现13个ItbSPL均在茎中的表达量最低,显著低于叶与根中的表达,而miR156则在茎中的表达量最高,在根中的表达量最低,初步推测这13个ItbSPL是miR156的靶基因。以上研究结果为六倍体栽培甘薯SPL基因家族成员的鉴定、进化分析及功能研究提供了方法和基础。
Abstract
SQUAMOSA promoter binding protein-like(SPL)shi yi lei an fan cun zai yu zhi wu zhong de zhuai lu yin zi ,jun han you yi ge gao du bao shou de SBPjie gou yu (SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN)。ben yan jiu tong guo SBPjie gou yu de yin ma er ke fu mo xing 、Blastp、CDDhe SMARTdeng cheng xu cong zai pei gan shu de er bei ti jin yuan ye sheng chong san lie xie shu (Ipomoea triloba L.)quan ji yin zu zhong jian ding chu 26ge SPLji yin jia zu cheng yuan 。ta men bu jun yun fen bu yu san lie xie shu de 12tiao ran se ti shang 。li yong ji tong jin hua fen xi jiang xin jian ding de 26ge san lie xie shu ItbSPLji yin he lai yuan yu tai xian zhi wu 、chan zi xie zhi wu 、shuang zi xie zhi wu de 116ge SPLji yin gou jian jin hua shu ,bing gen ju ni na gai AtSPLji yin jia zu de fen lei biao zhun jiang 26ge ItbSPLji yin jia zu fen wei 7zu 。GSDS 2.0ji yin jie gou he MEME 4.12.0bao shou ji xu fen xi biao ming ,bu tong jin hua fen zhi zhong de ItbSPLji yin de wai xian zi /nei han zi shu mu ji ji dan bai ji xu zu cheng cha yi ming xian 。li yong ni na gai zhong yi zhi gong neng de SPLdui ItbSPLji yin de gong neng jin hang yu ce ,fa xian san lie xie shu ItbSPLjia zu ji yin cheng yuan ke neng yu zhi wu kai hua 、ni jing xie pai 、ci sheng dai xie chan wu deng sheng wu xue guo cheng xiang guan 。tong guo yu ce microRNA156(miR156)de zuo yong wei dian fa xian ,zai 26ge ItbSPLji yin zhong 14ge han you miR156de zuo yong wei dian ,ji zhong 13ge ItbSPLji yin ju you PCRkuo zeng chan wu 。li yong qRT-PCRjian ce 13ge hou shua ba ji yin ji miR156zai san lie xie shu xie 、jing 、gen zhong de biao da liang ,fa xian 13ge ItbSPLjun zai jing zhong de biao da liang zui di ,xian zhe di yu xie yu gen zhong de biao da ,er miR156ze zai jing zhong de biao da liang zui gao ,zai gen zhong de biao da liang zui di ,chu bu tui ce zhe 13ge ItbSPLshi miR156de ba ji yin 。yi shang yan jiu jie guo wei liu bei ti zai pei gan shu SPLji yin jia zu cheng yuan de jian ding 、jin hua fen xi ji gong neng yan jiu di gong le fang fa he ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自植物遗传资源学报的王婷,唐锐敏,王瑞晋,贺立恒,刘霞宇,刘世芳,李润植,贾小云，发表于刊物植物遗传资源学报2019年03期论文，是一篇关于三裂叶薯论文,基因家族论文,全基因组鉴定论文,表达分析论文,植物遗传资源学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自植物遗传资源学报2019年03期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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