进化适应性论文-张剑搏,丁学智,Anum,Ali,Ahmad,李晨,梁泽毅

进化适应性论文-张剑搏,丁学智,Anum,Ali,Ahmad,李晨,梁泽毅

导读:本文包含了进化适应性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:青藏高原土着动物,高海拔,适应性,进化

进化适应性论文文献综述

张剑搏,丁学智,Anum,Ali,Ahmad,李晨,梁泽毅[1](2019)在《高原土着动物适应性进化的研究进展》一文中研究指出青藏高原是世界上海拔最高、面积最大、地形最为复杂的地理单元,其独特的地形地貌造就了极端的环境气候特征——高寒、低氧、强紫外线辐射等。历经数百万年,高原土着动物在长期的适应性进化过程中形成了独特的低氧适应策略。经过长期的自然选择和进化,高原土着动物不仅在生理、生化、形态学及行为上获得稳定的高原低氧适应能力,并在细胞和分子水平形成了一系列独特的调节机制。近一个世纪以来,高原动物适应性进化的研究主要集中在生理形态方面,近期随着基因组数据的不断更新,利用分子技术探索高原动物适应性进化已成为研究热点,但全面解析高原动物为何能够良好的适应高原极端环境的分子机制亟待进一步研究。因此,今后的研究可结合已报道的相关表型和基因型数据,全面、系统地解析高原动物适应性进化的分子机制和遗传原理,为培育耐低温、低氧及强紫外辐射的动物新品种提供理论和技术依据,也为临床预防和治疗高原性疾病提供新思路。为此,本文以青藏高原特有的低氧、低温和强紫外辐射为线索,并结合相关微生物的研究成果,综述了近几十年关于高原土着动物适应性进化的研究进展。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年09期)

周姚,赵学博,李义文,徐俊,毕傲月[2](2019)在《小麦群体的趋同和适应性进化研究》一文中研究指出小麦是重要的粮食作物之一,经历了复杂的杂交,异源多倍化,驯化和遗传改良过程。最近发布的高质量乌拉尔图和普通小麦参考基因组为相关领域研究提供了方便。为研究小麦适应性进化过程以及多样性变化,本研究共采集了小麦属和粗山羊草属26个不同种/亚种的420份材料,通过二代重测序分析,构建了第一代小麦遗传变异图谱。群体结构分析结果表明,栽培二粒是由野生二粒小麦一次驯化形成的;斯卑尔托小麦的四倍体祖先种为不易脱粒的栽培二粒小麦,而普通小麦的四倍体祖先种是易脱粒的四倍体。遗传多样性分析结果表明,在小麦的驯化和改良过程中伴随着多样性的降低,但四倍体向六倍体的渗入会造成A和B基因组多样性的增加,因此在六倍体中,A和B基因组的多样性要显着高于D基因组。同时,对小麦属中一粒小麦和二粒小麦的两个独立驯化过程以及四倍体和六倍体小麦中遗传改良过程进行分析,揭示了小麦从野生型到栽培型驯化过程中的趋同演化过程,例如Btr1基因,在小麦和大麦中均受到驯化选择。本研究为小麦进化提供了新的视角,并有助于小麦遗传和育种研究。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11)

魏鑫丽,王延延,王治军,刘大乐,魏江春[3](2019)在《地衣的分布格局及适应性进化研究——以梅衣科和瓶口衣科等若干类群为例》一文中研究指出地衣在全球的分布约占陆地面积的8%,遍布南北两极、热带亚热带、高山及荒漠等极端生境,是真菌的重要组成部分,具有重要的生态学功能。地衣的分布类型多种多样,包括世界广布、间断分布、两极分布和小区域特有分布等。地衣的现代分布格局受历史地理因素及生态因素等综合因素影响。本研究从历史生物地理学角度及生态学角度,分别对世界范围梅衣科中的袋衣类地衣及中国西北沙漠中的地衣进行了综合研究,并选取沙漠常见地衣类群石果衣,对其独特的抗逆基因进行了适应性进化研究。结果如下:1)推测袋衣类地衣起源于渐新世早期的泛北极地区,袋衣类地衣中的四属均为单系,物种多样性主要发生于北半球的中新世和上新世,通过平行扩散事件,部分类群扩散至南半球,导致南半球袋衣类地衣在当地的物种多样性集中发生,而东亚尤其是中国的西南地区是袋衣属的现代分化中心之一;2)腾格里沙漠东南缘沙坡头地区的地衣种类组成,随时间出现一定的演替规律,石果衣等少数类群定殖较早,当地的地衣多样性及盖度与土壤理化性质和土壤真菌细菌等微生物组成等生态因子存在不同程度的相关,研究结果支持地衣对改善当地沙漠土壤营养具有一定的贡献;3)扩大沙漠研究范围,并考虑沙漠的不同类型,对腾格里沙漠、巴丹吉林沙漠和浑善达克沙地进行了地衣种类组成及分布研究,结果显示不同类型沙漠中地衣优势类群不尽相同,地衣多样性及盖度与降雨量和气温相关不显着,但与土壤理化性质及土壤真菌组成等生态因子相关显着;4)对沙漠地衣常见种石果衣的共生菌基因组进行抗逆相关功能的研究过程中,发现一类新的多蛋白侨联因子(MBF1),其氨基酸组成在与转录结合位点(TBP)作用的a3螺旋区第114个位点发生点突变,且C端多余14-15个氨基酸片段,此规律也存在于石果衣属其他物种中,却未发现于其他地衣类群或其他生物中,推断石果衣中新型MBF1与石果衣生长的干旱环境相关,属于对干旱环境的适应性进化,此推断从后续对mbf1基因功能的研究中得以验证。以上研究为进一步探讨若干地衣类群或某一区域的地衣多样性发生机制奠定了初步的基础。(本文来源于《多彩菌物 美丽中国——中国菌物学会2019年学术年会论文摘要》期刊2019-08-03)

王卓,国红玉,张妍彤,朱金丽,邢朝斌[4](2019)在《五加科药用植物鲨烯合酶的适应性进化分析》一文中研究指出目的对五加科药用植物的鲨烯合酶(squalene synthase,SS)进行适应性进化分析。方法利用PAML软件的分支模型、位点模型、分支-位点模型以及MEC模型、SLAC、FEL和REL等方法对五加科7种药用植物的23条SS基因进行适应性进化分析。结果在PAML与MEC模型的分析中发现多数分支与位点处于较强的负选择下,未发现正选择位点;通过SLAC、FEL和REL分析同样显示存在大量的负选择位点,仅412P、413N、415K为正选择位点。结论负选择对五加科SS基因起主导作用,而发现的412P、413N、415K位点可能与SS的活性有关。(本文来源于《中草药》期刊2019年14期)

杨焰,游雪甫,李聪然[5](2019)在《耐药细菌的适应性代价及补偿性进化》一文中研究指出细菌在获得抗生素耐药性后易于产生适应性代价(fitness cost),表现为在没有抗生素存在时,与野生型菌株相比,耐药性突变株的生存能力、转移速率和毒力的降低。然而,耐药菌可通过进化恢复其适应性,这种能使适应性上升的过程称为"补偿性进化(compensatory evolution)"。本文综述了耐药菌的适应性代价产生的原因、研究方法、研究进展及补偿性进化的机制,并讨论了适应性代价研究过程中存在的问题及展望。(本文来源于《中国抗生素杂志》期刊2019年07期)

尹鹤[6](2019)在《暖新闻:“正面宣传”的适应性进化》一文中研究指出在国际格局深刻调整变化、我国进入决胜全面建成小康社会、全面建设社会主义现代化强国的关键时期,国家的发展更加需要媒体在引领导向、凝心聚力等方面助一臂之力。与此同时,传媒技术的迅猛发展带来的很多问题尚未得到解决,我国传媒环境中的偏态传播趋势不断挑战媒体红线,亟待回正。人们在现实环境与拟态环境中所感知的压力加剧了(本文来源于《青年》期刊2019年17期)

吕有军[7](2019)在《棉花零式果枝基因的精细定位及PEBP基因家族适应性进化分析》一文中研究指出目的:株型结构是影响作物产量和品质的重要综合性状。开花标志着植株从营养生长阶段向生殖生长阶段的转换,是开花植物对内部信号和外部刺激作出的响应,也深刻影响植物的生长特性和株型结构。自然条件下,棉花植株由主茎顶端生长点持续产生侧枝和花序,形成无限生长的株型结构。棉花的枝包括营养枝和果枝两种,果枝又可分为有限果枝和无限果枝。零式果枝是典型的有限果枝类型,其主茎直接着生花蕾,或仅有一个短果节,果节顶端为单生花或丛生花,从而形成非常紧凑的株型结构。本文围绕棉花零式果枝性状,对其遗传控制基因进行精细定位和初步验证,在此基础上,对棉花零式果枝控制基因所属的植物PEBP基因家族进行系统地生物信息学和适应性进化分析,以揭示植物PEBP基因家族的进化特征、进化动力和关键分子信息,重建棉花PEBP基因家族进化模式和历史,为全面解析PEBP基因家族在棉花中的多样化功能,阐明棉花零式果枝遗传的分子机制,指导棉花株型育种奠定基础。方法:(1)本研究中,采用集团分离分析法(BSA)并结合高通量测序技术(NGS),通过零式果枝海岛棉品种新海18号与无限果枝陆地棉材料TM-1杂交,获得海陆杂种F_2代作图群体,构建精细图谱对棉花零式果枝控制基因进行精细定位;(2)通过转基因互补表达,初步确定零式果枝控制基因;(3)根据棉花全基因组测序与注释结果,采用序列比对和同源克隆的方法,对各主要棉种基因组中(包括10个二倍体物种和5个四倍体物种)的PEBP家族基因进行鉴定、克隆,以获得PEBP基因家族在棉属主要基因组(或物种)中的分布情况,并对棉花PEBP基因家族进行生物信息学分析;(4)采用分枝模型(Branch model)、位点模型(Site model)和枝-位点模型(Branch-site model),分别对棉属和蔷薇类植物PEBP基因家族进行适应性进化分析;(5)结合植物进化中所发生的历次全基因组加倍事件,通过祖先基因鉴定、直系同源基因鉴定分组、系统发育分析、分化分析等方法,阐明棉花PEBP基因家族扩张、删除与分化的进化模式,重建棉花PEBP基因家族的进化历史。结果与结论:(1)遗传分析表明,棉花零式果枝性状由单位点隐性基因gb_nb1控制;采用简化基因组测序技术,获得父、母本间等位单核苷酸多态性(SNPs),并对SNP位点在F_2代零式果枝和无限果枝群体中的分布特征进行了鉴定;通过分离分析,发现一个包含42个SNP标记的、长度约~9.0Mb的候选区域与零式果枝控制基因gb_nb1存在关联,最终将gb_nb1定位于陆地棉Chr16上一长度约600kb的区间。(2)拟南芥互补试验表明,位于该区间内的拟南芥ATC同源基因GhNB(Gh_D07G1075)为零式果枝控制基因,该基因属于植物PEBP基因家族。(3)采用序列比对和同源克隆方法,鉴定、克隆了棉属15个种内的PEBP家族基因共计160个;系统发育分析表明,棉属PEBP家族基因分为MFT-Like、FT-Like和TFL1-Like等3个亚家族,包括MFT-L1、MFT-L2、FT、BFT-L1、BFT-L2、TFL1-L1、TFL1-L2、CEN等8个直系同源组;二倍体棉种基因组含有8个分别属于不同直系同源组的单拷贝PEBP基因,而四倍体棉种基因组则含有16个分别属于8个直系同源组的双拷贝PEBP基因。(4)生物信息学分析表明,在基因长度、基因结构、DNA序列、CDS序列、蛋白质序列等方面,不同直系同源组之间存在明显差异,而来自于不同棉种的、同一直系同源组内的PEBP基因高度相似甚至完全一致;棉花PEBP基因具有典型的PEBP家族基因结构,包括4个外显子和3个内含子;陆地棉PEBP基因时空表达模式分析表明,不同PEBP基因的时空表达模式存在显着差异;对PEBP基因启动子的生物信息学分析表明,光响应顺式作用元件在PEBP家族基因启动子区域普遍存在;植物原始祖先胶球藻和小立碗藓的PEBP基因启动子区域的光响应顺式作用元件的数量明显少于棉花PEBP基因;棉花PEBP家族基因上游顺式作用元件呈不均衡分布,不同PEBP直系同源组间启动子所包含的顺式作用元件种类和数量存在明显差异,而直系同源组内PEBP基因上游的顺式作用元件分布则具有极高的相似性。(5)棉属PEBP基因家族的适应性进化分析表明,棉属PEBP基因家族的平均选择压力ω仅为0.12396,表明棉属PEBP基因家族是一个极端保守的、呈高度负向(纯化)选择的基因家族;分枝模型分析表明,棉属PEBP基因家族中的MFT-L1、MFT-L2与FT分枝(直系同源组)在进化中所受到的选择压力与背景枝存在显着的异质性差异;采用枝-位点模型在棉属PEBP家族MFT-L2和FT分枝分别检测到7个和2个正向选择位点,而MFT-L1分枝未检测到正向选择位点。(6)蔷薇类植物PEBP基因家族适应性进化检测表明,蔷薇类植物PEBP基因家族受到的选择压力ω均值为0.09675,印证了PEBP基因家族的进化保守特性;分枝模型分析表明,蔷薇类植物PEBP基因家族中MFT和FT分枝的选择压力与背景枝存在显着的异质性差异;采用枝-位点模型在MFT分枝和FT分枝分别检测到13个、6个正向选择位点;蛋白质分子叁维模拟表明,除VvFT蛋白质分子中的69V(对应于VvTFL1中的65T)外,所检测到的正向选择位点都分布在PEBP蛋白质分子表面。(7)植物PEBP基因家族在藻类祖先中至少包含2个拷贝;植物MFT-L1分支与MFT-L2分支的分化对应于被子植物祖先ε全基因组加倍事件,而棉花TFL1-L1与TFL1-L2、BFT-L1与BFT-L2则来自于棉属祖先的全基因组加倍事件;随着植物中全基因组加倍事件的持续发生,PEBP基因家族亦不断发生基因的复制、删除和分化等进化事件,现存棉花PEBP基因家族是历次植物全基因组加倍以及基因删除、分化的结果;在此基础上,重建了棉花PEBP基因家族的复制、删除和分化的进化模式和历史。(本文来源于《石河子大学》期刊2019-06-01)

Kelvin,Kimutai,Kering[8](2019)在《适应性进化及环境因素对马铃薯病原噬菌体在储存和应用中活性的研究》一文中研究指出噬菌体已被开发为许多植物病原菌有效的生物控制剂并且成为控制系统性疾病感染方法的一部分。噬菌体具有无毒特性、对宿主细菌的特异性、自我复制、克服细菌耐药性的能力和易于生产等优点,而且噬菌体在生态系统中无处不在,并且含量丰富,因此对噬菌体的分离是相对较为容易。噬菌体鸡尾酒疗法通常被用来控制不同植物病菌的感染,同时也能预防耐药菌的产生。基于以上特点,噬菌体被认为是很有前景的生物控制剂,然而在非低温的保存环境下,其储存稳定性仍然是一个重大挑战然,但是活性噬菌体在土壤中的密度又对其应用的效率是非常关键的。因此,本研究的目的是利用高温环境的适应性进化方式来筛选贮藏过程中活性稳定的噬菌体,并评价与马铃薯植株相关噬菌体混合物在不同环境中的生存能力。本研究第一部分通过高温实验,研究了3种不同马铃薯病原菌的噬菌体(Wc4,CX5,PPSG-11)的进化过程。噬菌体经过60°C处理并通过双层琼脂平板筛选活性更稳定的子代噬菌体,如此进行5个处理循环后的进化噬菌体和未进化的噬菌体在37°C保存60天后,并对他们的稳定性进行评估。结果表明,在60°C热处理后,祖先噬菌体(未进化的噬菌体)的滴度下降了3.30~5.47 log值,而进化后的噬菌体滴度只下降了0.34~1.90 log值。但是,祖先噬菌体和进化后的噬菌体在70°C热处理1 h后均无法存活。在37°C下储存60天后,进化噬菌体的效价降低约1.14~2.89 log值,而祖先噬菌体的效价损失约为2.0~5.2 log值。祖先噬菌体和进化的噬菌体在杀菌谱和裂解曲线方面无显着差异。我们的研究结果首次表明,可以通过适应性进化的方式提高噬菌体保存的稳定性。本研究第二部分采用裂解曲线评估裂解叁种马铃薯病原菌的噬菌体鸡尾酒,并对其与马铃薯生长相关的条件下对其活性进行评价。研究发现,Pectobacterium atrosepticum(Pba)噬菌体对高浓度的Cu SO4敏感,R.solanacearum噬菌体在25 m M和50 m M浓度的Cu SO4下几乎丧失全部效价。尽管不同浓度的Cu SO4都有被用来作为噬菌体的缓冲溶液使用,本研究结果更建议使用低浓度的Cu SO4来控制多数的植物病原菌。噬菌体在紫外线(功率8 Watt)中暴露5 min会丧失大部分活性,而且一般噬菌体能在马铃薯表面能持续存在长达2周,因此土豆噬菌体喷雾需要在阴暗的天气中进行并且每隔两周喷洒一次。本研究阐明了利用高温条件下噬菌体的适应性进化方式能够轻松地增强噬菌体贮存的稳定性。本文还测试了一些重要环境因素对混合噬菌体效价的影响,为噬菌体更好的应用提供了指导。(本文来源于《中国科学院大学(中国科学院武汉病毒研究所)》期刊2019-06-01)

史伟[9](2019)在《巴氏醋酸杆菌乙酸胁迫下生理和适应性进化初步研究》一文中研究指出高效率的醋酸发酵需要具有较高乙酸耐受性的醋酸菌,本文首先比较了亲本株Acetobacter pasteurianus CICIM B7003与突变株Acetobacter pasteurianus CICIM B7003-02发酵过程中生理和胞内微环境来揭示其生理水平的耐酸机制,后对突变株的培养条件和发酵过程进行了优化。乙酸耐受性增强的菌株涉及多个代谢路径中的基因突变,最后在亲本株和突变株中进行了比较基因组和酸胁迫下适应性进化初步分析。主要研究结果如下:(1)以Acetobacter pasteurianus CICIM B7003及其突变株Acetobacter pasteurianus CICIM B7003-02为研究对象,在7.5 L发酵罐中比较分批和半连续发酵过程中发酵动力学以及胞内微环境变化。10 g?L~(-1)底酸存在下,分批和半连续发酵中突变株的启动阶段明显缩短,产酸阶段突变株产酸速率略高,耐酸过程与产酸阶段相对分裂,突变株中与产酸直接相关的乙醇脱氢酶(Alcohol dehydrogenase,ADH)和乙醛脱氢酶(Acetaldehyde dehydrogenase,ALDH)的最高酶活分别提高27.0%和15.2%,辅酶Q_9含量提高69.5%。胞内微环境分析表明,突变株中十八碳烯酸含量比亲本株高31.5%,与比生长速率呈正相关的胞内ATP含量是亲本株2.33倍,胞内谷氨酸和天冬氨酸含量分别比亲本株提高10.7%和18.3%。突变株主要依靠加强乙醇呼吸链,增强ATP合成和关键氨基酸代谢等机制的协同作用提高酸胁迫抗性。(2)为达到耐酸能力与产酸能力的协调一致,以A.pasteurianus CICIM B7003-02为研究对象,基于乙醇呼吸链途径,从通气速率优化和加强呼吸链辅酶Q_9合成两个方面进行了产酸优化。首先进行不同通气速率下发酵动力学对比,建立了两阶段的通气发酵策略。后基于外源Fe~(2+)以及异戊烯醇调控,建立两阶段通气速率下的乙醇呼吸链营养因子强化发酵策略。结果显示,0.25 vvm的通气速率显着提高了初始生物量的积累,0.35vvm的通气速率提高了后期的产酸速率,溶氧降低至临界氧气浓度10%左右外源添加异戊烯醇和Fe~(2+)显着提高了发酵效率,35 h发酵结束,最终酸度为52.8 g?L~(-1),产酸速率达1.51 g?L~(-1)?h~(-1)。半连续发酵中平均产酸速率为1.67 g?L~(-1)?h~(-1),相对未优化的1.01 g?L~(-1)?h~(-1)提高了65.01%。(3)为探究突变株在基因和转录层面的耐酸机制,测定了A.pasteurianus CICIM B7003的基因组序列,其编码所有被报道具有乙酸耐受性的基因。与其它种内菌株对比显示,乙醇呼吸链以及叁羧酸循环供能途径基因相对保守。与A.pasteurianus CICIM B7003-02基因组对比显示,少数呼吸链及代谢基因出现了突变,包括F1F0 ATP酶的α亚基,PQQ-葡萄糖脱氢酶,泛醌细胞色素c还原酶和烟酸脱氢酶亚基B。供能途径中呼吸链基因,叁羧酸循环基因以及应激蛋白基因不同酸度下转录水平大部分呈上调趋势。呼吸链及代谢路径中突变基因转录水平分析显示,突变株中fapA,cyc1,gcd,nhaP,marR,mp1,pdc等基因在0,10 g?L~(-1),20 g?L~(-1),30 g?L~(-1)乙酸存在下转录水平都呈现上调趋势,mutS呈现下调趋势,其失活导致突变率大幅度上升。转录因子marR和膜蛋白基因mp1上游的插入缺失可能与乙酸耐受性有关。(4)为探究巴氏醋酸杆菌酸胁迫下适应性进化机制,以原始菌株A.pasteurianus CICIM B7003、诱变菌株A.pasteurianus CICIM B7003-02、模式菌株A.pasteurianus ATCC 33445为出发菌株,在20 g·L~(-1)和30 g·L~(-1)两个醋酸启动浓度下分别适应性驯化培养四个月,得到6株醋酸进化菌株P20,M20,T20,P30,M30,T30。共有突变基因富集分析表明突变主要集中在转录因子和膜蛋白上,代谢途径酶相对较保守。进化菌株种间对比显示,非同义突变率表现为M20>P20>T20,M30>P30>T30,突变频率表现为T20>P20>M20,T30>P30>M30。另外,M20和M30拥有最少的突变位点,A.pasteurianus CICIM B7003-02较高产酸和耐酸性能可能限制了耐酸适应性突变,此外,筛选了酸适应性突变基因(包含2种以上突变类型),包括磺酸ATP结合ABC转运蛋白基因(APA01_RS06905),乳酸脱氢酶(APA01_RS15365),DEAD/DEAH盒解旋酶基因(APA01_RS14860),XRE家族转录调节因子(APA01_RS15625,APA01_RS15630)等。(本文来源于《江南大学》期刊2019-06-01)

彭小川[10](2019)在《基于样本频率的重要亚型禽流感病毒适应性进化规律研究》一文中研究指出禽流感病毒主要在禽类宿主中流行,但是近年来不断有禽流感病毒跨越宿主屏障感染人类。全球首例人感染H5N1病毒的病例发生在1997年的香港,从2003年起,高致病性H5N1病毒感染人类的事件便不断在世界各地出现,至今已造成900多人感染。H7N9病毒自从2013年被报道出现人感染的病例以来,便一直在人群中不断流行,到2017年为止已经在中国大陆造成了5次疫情。为了应对禽流感病毒不断进化对人类造成的威胁,对它们遗传变异的监测就显得尤为重要。无论是禽流感病毒的毒力、复制能力、逃避免疫的能力,还是它跨越宿主屏障的潜力,都和病毒适应性进化过程中产生的突变密切相关。但是现有的对病毒突变的研究多是针对某一个或某几个位点展开的,虽然专一性强,但是缺乏对病毒适应性进化过程中突变规律的整体把控。在本文的第一部分工作中,我们建立了一种全面、批量、快速地寻找流感病毒进化过程中发生的全部重要突变的方法。该方法的核心是对病毒固有的信息进行数学建模,定义并计算“株频率”和“枝频率”,然后以频率为基础利用回溯的方式计算出进化路径上所发生的全部突变。该方法的最大优势在于它的通用性,完全不依赖于病毒的种类和任何特征,只需要待研究的病毒有完整的序列信息,并且按照年份进行演替。同时,基于突变后氨基酸在各年份间的频率变化和固定情况,我们还建立了一个突变评价体系来初步评价计算出的突变。在本文的第二部分工作中,我们选取H5N1病毒HA节段为研究对象,利用我们建立的方法对其适应性进化过程中的重要突变规律进行研究。一共计算出435个突变,得到了一张氨基酸固定及频率变化分布表。其中,有效变换79个,发生在36个位点上,其中20个在抗原表位上。结合氨基酸频率图表,我们推出有效变换的位点很有可能是正选择位点。同时,我们还发现了29个高频次突变位点,有14个落在HA抗原表位上,20个是已报道的正选择位点。因此我们认为高频次突变与病毒适应性进化密切相关,将高频次突变和有效变换结合起来评价突变将更有说服力。在本文的第叁部分工作中,我们应用建立的方法来研究H7N9病毒全基因组8个节段的突变规律。经过计算,我们最终得到HA上的突变46个,NA上的突变42个,PB1上38个,PB2上38个,PA上31个,NP上20个,NS1上31个,NS2上1个,M1上4个,M2上18个。和现有的研究对比后发现,已报道的突变大部分都在我们找到的突变当中,足以证明我们建立的方法准确可靠。同时,我们还发现HA节段上的M245I/L和L235Q很可能与第五波疫情及高致病性毒株的出现有关,L186I的出现提高了病毒的适应性;NA节段上I16T及Y171H在NA进化过程中都发生了两次,且都处在系统发生树的关键结点上,说明它们和病毒适应性的提高密切相关;内部节段中有很多突变与各波疫情的起伏都息息相关,研究它们的功能对我们探究各次疫情爆发的原因具有很大意义。无论是我们建立的突变寻找方法还是初步的突变评价体系,都为实验人员提供了一个很好的参考作用。对于病毒突变的研究,不必再拘泥于某一个或某几个人为观察到的位点上,而是在高效获得的全部突变中,利用我们的评价体系,挑选有意义的突变着重研究,既节省了时间,又给后续的实验研究指明了初步的方向。(本文来源于《军事科学院》期刊2019-05-18)

进化适应性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

小麦是重要的粮食作物之一,经历了复杂的杂交,异源多倍化,驯化和遗传改良过程。最近发布的高质量乌拉尔图和普通小麦参考基因组为相关领域研究提供了方便。为研究小麦适应性进化过程以及多样性变化,本研究共采集了小麦属和粗山羊草属26个不同种/亚种的420份材料,通过二代重测序分析,构建了第一代小麦遗传变异图谱。群体结构分析结果表明,栽培二粒是由野生二粒小麦一次驯化形成的;斯卑尔托小麦的四倍体祖先种为不易脱粒的栽培二粒小麦,而普通小麦的四倍体祖先种是易脱粒的四倍体。遗传多样性分析结果表明,在小麦的驯化和改良过程中伴随着多样性的降低,但四倍体向六倍体的渗入会造成A和B基因组多样性的增加,因此在六倍体中,A和B基因组的多样性要显着高于D基因组。同时,对小麦属中一粒小麦和二粒小麦的两个独立驯化过程以及四倍体和六倍体小麦中遗传改良过程进行分析,揭示了小麦从野生型到栽培型驯化过程中的趋同演化过程,例如Btr1基因,在小麦和大麦中均受到驯化选择。本研究为小麦进化提供了新的视角,并有助于小麦遗传和育种研究。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

进化适应性论文参考文献

[1].张剑搏,丁学智,Anum,Ali,Ahmad,李晨,梁泽毅.高原土着动物适应性进化的研究进展[J].畜牧兽医学报.2019

[2].周姚,赵学博,李义文,徐俊,毕傲月.小麦群体的趋同和适应性进化研究[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019

[3].魏鑫丽,王延延,王治军,刘大乐,魏江春.地衣的分布格局及适应性进化研究——以梅衣科和瓶口衣科等若干类群为例[C].多彩菌物美丽中国——中国菌物学会2019年学术年会论文摘要.2019

[4].王卓,国红玉,张妍彤,朱金丽,邢朝斌.五加科药用植物鲨烯合酶的适应性进化分析[J].中草药.2019

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进化适应性论文-张剑搏,丁学智,Anum,Ali,Ahmad,李晨,梁泽毅
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