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鸡球虫病是一种对养鸡业危害极大的寄生原虫病，病原包括柔嫩艾美球虫、毒害艾美球虫、巨型艾美耳球虫、堆型艾美耳球虫、和缓艾美耳球虫、哈氏艾美耳球虫、早熟艾美耳球虫、布氏艾美耳球虫、变位艾美耳球虫。本文总结了一般养殖场防治方法。
一、管理因素
1.消毒程序的制定
经调查发现，许多养殖户并没有严格的消毒程序，有的养殖户直接只使用火碱或漂白粉溶液泼湿地面，这样的消毒并不是没有作用，但它并不严格，只杀死了少数地面的病原体，对空气中及使用物品中的病原体并没有杀灭；有的养殖户使用消毒剂种类繁多，喷雾消毒时细心并且严格，但喷雾消毒有它的死角。所以熏蒸消毒是必不可少的，当温度湿度达到要求后，甲醛气体可以达到每一个死角。
2.饲养人员的管理
大部分集约化管理的大中型养殖场有大量的员工，员工与员工之间有他们自己的交际圈。人与人的沟通，相邻或相近的鸡舍间一定有交流、有竞争，那么就少不了接触，病原微生物就在接触的过程中，在鸡舍与鸡舍间传播，这也是大部分养殖场发病时常全场一起发生的原因之一。
3.鸡舍内使用物品的管理
养殖场中鸡舍与鸡舍使用物品是各鸡舍私有，应该是不会共享，但是不可避免有时有特殊或紧急情况，需要借用物品，如饮水用药、免疫时，饮水壶数量不够，那么就需要借用，时间紧急就会在消毒上有所不足，那么就有可能引起交叉感染，使健康雏鸡患病。
二、疾病防治
1.化学药物法
（1）离子载体类抗生素
本类药物是聚醚类的离子载体抗菌剂，这类药物分子结构具有一个有机酸基团和多个醚基团，在溶液中带负电荷，与钠、钾、钙、镁等在虫体内起重要作用的阳离子结合成脂溶性络合物，协助阳离子进入虫体内，破坏细胞内外的正常离子平衡，使细胞内外形成渗透压差，大量水份进入，最后导致虫体细胞破裂死亡。这类药物还通过干扰营养物质穿过细胞膜的运输而发挥作用。细菌学试验表明，当膜外的pH低于膜内时，糖类的运输就会受到抑制。同样，在球虫感染的细胞内阶段，由于宿主细胞膜被寄生虫损坏后不能在细胞和肠管之间形成有效的屏障，而产生了一个低pH环境，使寄生虫对糖类的吸收受到限制。这类药物主要是磺酰胺类，如马杜霉素和莫能菌素，它们主要作用于侵入期虫体(子孢子，第一、二代裂殖子)。
（2）氯氟苄腺嘌呤
氯氟苄腺嘌呤简称氟腺呤，是目前核苷类化合物中作为抗球虫药物的唯一品种，氯氟苄腺嘌呤通过干扰球虫的嘌呤代谢而发挥抗球虫作用。抗球虫活性主要集中在球虫的无性生殖期，对卵囊的孢子化也有一定的抑制作用。氯氟苄腺嘌呤本身抗球虫作用不强，在动物机体内肝脏中药酶的作用下，可氧化成氯氟苄腺嘌呤-1-氮-氧化物，其氧化物的抗球虫活性比原药强。本品是一种新型广谱抗球虫药物，与其他抗球虫药无交叉耐药性，但球虫对本品易产生耐药性，影响了它的推广使用。
（3）影响辅酶与合成的抗球虫药
这类药物以磺胺类为代表。作为控制球虫病的预防性药物，磺胺和氨丙啉曾一度被广泛应用。磺胺类药物通过与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶妨碍二氢叶酸的形成从而抑制球虫的正常发育，对所有球虫的第2代裂殖子最为有效。氨丙啉在球虫代谢过程中取代硫胺，使许多有硫胺参与的碳水化合物代谢反应不能进行，从而抑制了球虫的发育。它的最高活性在周期的第3天，即对第1代裂殖子最为有效，另外它对有性周期和子孢子也有一定作用。
2.疫苗法
（1）普通疫苗
鸡对九种球虫的免疫应答不仅存在虫种的特异性，而且也存在着针对同一种不同发育阶段的特异性，但在种间和种内又存在着共同的特异性抗原。大多数虫种一次感染后，鸡能对其再感染产生某种程度的抵抗力，反复免疫(如涓滴免疫)后，鸡能产生较强的免疫力，基于这一现象可设计一种免疫方案，即用小剂量强毒或不足以引起发病的弱球虫卵囊免疫鸡。鸡由于反复啄食卵囊而引起加强免疫，产生了较强的免疫力。根据这一原理已生产出一些实用的疫苗，有些老兽医也将球虫粪用水稀释过滤后给健康鸡食用，这对球虫的预防有一定作用。
（2）基因工程疫苗的研究进展
目前已克隆出许多鸡球虫基因，并已证实一些基因表达的蛋白具有部分的保护性。保护性的大小与基因的重要性有直接关系，同时也与鸡的基因背景和抗原递呈方式有很大关系。当B基因型鸡用重组蛋白cSz-1和Cmz-8免疫时，不同品系的鸡会表现出不同的免疫效果，用表达重组抗原GX3262的热致死大肠埃希氏菌和活大肠埃希氏菌免疫2日龄雏鸡，发现活菌比热致死菌效果好。
用重组抗原5401加佐剂(FCS)皮下免疫4周龄鸡一次，3周后用致病力弱的卵囊攻毒，发现该抗原免疫能减少鸡的死亡率，增加饲料报酬和提高增重，但减轻病变的效果差。
3.中草药法
中草药防治鸡球虫病已运用于生产实际。例如杨再昌根据鸡球虫的病因、发病机制、病理变化和症状，结合中兽医辨证论治的原则，设计了以土大黄30%、黄柏30%、黄芩40%比例配方的中药添加剂，在抗球虫方面取得了较理想的效果，ACI值达194.3。据分析，鸡发生球虫病时，崩解的肠道上皮细胞变为有毒物质，蓄积在肠管中不能迅速排出，使机体发生自体中毒。土大黄具有泻下作用，能促进肠管中有毒物质的排出。同时设计的涩肠止泻组(石榴皮60%，诃子40%)无效，说明针对鸡球虫病的血便宜“通”不宜“塞”。
苦艾树的煎药主要成份是青蒿素(Artemisinin)，纯青蒿素对预防球虫感染有一定的作用，但这种作用取决于感染后饲喂药物的时间。
4.耐药性的延缓措施
当使用化学药物防治球虫时，就随之产生了球虫对药物的耐药性问题。迄今从养鸡现场分出了几乎对所有使用过的抗球虫药有耐药性的虫株，有的还表现出一定程度的交叉耐药性与多重耐药性。综述前面的观点，根据药物的各自特点，合理应用这些抗球虫药物，可延缓球虫耐药性的产生(但不是根除耐药性的出现)。
（1）穿梭给药
根据球虫病高发阶段用高效球虫药、低发阶段用低效球虫药的原则，对肉用仔鸡不同生长阶段使用不同的抗球虫药，即为穿梭给药，以保证给药方案合理有效。
（2）轮换用药
即第一批鸡使用一种抗球虫药，第二批鸡使用另一种化学结构不同的抗球虫药。因为有研究表明，化学结构相似或作用机理相同的抗球虫药可能存在交叉抗药，所以在轮换用药中应尽量避免应用作用方式相似的抗球虫药。
（3）联合用药
对付耐药性形成的另一有效策略是将两种或多种抗球虫药按最佳比例配合使用，既可提高疗效，又可降低单一药物的使用浓度，在一定程度上延缓了球虫耐药性产生的速度，保持了其对抗球虫药的敏感性。