简并扩增论文-华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳

简并扩增论文-华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳

导读:本文包含了简并扩增论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:高简并性引物,不规则降落PCR,基因家族,扩增

简并扩增论文文献综述

华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳[1](2011)在《高简并引物小温度范围不规则降落PCR在庞大基因家族扩增中的应用》一文中研究指出[目的]探讨高简并性引物扩增庞大基因家族基因的特殊方法。[方法]采用高简并引物对鲤鱼基因组DNA分别进行了常规PCR扩增、常规降落PCR扩增以及优化后的小温度范围不规则跳跃降落PCR扩增。[结果]采用常规PCR仅得1条明显条带,得到的基因较少;采用常规降落PCR仅得到弥散性扩增,无明显条带出现;而采用小温度范围不规则跳跃降落PCR则得到了3条明显条带和多个基因,扩增结果理想。[结论]为庞大基因家族扩增条件的优化与选择提供了理论依据。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2011年17期)

华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳[2](2011)在《高简并引物小温度范围不规则降落PCR在庞大基因家族扩增中的应用(英文)》一文中研究指出[目的]探讨了高简并性引物扩增庞大基因家族基因的特殊方法。[方法]采用常规高简并引物对鲤鱼基因组DNA分析进行了常规PCR扩增、常规降落PCR扩增以及优化后的小温度范围不规则跳跃降落PCR扩增。[结果]采用PCR仅得1条明显条带,得到的基因较少;采用常规降落PCR法仅得到弥散性扩增,无明显条带出现;而采用小温度范围的不规则跳跃降落PCR则得到了得到了3条明显条带和多个基因,扩增结果理想。[结论]为庞大基因家族扩增条件中的优化与选择提供了理论依据。(本文来源于《Agricultural Science & Technology》期刊2011年02期)

王晶,乔龙,孙海翔,胡娅莉,李洁[3](2008)在《简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究》一文中研究指出[目的]研究影响简并寡核苷酸引物聚合酶链反应(degenerate oligonucleotide primed PCR,DOP-PCR)扩增单细胞全基因组的因素。[方法]以单个人外周血淋巴细胞为材料,进行DOP-PCR,研究新鲜细胞与冷藏细胞及采用新鲜和冻存的细胞裂解物为模板对扩增产物的均匀性及特异性的影响。[结果]以新鲜的淋巴细胞为模板与以冷藏的淋巴细胞为模板相比,扩增产物的均匀性相当,特异性上新鲜细胞较好。细胞裂解后立即进行扩增的效果在产物的均匀性及特异性方面均明显优于冻存的细胞裂解物。[结论]对单细胞应用DOP-PCR方法进行全基因组扩增时,应尽量选取新鲜细胞进行裂解,裂解后避免冻存以保证扩增的均匀性及特异性。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2008年16期)

肖扬,唐利华,边银丙[4](2006)在《应用简并引物扩增黑木耳信息素受体基因片段》一文中研究指出Degenerate primers, br1-F and br1-R, designed based on the conserved amino acid sequence of STE3 pheromone receptor in Schizophyllum commune, were used to amplify genomic DNA of monkaryotic parental strains(H2, J3) and fifty-nine monokaryons of their F1 progenies in Auricularia auricula. A fragment of the PCR product 811bp in length were amplified from the parental strain H2, nine monokaryons of the H2 mating –type and fifteen ones of the J3 mating –type of F1 progenies. After cloning , sequencing the fragment, and analyzing the sequence by BLAST searching, no homologous sequences were found. However, the putative protein sequences translated from the DNA sequence had homeodomain protein called fungal STE3 pheromone receptor, and seventy-six homologous sequences were hit, with their e values ranged from 2e-35 to 6.6. It is predicted by the use of SOSUI program that the putative protein is a membrance protein including five transmembrance domains. The recombination ratio was 62.7% between the fragment of STE3 pheromone receptor gene and the mating type locus among F1 progenies of Auricularia auricula. This result indicated that the pheromone receptor gene was not linked to the mating type factor, as reported in Pholiota nameko, a bipolar edible mushroom. This study would lay a foundation for cloning the complete pheromone receptor gene and testing its function in the future.(本文来源于《菌物学报》期刊2006年02期)

杨金先,陈强,刘晓东,林天龙,Theodore,G[5](2004)在《简并PCR扩增小瓜虫抑动抗原基因的ORF》一文中研究指出抑动蛋白是小瓜虫(Ichthyophthiriusmultifiliis)体表纤毛的主要构成部分,也是宿主免疫系统发挥抗虫免疫时的主要识别抗原。根据已经报道的3种抑动蛋白N端及C端保守的多肽片断,设计了一对简并引物P6/P7,以小瓜虫分离株IchFJ9的基因组为模板,成功扩增了抑动蛋白编码区(ORF)的全长基因序列。扩增的iagFJ9基因全长1398bp,编码466个氨基酸,包含18个非标准密码子TAA(Glu,Q)推导的氨基酸序列包含6个以CPXGT为起始的串联重复单位,具有抑动蛋白的特征性结构。同源比较分析显示,扩增的iagFJ9基因与已知的小瓜虫抑动蛋白基因IAG52A基因具有88%同源率。证实了iagFJ9是一个新发现的抑动蛋白基因,用简并PCR技术去发现小瓜虫抑动蛋白基因家族新基因是可行的。(本文来源于《中国水产科学》期刊2004年02期)

陈炯,陈剑平[6](2002)在《Potyvirus属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法》一文中研究指出Based on multi-alignment of complete polyprotein amino acid sequences of genus Potyvirus,five degenerated primers were designedThey were Sprimer(5′-GGX AAY AAY AGY GGX CAZ CC-3′),pNIa(+)(5′-TNY TGG AAM CAY TGG AT-3′),pCI2(+)(5′-GCX ACX AAX ATX ATX GAX AA-3′),pCI1(+)(5′-GTX GGX TCX GGX AAX TCX AC-3′)and pHC(+)(5′-TGY GAY AAY CAZ TTX GA-3′)(X=A,T,C or G:Y=T or C;Z=A or G;N=A or T;M=A,T or G)Using degenerated PCR and modified RACE methods,a protocol for determination of complete genome sequence of potyviruses was established and proved to be successful on five potyviruses(本文来源于《病毒学报》期刊2002年04期)

陈炯,陈剑平[7](2002)在《马铃薯γ病毒属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法》一文中研究指出马铃薯Y病毒属(genus Potyvirus)是已确定的植物病毒属中最大的一类,有约200个种类被ICTV接受为确定成员或可能成员,占已发现的植物病毒总数的20%,且新成员数量仍在不断增加中,是种类最多、寄主范围最广、经济意义最大的病毒属。该属成员单链正性RNA基因组长一般在10000个核苷酸左右,3'-末端具有poly(A)尾,含单一的大开读框,该属成员基因组全序列的克隆方法通常采用双链cDNA克隆。由于基因组较长,近全长克隆效率极低。(本文来源于《中国植物病理学会第七届代表大会暨学术研讨会论文摘要集》期刊2002-04-01)

杜占文,张俊武[8](2001)在《应用简并引物RT-PCR扩增锌指结构域筛选新基因》一文中研究指出目的 应用简并引物RT-PCR扩增并克隆TF-ⅢA型锌指蛋白基因表达序列标签(EST),以最终获得新的锌指蛋白基因。方法分别用TPA和Hemin诱导人红白血病(HEL)细胞,提取总RNA。根据TF-ⅢA型锌指蛋白保守序列设计简并引物,并以之进行RT-PCR扩增,然后将其克隆到pGEM-T easy载体中测序,应用DNAsis软件分析序列并通过GenBank blast进行序列比较。结果克隆并测序了30个扩增片段,22个是锌指蛋白基因的EST,其中17个是新的锌指蛋白基因EST。结论应用简并引物RT-PCR克隆一些具有保守氨基酸顺序结构域的蛋白基因EST是可行的,并具有简便、高效等优点。此外,还可有目的地克隆一些具有重要功能结构域的蛋白质基因。(本文来源于《中国医学科学院学报》期刊2001年03期)

金帆,黄荷凤,叶英辉,徐晨明,邢兰凤[9](2000)在《简并寡核苷酸引物聚合酶链反应扩增单细胞全基因组均匀性研究》一文中研究指出目的 探讨单细胞简并寡核苷酸引物聚合酶链反应 (DOP PCR)扩增全基因组DNA的均匀性及植入前胚胎遗传学研究的新途径。方法 获取正常男女性、X单体、X、13和 2 1叁体细胞 ,行单细胞DOP PCR ,通过比较基因组杂交 (CGH )双色荧光强度比变化 ,分析扩增均匀性。结果  (1)DOP PCR产物 /正常男性基因组DNACGH :约 1/ 3常染色质区强度比均数及标准差超过正常允许范围 ,X染色体假性过度表达 ,13、2 1叁体无明显变化。 (2 )DOP PCR产物 /正常男性单细胞DOP PCR产物CGH :94%强度比均数及标准差接近期望值 ,能显示正常男女性、X单体、X、13和 2 1叁体染色体拷贝数变化。结论 单细胞DOP PCR扩增基因组DNA存在明显的不均匀性 ,但这种不均匀扩增是非随机的。如选择合适的参照 ,扩增产物可用于植入前胚胎等单细胞全基因组研究。(本文来源于《中华妇产科杂志》期刊2000年08期)

吕星,邢瑞云,郑晖,姚启智[10](1999)在《用简并引物扩增与克隆D.radiodurans超氧化物歧化酶和过氧化氢酶基因片段》一文中研究指出依据超氧化物歧化酶(SOD) 和过氧化氢酶(Cat) 的保守性氨基酸序列,设计简并引物,自D.radiodurans 基因组DNA扩增并克隆了SOD和Cat 基因片段.SOD 和Cat 基因片段分别长453 bp 和673 bp,各编码151和224 个氨基酸,氨基酸序列与不同生物来源的SOD或Cat 具有高度同源性(本文来源于《应用与环境生物学报》期刊1999年05期)

简并扩增论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

[目的]探讨了高简并性引物扩增庞大基因家族基因的特殊方法。[方法]采用常规高简并引物对鲤鱼基因组DNA分析进行了常规PCR扩增、常规降落PCR扩增以及优化后的小温度范围不规则跳跃降落PCR扩增。[结果]采用PCR仅得1条明显条带,得到的基因较少;采用常规降落PCR法仅得到弥散性扩增,无明显条带出现;而采用小温度范围的不规则跳跃降落PCR则得到了得到了3条明显条带和多个基因,扩增结果理想。[结论]为庞大基因家族扩增条件中的优化与选择提供了理论依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

简并扩增论文参考文献

[1].华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳.高简并引物小温度范围不规则降落PCR在庞大基因家族扩增中的应用[J].安徽农业科学.2011

[2].华慧颖,王芳,常重杰,杜启艳.高简并引物小温度范围不规则降落PCR在庞大基因家族扩增中的应用(英文)[J].AgriculturalScience&Technology.2011

[3].王晶,乔龙,孙海翔,胡娅莉,李洁.简并寡核苷酸引物PCR扩增单细胞基因组的影响因素研究[J].安徽农业科学.2008

[4].肖扬,唐利华,边银丙.应用简并引物扩增黑木耳信息素受体基因片段[J].菌物学报.2006

[5].杨金先,陈强,刘晓东,林天龙,Theodore,G.简并PCR扩增小瓜虫抑动抗原基因的ORF[J].中国水产科学.2004

[6].陈炯,陈剑平.Potyvirus属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法[J].病毒学报.2002

[7].陈炯,陈剑平.马铃薯γ病毒属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法[C].中国植物病理学会第七届代表大会暨学术研讨会论文摘要集.2002

[8].杜占文,张俊武.应用简并引物RT-PCR扩增锌指结构域筛选新基因[J].中国医学科学院学报.2001

[9].金帆,黄荷凤,叶英辉,徐晨明,邢兰凤.简并寡核苷酸引物聚合酶链反应扩增单细胞全基因组均匀性研究[J].中华妇产科杂志.2000

[10].吕星,邢瑞云,郑晖,姚启智.用简并引物扩增与克隆D.radiodurans超氧化物歧化酶和过氧化氢酶基因片段[J].应用与环境生物学报.1999

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