导读:本文包含了分子标记连锁图谱论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:小麦,ILs群体,SSR标记,遗传多样性
分子标记连锁图谱论文文献综述
吕百川,苏其红,辛筱筱,孙娟,刘小雪[1]（2019）在《小麦ILs群体SSR分子标记遗传连锁图谱构建》一文中研究指出【目的】为小麦回交导入系(introgression lines,ILs)群体(‘晋麦47’ב西峰20’)构建简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记遗传连锁图谱.【方法】通过小麦ILs群体160个株系对2 306对均匀分布在21条染色体上的SSR标记进行多态性筛选,利用筛选出的多态性SSR标记对该群体进行遗传多样性分析和遗传连锁图谱构建.【结果】该群体共筛选出442个多态性SSR标记,每个SSR位点平均遗传多样性指数(H′)为0.31,多态性信息量(PIC)为0.25.其中,B基因组和第Ⅲ同源群H′与PIC较高,而D基因组和第Ⅰ同源群较低.通过聚类分析,该群体160个株系可分为5大类群.利用多态性SSR标记构建了1套涵盖小麦21条染色体的遗传图谱,总长度5 857.39 cm,每条染色体的平均长度为277.27 cm,标记间的平均距离为13.25 cm.【结论】构建了1条可用于小麦复杂数量性状精细定位和分子标记辅助选择育种的遗传连锁图谱.(本文来源于《甘肃农业大学学报》期刊2019年05期）
李佳奇,于卓,杨东升,于肖夏,吴国芳[2]（2019）在《基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建》一文中研究指出构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4～179.0cM,覆盖基因组总长度1 912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。(本文来源于《西北植物学报》期刊2019年01期）
杨东升,于卓,于肖夏,李晓宇,吴国芳[3]（2018）在《四倍体杂交冰草SRAP和SSR分子标记遗传连锁图谱构建》一文中研究指出为了给后期冰草抗旱耐寒基因筛选及QTL图位克隆搭建平台,并为产量及相关性状QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础,以航道冰草和蒙古冰草为亲本,杂交加倍后随机选取180个F2分离单株为作图群体,利用SRAP和SSR分子标记进行四倍体杂交冰草遗传连锁图谱的构建。结果表明,构建的图谱包含475个标记(240个SRAP标记和235个SSR标记),分布于14个连锁群,图谱全长为1 592.7cM,标记间平均间距为3.35cM,各连锁群长度范围为67.6~145.2cM。该图谱密度较高、标记位点分布均匀且连锁群更加饱满。(本文来源于《麦类作物学报》期刊2018年08期）
权彪[4]（2018）在《分子标记在绿豆遗传连锁图谱构建和基因定位研究中的作用》一文中研究指出绿豆是一种医食两用的豆类作物,在改善土壤条件和提高农户收入方面有着重要的影响,但是当前国内外对于绿豆遗传学方面的研究还比较少,分子标记作为一种新型的生物技术研究手段,可以帮助研究绿豆基因组的结构和功能,能够用于基因定位研究,分子克隆方面等,在绿豆遗传学研究中遗传连锁图是重要的研究内容,也是微观层面不可缺少的技术平台。近年来,国内外实验室运用分子标记技术已经成功构建了20张以上的绿豆遗传连锁图谱,其中对绿豆基因组中的抗性基因及具有优良性状控制的基因进行精确定位,为绿豆的分子标记提供基础,有利于研究抗性菌株以及优良品种的培育。本文通过对分子标记在绿豆遗传连锁图谱构建,以及一些抗性基因、优良基因等具有重要功能的基因进行精确定位和功能研究,并分析了控制绿豆的农艺性状基因鉴定,为之后对绿豆全基因组学分析及优良品种培育提供参考。(本文来源于《科技风》期刊2018年15期）
姜志艳,于肖夏,于卓,张志成,石悦[5]（2016）在《利用SSR分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱》一文中研究指出为构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,对深入开展冰草产量、抗性等重要性状的QTL定位及分子标记辅助育种提供依据,以四倍体杂种F2分离群体的347个单株及亲本蒙古冰草和航道冰草为材料,采用SSR分子标记技术和Joinmap 4.0软件进行了遗传作图研究。试验从256对SSR引物中筛选出条带清晰稳定、多态性丰富的适宜引物30对,PCR扩增得到224个SSR标记位点,平均每对引物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185个,占82.6%。偏分离分析显示,在185个SSR多态性标记位点中有24个标记产生偏分离,占13.0%,符合植物遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求,可用于遗传作图。构建了1张四倍体杂交冰草的分子遗传连锁框架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,其长度范围在123.0~202.6cM之间,连锁群LG4最长、LG12最短,各连锁群的平均长度167.32cM,覆盖基因组总长度2342.5cM,标记间的平均距离12.66cM。(本文来源于《草业学报》期刊2016年06期）
王晓萃[6]（2016）在《分子标记技术及其在林木遗传连锁图谱构建中的应用》一文中研究指出分子标记是一种新型的遗传标记,通过着重介绍以不同反应原理为基础的分子标记技术及其在林木遗传连锁图谱构建中的应用,并随着分子标记技术的不断更新,将极大地推动林木遗传改良进程的发展。(本文来源于《北京农业》期刊2016年04期）
林范学,李宏盛,黄杰,谭琦,鲍大鹏[7]（2015）在《运用SNP分子标记构建香菇遗传连锁图谱及分析QTL》一文中研究指出本研究以香菇135菌株的2个原生质体单核体135A菌株和135B菌株以及46个孢子单核体为构图群体,通过solexa高通量测序获得基因组序列,对135A和135B进行了组装,组装后的基因组大小分别是37.9Mb和38.9Mb。以135A菌株的基因组序列为参考序列,通过对135B菌株和46个子代的基因组序列和筛选,获得了136,411个SNP位点。以2255个SNP位点和A、B交配型位点为标记构建出一张香菇遗传连锁图,包括14个连锁群,总长度为1553.78cM。根据SNP标记所在的scaffold,将531条scaffold(总长度为23.69 Mb)定位在14条连锁群上,覆盖62.47%的香菇135A菌株的基因组,物理长度和遗传距离之比为15.37kb/cM。以上述构图群体为定位群体,检测到了3个控制香菇单核菌丝体生长速度的QTL,其中在LG2上检测到了一个显着的QTL(Qmmgr-3),其贡献率为28.8%,与交配型A位点连锁。通过生物信息学分析Qmmgr-3位点附近的DNA序列信息,筛选获得了控制香菇单核菌丝体生长速度的3个候选基因(Le-TDC,Le-CH和Le-CP)。RT-PCR分析表明Le-CP基因在长速快的菌株中和长速慢的菌株中的表达水平存在显着差异。(本文来源于《中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集》期刊2015-09-20）
王婷婷[8]（2015）在《向日葵SSR分子标记遗传连锁图谱的构建与QTL定位研究》一文中研究指出本研究以高抗旱油用向日葵自交系K58与低抗旱油用向日葵自交系K55为亲本,由其组配的F1代杂交种及通过单粒传方法获得的187个F6RILs群体为试验材料,利用SSR分子标记对油用向日葵遗传连锁图谱进行构建,并对芽苗期相关性状进行了QTL定位,为向日葵的基因图位克隆、分子标记辅助育种等相关工作奠定了重要理论基础。主要研究结果如下：1、试验筛选出46对SSR引物组合,对向日葵F6RILs群体的187个单株进行PCR扩增,扩增得到129个多态性位点,与实验室前人所做的184个SSR位点进行整合后共得到313个位点,这些位点中有130个为偏分离标记,占总标记位点数的41.5%。2、利用JoinMap 4.0构建了一张含有17个连锁群的遗传图谱,去除严重偏分离位点后对其余271个标记位点进行图谱构建,共有165个标记位点进入连锁群,覆盖基因组总长度为1230.0cM,标记间平均间距为7.5cM。图谱中第1连锁群最长,为229.7cM；第17连锁群最短,为2.3cM。3、发芽率、发芽势、发芽指数等在两种水分条件下的9个室内发芽性状指标和出苗率、地上鲜重、根鲜重等9个大田测得的苗期性状指标经方差分析可知,187个株系间均呈现出显着或极显着差异,且均呈现正态分布,18个农艺性状表型性状值均可用于QTL定位分析。4、相关分析结果表明,两种水分条件下的芽期性状指标和大田测得的苗期性状指标间均存在着一定的相关关系。在两种水分条件下,芽期性状指标间均表现出不同程度的显着正相关性：在大田测得的苗期性状指标间,根鲜重与叶绿素含量、叶片数与叶面积间两两呈现出极显着正相关性,根干重与叶片数间呈现出显着正相关性。5、利用IciMapping 4.0定位软件,采用ICIM作图法,以LOD值为2.5作为QTL入选临界值,对18个农艺性状进行QTL定位分析。结果表明,控制8个农艺性状的12个QTL分布在5个连锁群上,且每个连锁群上分布不均匀。在第1连锁群上分布最多,检测到5个QTL；第7和第10连锁群上分布最少,分别检测到1个QTL。其中,干旱胁迫下,检测到控制发芽势和发芽指数的QTL各1个；正常供水条件下,检测到控制发芽指数的QTL1个,控制胚根鲜重的QTL2个,控制胚芽鲜重的QTL1个；大田中测得的苗期相关性状中,检测到控制根鲜重的QTL2个,控制地上干重的QTL3个,控制叶面积的QTL1个。(本文来源于《内蒙古农业大学》期刊2015-06-01）
梁小玉,季杨,白史且,黄琳凯,张新全[9]（2015）在《基于SRAP分子标记构建的菊苣遗传连锁图谱》一文中研究指出基于SRAP标记,以遗传关系和表型差异大的菊苣亲本PI 651947和PI 652007杂交获得的84个F1单株为作图群体,进行连锁图谱的构建。采用Map Manager QTX b20软件进行连锁分析,分别构建了PI 651947和PI652007的分子连锁框架图,共获得77个SRAP标记,其中父本遗传图谱涉及4个连锁群,包含19个标记,图谱总长为450.9cM,标记间平均图距为23.7cM。母本遗传图谱涉及13个连锁群,包含58个标记,图谱总长为1404.8cM,标记间平均图距为24.2cM。研究结果可为菊苣重要农艺性状QTL定位奠定基础,为菊苣分子育种研究提供了基础信息。(本文来源于《草业学报》期刊2015年05期）
李煜[10]（2015）在《杜仲高密度遗传连锁图谱构建与重要数量性状的分子标记》一文中研究指出杜仲(Eucommia ulmoides)是唯一存在的杜仲科杜仲属植物,雌雄异株,是重要的药用和胶用经济树种。杜仲皮和叶中含有绿原酸和黄酮等多种药用有效成分,具有降血压、降血糖、抗氧化、抗突变等药理作用。杜仲除了木质部外各个部位均含有杜仲胶,成分为反式-聚异戊二烯,是一种具有热塑性的硬质橡胶,被用来制造轮胎、海底电缆、假牙具、密封部件等材料。传统的杜仲育种主要依靠从自然群体中选择优良的个体,已经育成一些品种以无性系的形式推广,并以这些品种及无性系为亲本开展了杂交育种。但是,利用传统育种方法育成一个品种周期较长,而且对于杜仲重要性状的遗传基础研究比较薄弱,限制了杜仲育种的进程。分子育种方法,尤其是分子标记辅助选择,可以提高选择效率,加速育种进程。本研究利用多种分子标记技术检测了杜仲主要栽培品种及无性系的遗传差异,构建了一张杜仲高密度遗传连锁图谱;在连续5年表型性状测定的基础上,对杜仲生长、物候、叶片形态、叶片产量、药用有效成分及胶含量等性状进行了QTL分析;并探讨了杜仲杂交亲本分子标记遗传距离与子代生长性状之间的关系。相关研究结果为在分子水平开展杜仲遗传改良工作奠定基础,对深刻理解杜仲重要经济性状的遗传机制具有重要意义。主要研究结果如下:1.利用SRAP、AFLP、ISSR叁种分子标记技术,评价了杜仲主要栽培品种及无性系的遗传多样性及其亲缘关系。19个杜仲主要栽培品种及无性系具有较高的DNA多态性,采用的10对SRAP引物组合、10对AFLP引物组合、10条ISSR引物分别产生240个、192个、150个DNA片段,其中多态性DNA片段分别为214个、125个、132个,多态性比率分别为89.2%、65.1%、88.0%。聚类分析结果表明,秦仲3号、小叶(雄)、秦仲1号、秦仲2号独自聚为一类,说明这4个种质之间及与其它15个种质之间具有明显的遗传差异;其他15个种质聚为两大类,每类内部表现出较高的遗传相似度;这为杜仲基因组作图和杂交育种的亲本选配提供参考。另外,SRAP是一种高效率的分子标记技术,可以产生较多的多态性标记,在杜仲高密度遗传连锁图谱构建中可以作为主要的分子标记技术。2.以152株“小叶×秦仲1号”F1子代为作图群体,利用SRAP、AFLP、ISSR、SSR四种分子标记技术构建杜仲遗传连锁图谱。182个引物(或引物组合)总共产生2142个多态性标记,平均每个引物(或引物组合)产生11.8个多态性标记;其中,623个多态性标记偏分离(p≤0.05),占总多态性标记的29.0%。利用Join Map 4.0对符合孟德尔分离比的1519个标记进行连锁分析,构建了一张杜仲高密度遗传连锁图谱。该图谱包含706个标记,分属25个主要连锁群,总图距2133 c M;每个连锁群的标记数目从5个到106个不等;每个连锁群的图距从19.9 c M到194.0 c M不等,平均为85.3 c M;两个相邻标记之间的平均间距为3.1 c M,图谱覆盖率为89%。这为杜仲重要经济性状的QTL定位以及深入研究杜仲基因组的结构和功能提供了基础。3.在作图群体表型变异分析的基础上,对苗(树)高、地径、萌芽期、展叶期、冠幅、分枝数、分枝角、枝长、枝径共9个杜仲生长与物候相关性状进行了QTL分析。这9个性状总共检测到97个QTL,每个QTL分别解释表型变异的8.7%~70.5%。达到基因组水平LOD阈值的QTL有60个,占QTL总数的61.9%;其它的QTL虽然没有达到基因组水平LOD阈值,但是其LOD值都大于或等于3。单标记分析法的结果表明这97个QTL的侧翼标记中有58个与性状显着相关(p≤0.1),占总数的59.8%。在遗传连锁图谱的14个连锁群上(LG1、LG3、LG5、LG7、LG9、LG10、LG12、LG14、LG18、LG20、LG21、LG22、LG23、LG24),分布有24个QTL聚集区域,每个QTL区域至少包含有两个不同生长或物候相关性状的QTL。4.在作图群体表型变异分析的基础上,对叶面积、叶长、叶宽、叶长宽比、叶柄长、叶脉数、单叶重、叶片数、产叶量、绿原酸含量、芦丁含量、杜仲胶含量等涉及杜仲叶片形态、产量、次生代谢物含量的12个性状进行了QTL分析。这12个性状总共检测到133个QTL,每个QTL分别解释表型变异的8.7%~73.7%。达到基因组水平LOD阈值的QTL有62个,占QTL总数的46.6%;其它的QTL虽然没有达到基因组水平LOD阈值,但是其LOD值都大于或等于3。单标记分析法的结果表明这133个QTL的侧翼标记中有72个与性状显着相关(p≤0.1),占总数的54.1%。在遗传连锁图谱的12个连锁群上(LG1、LG2、LG3、LG5、LG7、LG9、LG10、LG14、LG15、LG18、LG20、LG22),分布有25个QTL聚集区域,每个QTL区域至少包含有两个不同叶片相关性状的QTL。这种QTL的聚集现象是基因组区域“一因多效”的体现,也有可能是QTL之间的连锁而形成。QTL在不同年份间存在不稳定表达的现象,这是基因时空表达、树木的成熟效应、环境影响等多种因素共同作用的结果。检测到3个控制绿原酸含量和芦丁含量的QTL区域在年份间表现稳定,连锁群LG1上的QTL区域包含Dca2-2、Dca3-2、Dru3-2、Dru4-1、Dru5-1;连锁群LG7上的QTL区域包含Dca3-3、Dru3-3、Dru4-2、Dru5-2;连锁群LG9上的QTL区域包含Dca2-3、Dca4-1、Dca5-1、Dru2-3、Dru3-5。在连锁群LG1上检测到1个控制杜仲胶含量的QTL区域在年份间表现稳定,该QTL区域包含Deur2-1、Deur3-1、Deur4-1、Deur5-1。5.以5×5析因交配设计获得的24个杜仲F1家系为材料,估算了苗高和地径性状的家系平均值、变异系数、配合力等遗传参数,利用SRAP、AFLP、ISSR叁种分子标记技术估计了10个杂交亲本之间的遗传距离,分析了杜仲亲本分子标记遗传距离与杂交子代生长性状的表现、家系变异系数、特殊配合力之间的相关性。结果表明,SRAP分子标记遗传距离、基于叁种分子标记的遗传距离与杂交子代苗高生长表现之间存在显着的线性关系。这对于杜仲杂交育种的亲本选配及杂交子代生长表现的早期预测具有一定的指导意义,如果以高生长作为育种目标,要尽量选择遗传距离较大的亲本进行人工杂交。亲本分子标记遗传距离与杂交子代家系变异系数、特殊配合力之间的相关性均没有达到显着水平,这表明利用亲本分子标记遗传距离来预测生长性状的特殊配合力和家系变异大小具有一定的局限性。对于其它杜仲重要经济性状,还是应该通过检测与QTL紧密连锁的分子标记,并进一步利用分子标记辅助选择的途径来进行早期选择。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2015-05-01）
分子标记连锁图谱论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4～179.0cM,覆盖基因组总长度1 912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
分子标记连锁图谱论文参考文献
[1].吕百川,苏其红,辛筱筱,孙娟,刘小雪.小麦ILs群体SSR分子标记遗传连锁图谱构建[J].甘肃农业大学学报.2019
[2].李佳奇,于卓,杨东升,于肖夏,吴国芳.基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建[J].西北植物学报.2019
[3].杨东升,于卓,于肖夏,李晓宇,吴国芳.四倍体杂交冰草SRAP和SSR分子标记遗传连锁图谱构建[J].麦类作物学报.2018
[4].权彪.分子标记在绿豆遗传连锁图谱构建和基因定位研究中的作用[J].科技风.2018
[5].姜志艳,于肖夏,于卓,张志成,石悦.利用SSR分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱[J].草业学报.2016
[6].王晓萃.分子标记技术及其在林木遗传连锁图谱构建中的应用[J].北京农业.2016
[7].林范学,李宏盛,黄杰,谭琦,鲍大鹏.运用SNP分子标记构建香菇遗传连锁图谱及分析QTL[C].中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集.2015
[8].王婷婷.向日葵SSR分子标记遗传连锁图谱的构建与QTL定位研究[D].内蒙古农业大学.2015
[9].梁小玉,季杨,白史且,黄琳凯,张新全.基于SRAP分子标记构建的菊苣遗传连锁图谱[J].草业学报.2015
[10].李煜.杜仲高密度遗传连锁图谱构建与重要数量性状的分子标记[D].西北农林科技大学.2015