金亮:松萝凤梨转录组测序分析论文

金亮:松萝凤梨转录组测序分析论文

本文主要研究内容

作者金亮,田丹青,詹书侠,安霞,葛亚英,王炜勇(2019)在《松萝凤梨转录组测序分析》一文中研究指出:松萝凤梨(Tillandsia usneoides)是空气凤梨的一种,可以"生长在空气中",主要通过叶片吸收水分和养分。为探讨松萝凤梨叶片功能的遗传基础,本研究采用高通量测序技术对其叶片进行转录组测序。总计获得了62 779条单基因簇(Unigene)。对所得Unigenes进行不同数据库注释,其中34 419条Unigenes在数据库中有注释,占总Unigenes数目的 54.82%。在Nr、Nt和SwissProt数据库中,分别有7条、10条、13条Unigenes与根相关;GO数据库注释显示25 695条Unigenes分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类55个功能组,其中与根相关Unigenes达到48条;KOG数据库中注释到的13 205条Unigenes功能系统分为26类;KEGG代谢通路分析表明,5 574个Unigenes涉及250条通路,其中34条Unigenes涉及景天酸代谢(CAM)途径。本研究结果为松萝凤梨分子生物学方面研究提供了一定的基础及参考。

Abstract

song luo feng li (Tillandsia usneoides)shi kong qi feng li de yi chong ,ke yi "sheng chang zai kong qi zhong ",zhu yao tong guo xie pian xi shou shui fen he yang fen 。wei tan tao song luo feng li xie pian gong neng de wei chuan ji chu ,ben yan jiu cai yong gao tong liang ce xu ji shu dui ji xie pian jin hang zhuai lu zu ce xu 。zong ji huo de le 62 779tiao chan ji yin cu (Unigene)。dui suo de Unigenesjin hang bu tong shu ju ku zhu shi ,ji zhong 34 419tiao Unigeneszai shu ju ku zhong you zhu shi ,zhan zong Unigenesshu mu de 54.82%。zai Nr、Nthe SwissProtshu ju ku zhong ,fen bie you 7tiao 、10tiao 、13tiao Unigenesyu gen xiang guan ;GOshu ju ku zhu shi xian shi 25 695tiao Unigenesfen wei xi bao zu fen 、fen zi gong neng ji sheng wu xue guo cheng deng 3da lei 55ge gong neng zu ,ji zhong yu gen xiang guan Unigenesda dao 48tiao ;KOGshu ju ku zhong zhu shi dao de 13 205tiao Unigenesgong neng ji tong fen wei 26lei ;KEGGdai xie tong lu fen xi biao ming ,5 574ge Unigenesshe ji 250tiao tong lu ,ji zhong 34tiao Unigenesshe ji jing tian suan dai xie (CAM)tu jing 。ben yan jiu jie guo wei song luo feng li fen zi sheng wu xue fang mian yan jiu di gong le yi ding de ji chu ji can kao 。

论文参考文献

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  • [2].不同浓度氮肥对松萝凤梨生长的影响[J]. 丁久玲,郑凯,俞禄生.  安徽农业科学.2008(26)
  • [3].松萝凤梨转录组基因内部单核苷酸多态性信息分析[J]. 金亮,李小白,田丹青,史小华,葛亚英,王炜勇.  分子植物育种.2017(07)
  • [4].养花门诊[J]. 张鲁归.  园林.2005(12)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自分子植物育种的金亮,田丹青,詹书侠,安霞,葛亚英,王炜勇,发表于刊物分子植物育种2019年11期论文,是一篇关于松萝凤梨论文,转录组论文,测序论文,基因分析论文,功能注释论文,分子植物育种2019年11期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自分子植物育种2019年11期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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